二代測(cè)序——轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的應(yīng)用領(lǐng)域
1、基礎(chǔ)生物學(xué)研究:可以用于研究生物的發(fā)育過程。例如,在胚胎發(fā)育過程中,通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以了解不同階段胚胎細(xì)胞中基因的表達(dá)變化,揭示胚胎發(fā)育的分子機(jī)制。還可以用于物種進(jìn)化研究,比較不同物種間轉(zhuǎn)錄組的差異,推斷基因表達(dá)的進(jìn)化模式。
2、醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷:在疾病研究方面,用于尋找疾病相關(guān)的生物標(biāo)志物。例如,在**研究中,通過對(duì)比**組織和正常組織的轉(zhuǎn)錄組,可以發(fā)現(xiàn)一些在**中特異性高表達(dá)或低表達(dá)的基因,這些基因有望成為**診斷、預(yù)后判斷的標(biāo)志物。同時(shí),也可以用于藥物研發(fā),通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序了解藥物作用后細(xì)胞基因表達(dá)的變化,評(píng)估藥物療效和毒性。
3、農(nóng)業(yè)和植物學(xué)研究:在作物育種中,可以研究不同品種作物在抗逆性(如抗旱、抗寒、抗病)等方面的基因表達(dá)差異,為培育優(yōu)良品種提供理論依據(jù)。在植物生長(zhǎng)發(fā)育研究中,分析植物在不同生長(zhǎng)環(huán)境和生長(zhǎng)階段的轉(zhuǎn)錄組變化,了解植物***等因素對(duì)植物生長(zhǎng)的調(diào)控機(jī)制。 二代測(cè)序的優(yōu)勢(shì)是高通量。新疆嘉安健達(dá)二代測(cè)序技術(shù)
二代測(cè)序的建庫(kù)步驟⑥
六、文庫(kù)質(zhì)量檢測(cè)
定量檢測(cè):使用熒光定量PCR(qPCR)或其他核酸定量方法(如Qubit)來確定文庫(kù)的濃度。Qubit是一種基于熒光染料與核酸特異性結(jié)合的定量方法,它可以準(zhǔn)確地測(cè)量DNA或RNA的濃度,并且對(duì)不同大小的核酸片段有較好的定量準(zhǔn)確性。通過定量檢測(cè),可以了解文庫(kù)的產(chǎn)量,為后續(xù)的測(cè)序上樣量提供參考。
片段大小檢測(cè):利用瓊脂糖凝膠電泳或生物分析儀(如Agilent2100Bioanalyzer)來檢測(cè)文庫(kù)片段大小。瓊脂糖凝膠電泳是一種傳統(tǒng)的方法,通過將文庫(kù)樣品在瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,根據(jù)DNA片段在電場(chǎng)中的遷移速度來判斷片段大小。生物分析儀則可以提供更精確的片段大小分布和濃度信息,它是基于微流體芯片技術(shù),能夠快速、準(zhǔn)確地分析文庫(kù)質(zhì)量。 吉林哪里有二代測(cè)序公司二代測(cè)序可以檢測(cè)基因嗎?
二代測(cè)序技術(shù)的一些***研究進(jìn)展①
疾病診斷與***領(lǐng)域 :消化系統(tǒng)**標(biāo)志物檢測(cè):2024 年的**共識(shí)指出,二代測(cè)序(NGS)技術(shù)可同時(shí)檢測(cè)消化系統(tǒng)**中的多種標(biāo)志物,如錯(cuò)配修復(fù)基因變異、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)狀態(tài)、**突變負(fù)荷(TMB)等,為**的精細(xì)***提供了更***、準(zhǔn)確的信息。例如,MSI-H 的實(shí)體瘤患者可使用帕博利珠單抗進(jìn)行***,而 NGS 技術(shù)能更好地檢測(cè) MSI 狀態(tài)及相關(guān)耐藥機(jī)制。
**液體活檢:通過檢測(cè)血液中的循環(huán)** DNA(ctDNA)等標(biāo)志物,實(shí)現(xiàn)對(duì)**的早期篩查、診斷和***監(jiān)測(cè)。NGS 技術(shù)能夠更敏感地檢測(cè)到 ctDNA 中的基因突變和變異,為**的無創(chuàng)診斷提供了有力支持。
二代測(cè)序—全外顯子測(cè)序的原理是什么?
