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黑龍江嘉安健達(dá)二代測(cè)序應(yīng)用

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-12-21

關(guān)于二代測(cè)序的簡(jiǎn)介:

二代測(cè)序技術(shù)(Next-Generation Seguencing,NGS)也稱為高通量測(cè)序技術(shù),是一種能夠同時(shí)對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億個(gè) DNA片段進(jìn)行測(cè)序的方法。與傳統(tǒng)的桑格測(cè)序相比二代測(cè)序技術(shù)具有高通量、高準(zhǔn)確性、高靈敏度和低成本等優(yōu)勢(shì)。

二代測(cè)序技術(shù)在大幅提高了測(cè)序速度的同時(shí),大幅度的降低了測(cè)序成本,保持了高準(zhǔn)確性,以前完成一個(gè)人類基因組的測(cè)序需要3年時(shí)間,而使用二代測(cè)序技術(shù)則需要1周,但其序列讀長(zhǎng)方面比起一代測(cè)序技術(shù)則要短很多,大多只100bp-150bp。


擴(kuò)增子測(cè)序是二代測(cè)序嗎?黑龍江嘉安健達(dá)二代測(cè)序應(yīng)用

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二代測(cè)序的優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)分別有哪些?

優(yōu)勢(shì):能夠同時(shí)得到大量的序列數(shù)據(jù),相比于一代測(cè)序技術(shù),通量提高了成千上萬(wàn)倍;單條序列成本非常低廉。

劣勢(shì):序列讀長(zhǎng)較短,Illumina平臺(tái)為250-300bp,454平臺(tái)也只有500bp左右;由于建庫(kù)中利用了PCR富集序列,因此有一些含量較少的序列可能無(wú)法被大量擴(kuò)增,造成一些信息的丟失,且PCR過(guò)程中有一定概率會(huì)引入錯(cuò)配堿基。想要得到準(zhǔn)確和長(zhǎng)度較長(zhǎng)的拼接結(jié)果,需要測(cè)序的覆蓋率較高導(dǎo)致結(jié)果錯(cuò)誤較多和成本增加。 廣東哪里有二代測(cè)序二代測(cè)序的優(yōu)勢(shì)是高通量。

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什么樣本可以做二代測(cè)序?③

細(xì)胞樣本

培養(yǎng)細(xì)胞:包括各種原代培養(yǎng)細(xì)胞和細(xì)胞系。在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究中,對(duì)培養(yǎng)的細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序可以了解細(xì)胞的基因特征和功能變化。例如,在研究細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路時(shí),對(duì)經(jīng)過(guò)特定刺激處理的培養(yǎng)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,以分析基因表達(dá)的上調(diào)或下調(diào)情況。

脫落細(xì)胞:如痰液中的脫落細(xì)胞、尿液中的脫落細(xì)胞等。這些細(xì)胞可以用于某些疾病的篩查。例如,在肺*篩查中,對(duì)痰液中的脫落細(xì)胞進(jìn)行基因檢測(cè),通過(guò)二代測(cè)序?qū)ふ曳?相關(guān)的基因突變,作為一種非侵入性的檢測(cè)方法。

二代測(cè)序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異②

遺傳病患者及攜帶者

優(yōu)勢(shì):在常見(jiàn)單基因遺傳病如囊性纖維化、鐮狀細(xì)胞貧血等的檢測(cè)中,二代測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確性高,能夠快速、準(zhǔn)確地找到致病基因,對(duì)于有家族遺傳病史的人群,可有效確定是否攜帶致病基因,評(píng)估生育患病后代的風(fēng)險(xiǎn)。

局限性:對(duì)于罕見(jiàn)遺傳病,由于基因突變的多樣性和復(fù)雜性,可能存在部分致病基因未被覆蓋或難以準(zhǔn)確解讀的情況,導(dǎo)致準(zhǔn)確性有所降低。此外,即使檢測(cè)結(jié)果為陰性,也不能完全排除患病可能,因部分遺傳病可能由未知基因突變或基因與環(huán)境相互作用引起2 一代和二代測(cè)序的區(qū)別?

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②二代測(cè)序一般多久出結(jié)果?

2、測(cè)序平臺(tái)和通量

不同的二代測(cè)序平臺(tái)有不同的通量(一次能測(cè)序的樣本數(shù)量和數(shù)據(jù)量)和測(cè)序速度。一些高通量的測(cè)序平臺(tái),如IlluminaNovaSeq系列,能夠在較短時(shí)間內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù)。但如果使用的是通量較低的小型測(cè)序儀,或者測(cè)序儀的運(yùn)行時(shí)間被多個(gè)項(xiàng)目分配,都會(huì)影響結(jié)果產(chǎn)出的時(shí)間。例如,在高通量平臺(tái)上進(jìn)行全基因組測(cè)序,測(cè)序運(yùn)行時(shí)間可能在2-7天左右,具體取決于測(cè)序深度等因素。而對(duì)于一些小型臺(tái)式測(cè)序儀進(jìn)行靶向基因測(cè)序,運(yùn)行時(shí)間可能在1-3天。 二代測(cè)序的流程有哪些?靜安區(qū)哪里有二代測(cè)序流程

二代測(cè)序是為了改進(jìn)一代測(cè)序通量過(guò)低的問(wèn)題而出現(xiàn)的。黑龍江嘉安健達(dá)二代測(cè)序應(yīng)用

什么樣本可以做二代測(cè)序?①

1、血液樣本

全血:這是最常見(jiàn)的樣本類型之一。血液中含有白細(xì)胞,其細(xì)胞核內(nèi)有完整的基因組DNA。通過(guò)提取白細(xì)胞中的DNA,可以進(jìn)行全基因組測(cè)序、全外顯子組測(cè)序等。例如,在遺傳病的基因診斷中,抽取患者的全血,提取DNA后,對(duì)與疾病相關(guān)的基因或整個(gè)外顯子組進(jìn)行測(cè)序,以尋找致病突變。

血漿/血清:其中含有游離的DNA(cfDNA)和RNA(cfRNA)。在**患者中,腫瘤細(xì)胞會(huì)釋放其DNA片段進(jìn)入血液循環(huán),這些cfDNA被稱為循環(huán)**DNA(ctDNA)。通過(guò)對(duì)血漿中的ctDNA進(jìn)行測(cè)序,可以實(shí)現(xiàn)**的早期篩查、***過(guò)程中的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)等。例如,對(duì)于肺*患者,檢測(cè)血漿中的ctDNA來(lái)追蹤**的基因突變情況,為靶向***提供依據(jù)。 黑龍江嘉安健達(dá)二代測(cè)序應(yīng)用

標(biāo)簽: 二代測(cè)序