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來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-12-21

二代測(cè)序—全外顯子測(cè)序的優(yōu)勢(shì)

針對(duì)性強(qiáng):它主要聚焦于基因組中編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域,這部分區(qū)域雖然只占整個(gè)基因組的 1 - 2% 左右,但包含了大部分與疾病相關(guān)的突變。例如,在研究孟德?tīng)栠z傳病時(shí),很多致病突變都位于外顯子區(qū)域,通過(guò)全外顯子測(cè)序可以更高效地找到這些突變。

成本效益高:相比于全基因組測(cè)序,全外顯子測(cè)序的成本相對(duì)較低。因?yàn)樗恍枰獙?duì)整個(gè)基因組(包括大量的非編碼區(qū)域)進(jìn)行測(cè)序,在一定程度上減少了數(shù)據(jù)量和測(cè)序成本,同時(shí)又能獲取大部分有重要功能意義的遺傳信息。 二代測(cè)序的流程有哪些?廣西哪里有二代測(cè)序價(jià)格

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二代測(cè)序技術(shù)的一些***研究進(jìn)展①

疾病診斷與***領(lǐng)域 :消化系統(tǒng)**標(biāo)志物檢測(cè):2024 年的**共識(shí)指出,二代測(cè)序(NGS)技術(shù)可同時(shí)檢測(cè)消化系統(tǒng)**中的多種標(biāo)志物,如錯(cuò)配修復(fù)基因變異、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)狀態(tài)、**突變負(fù)荷(TMB)等,為**的精細(xì)***提供了更***、準(zhǔn)確的信息。例如,MSI-H 的實(shí)體瘤患者可使用帕博利珠單抗進(jìn)行***,而 NGS 技術(shù)能更好地檢測(cè) MSI 狀態(tài)及相關(guān)耐藥機(jī)制。

**液體活檢:通過(guò)檢測(cè)血液中的循環(huán)** DNA(ctDNA)等標(biāo)志物,實(shí)現(xiàn)對(duì)**的早期篩查、診斷和***監(jiān)測(cè)。NGS 技術(shù)能夠更敏感地檢測(cè)到 ctDNA 中的基因突變和變異,為**的無(wú)創(chuàng)診斷提供了有力支持。


寧夏二代測(cè)序提供二代測(cè)序?qū)嶒?yàn)與測(cè)序原理是什么?

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二代測(cè)序的建庫(kù)步驟⑥

六、文庫(kù)質(zhì)量檢測(cè)

定量檢測(cè):使用熒光定量PCR(qPCR)或其他核酸定量方法(如Qubit)來(lái)確定文庫(kù)的濃度。Qubit是一種基于熒光染料與核酸特異性結(jié)合的定量方法,它可以準(zhǔn)確地測(cè)量DNA或RNA的濃度,并且對(duì)不同大小的核酸片段有較好的定量準(zhǔn)確性。通過(guò)定量檢測(cè),可以了解文庫(kù)的產(chǎn)量,為后續(xù)的測(cè)序上樣量提供參考。

片段大小檢測(cè):利用瓊脂糖凝膠電泳或生物分析儀(如Agilent2100Bioanalyzer)來(lái)檢測(cè)文庫(kù)片段大小。瓊脂糖凝膠電泳是一種傳統(tǒng)的方法,通過(guò)將文庫(kù)樣品在瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,根據(jù)DNA片段在電場(chǎng)中的遷移速度來(lái)判斷片段大小。生物分析儀則可以提供更精確的片段大小分布和濃度信息,它是基于微流體芯片技術(shù),能夠快速、準(zhǔn)確地分析文庫(kù)質(zhì)量。

一代、二代、三代測(cè)序的區(qū)別分別是什么?

一代測(cè)序是上世紀(jì)70年代由Sanger和Coulson開(kāi)創(chuàng)的DNA雙脫氧鏈終止法測(cè)序,也稱為Sanger測(cè)序。

二代測(cè)序技術(shù)(NGS)是為了改進(jìn)一代測(cè)序通量過(guò)低的問(wèn)題而出現(xiàn)的,能夠同時(shí)對(duì)上百萬(wàn)甚至數(shù)十億個(gè)DNA分子進(jìn)行測(cè)序?qū)崿F(xiàn)了大規(guī)模、高通量測(cè)序的目標(biāo)。

三代測(cè)序主要有兩種技術(shù)PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore 的納米孔單分子測(cè)序技術(shù),這兩種技術(shù)的測(cè)序讀長(zhǎng)都可以達(dá)到幾-kb的級(jí)別,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于二代測(cè)序技術(shù)。 擴(kuò)增子測(cè)序是二代測(cè)序嗎?

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一代、二代、三代測(cè)序的技術(shù)原理和技術(shù)特點(diǎn)分別是什么?

技術(shù)原理:

一代—雙脫氧終止法

二代—橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像

三代—PacBio SMRT測(cè)序技術(shù)

技術(shù)特點(diǎn):

一代—只能檢測(cè)序列一致的PCR產(chǎn)物;讀長(zhǎng)可以較長(zhǎng),比如Sanger可以達(dá)到幾百bp;通量低,一次只能檢測(cè)少量的序列;成本低;

二代—可以并行測(cè)序;需要放大信號(hào)才能檢測(cè);通量大,可以產(chǎn)生上G的reads;讀長(zhǎng)較短,一-般是固定的,比如50、100、150、250等;成本較高

三代:可以并行測(cè)序;不需要放大信號(hào),對(duì)單個(gè)分子進(jìn)行測(cè)序;通量大,比如SequelII平臺(tái),一張芯片可以有800萬(wàn)個(gè)ZMW;讀長(zhǎng)較長(zhǎng);測(cè)序精確度較差;成本高; 什么是二代測(cè)序技術(shù)?青海哪里有二代測(cè)序檢測(cè)

二代測(cè)序廣泛應(yīng)用于個(gè)性化醫(yī)學(xué)。廣西哪里有二代測(cè)序價(jià)格

二代測(cè)序——基因組測(cè)序該測(cè)幾個(gè)G?③

基因組測(cè)序所需的測(cè)序量通常用數(shù)據(jù)量來(lái)衡量,一般以 G 為單位,不同的測(cè)序目的和基因組類型所需要的測(cè)序量有所不同。

微生物基因組測(cè)序細(xì)菌基因組:

細(xì)菌基因組

相對(duì)較小,一般在1M-10M之間,測(cè)序深度通常在50X-100X左右,數(shù)據(jù)量在0.05G-1G左右即可滿足基本的基因組組裝和變異檢測(cè)需求。

***基因組:***基因組大小差異較大,從幾M到上百M(fèi)都有。對(duì)于較小的***基因組,測(cè)序深度在30X-50X左右,數(shù)據(jù)量在0.1G-5G之間;而對(duì)于較大的***基因組,可能需要適當(dāng)降低測(cè)序深度至10X-20X,數(shù)據(jù)量在1G-20G左右。 廣西哪里有二代測(cè)序價(jià)格

標(biāo)簽: 二代測(cè)序