全外顯子測(cè)序主要是利用序列捕獲技術(shù),將基因組 DNA 中的外顯子區(qū)域富集起來,然后通過高通量測(cè)序技術(shù)(如第二代測(cè)序技術(shù) Illumina 測(cè)序平臺(tái))對(duì)富集后的外顯子 DN**段進(jìn)行測(cè)序。其大致步驟包括 DNA 提取、片段化、文庫(kù)構(gòu)建、外顯子捕獲、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析等。例如,在文庫(kù)構(gòu)建過程中,將提取的基因組 DN**段化后,在片段兩端連接上特定的接頭序列,這些接頭序列可以用于后續(xù)的擴(kuò)增和測(cè)序反應(yīng)。然后通過與外顯子區(qū)域互補(bǔ)的寡核苷酸探針,將外顯子片段從全基因組 DNA 文庫(kù)中 “捕獲” 出來,經(jīng)過清洗去除未結(jié)合的 DN**段后,對(duì)捕獲的外顯子文庫(kù)進(jìn)行大規(guī)模的平行測(cè)序。 二代測(cè)序與Sanger測(cè)序相同嗎?
二代測(cè)序——技術(shù)原理類問題
二代測(cè)序與一代測(cè)序的區(qū)別是什么:一代測(cè)序技術(shù)如Sanger測(cè)序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準(zhǔn)確性高,適用于對(duì)少量基因片段的精確測(cè)序。而二代測(cè)序技術(shù)具有高通量、速度快、成本低等優(yōu)點(diǎn),可以同時(shí)對(duì)大量DNA分子進(jìn)行測(cè)序,但在單個(gè)堿基的準(zhǔn)確性上稍低于一代測(cè)序,二者在不同的應(yīng)用場(chǎng)景中各有優(yōu)勢(shì)。二代測(cè)序有哪些主要的測(cè)序原理:主要包括邊合成邊測(cè)序和連接法測(cè)序。邊合成邊測(cè)序是在DNA聚合酶的作用下,逐個(gè)添加帶有熒光標(biāo)記的dNTP,通過檢測(cè)釋放的熒光信號(hào)來確定堿基序列;連接法測(cè)序則是利用DNA連接酶將寡核苷酸探針連接到模板DNA上,根據(jù)連接的探針序列來推斷模板DNA的堿基組成。 二代測(cè)序需要多久才能完成?重慶二代測(cè)序原理
二代測(cè)序產(chǎn)出的數(shù)據(jù)量有多少?新疆嘉安健達(dá)二代測(cè)序技術(shù)
③二代測(cè)序一般多久出結(jié)果?
3、測(cè)序深度和覆蓋度要求
測(cè)序深度是指每個(gè)堿基被測(cè)序的平均次數(shù),覆蓋度是指測(cè)序獲得的堿基占整個(gè)基因組(或目標(biāo)區(qū)域)的比例。如果要求高測(cè)序深度和高覆蓋度,比如進(jìn)行**全基因組的深度測(cè)序(測(cè)序深度可能達(dá)到100X甚至更高),需要更長(zhǎng)的測(cè)序時(shí)間來獲取足夠的數(shù)據(jù),并且后續(xù)的數(shù)據(jù)處理和分析也會(huì)更復(fù)雜。而對(duì)于一些簡(jiǎn)單的基因篩查項(xiàng)目,測(cè)序深度要求較低(如10X-20X),相應(yīng)的測(cè)序和分析時(shí)間會(huì)縮短。例如,低深度全外顯子測(cè)序用于篩查常見突變,測(cè)序可能在3-5天完成;而高深度的全外顯子測(cè)序用于檢測(cè)低頻體細(xì)胞突變,可能需要7-10天甚至更久。 新疆嘉安健達(dá)二代測(cè)序技術(shù)