長片段PCR通常指擴增大于5kb的DNA的片段。長片段PCR傳統(tǒng)上使用TaqDNA聚合酶(為了快速延伸)和高保真酶(為了準(zhǔn)確度)的混合物。隨著高合成能力、高保真DNA聚合酶的發(fā)明,長片段PCR現(xiàn)在可在短時間內(nèi)高準(zhǔn)確性的完成。通過與一個強DNA結(jié)合蛋白的結(jié)合,聚合酶可獲得高擴增能力,可在短時間內(nèi)擴增長片段(如>20kbgDNA的片段)。初次之外,極高保真度(如>100xTaq)可確保長片段擴增的低錯誤率。當(dāng)擴增>10kb的片段時,PCR實驗方案可能需要在以下5個關(guān)鍵位置進行適當(dāng)優(yōu)化:確保使用高質(zhì)量、高純度的DNA樣本。如果DNA聚合酶的熱穩(wěn)定較低,使用更多量的DNA聚合酶以彌補多次循環(huán)中的聚合酶活性損失。降低退火和延伸步驟的溫度,以助于引物結(jié)合。適當(dāng)增加PCR步驟的時間,以促進模板DNA的完全分離及引物的結(jié)合。適當(dāng)增加PCR延伸時間確保目的片段的全長擴增。熒光定量PCR檢測原理是什么?新疆pcr外包
PCR實驗技術(shù)中的5’RACE-PCR介紹:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作為一個引物結(jié)合位點,以O(shè)ligo(dT)30MN作為鎖定引物在反轉(zhuǎn)錄酶MMLV作用下,反轉(zhuǎn)錄合成標(biāo)準(zhǔn)一號鏈cDNA.利用該反轉(zhuǎn)錄酶具有的末端轉(zhuǎn)移酶活性,在反轉(zhuǎn)錄達到一號鏈的5‘末端時自動加上3一5個(dC)殘基,退火后(dC)殘基與含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接頭引物配對后,轉(zhuǎn)換為以SMART序列為模板繼續(xù)延伸而連上通用接頭(figure2)。然后用一個含有部分接頭序列的通用引物UPM(universalprimer,UPM)作為上游引物,用一個基因特異引物2(GSP2genespecificprimer,GSP)作為下游引物,以SMART一號鏈cDNA為模板,進行PCR循環(huán),把目的基因5‘末端的cDNA的片段擴增出來。比較終,從2個有相互重疊序列的3'/5‘-RACE產(chǎn)物中獲得全長cDNA,或者通過分析RACE產(chǎn)物的3‘和5‘端序列,合成相應(yīng)引物擴增出全長cDNA.常見pcr是什么意思pcr檢測的價格是多少?
PCR實驗技術(shù)中的免疫-PCR(immuno-PCR)介紹:免疫-PCR(immuno-PCR)是新近建立的一種靈敏、特異的抗原檢測系統(tǒng)。它利用抗原-抗體反應(yīng)的特異性和PCR擴增反應(yīng)的極高靈敏性來檢測抗原,尤其適用于極微量抗原的檢測。免疫-PCR試驗的主要步驟有三個:①抗原-抗體反應(yīng),②與嵌合連接分子結(jié)合,③PCR擴增嵌合連接分子中的DNA(一般為質(zhì)粒DNA)。該技術(shù)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)是嵌合連接分子的制備。在免疫-PCR中,嵌合連接分子起著橋梁作用,它有兩個結(jié)合位點,一個與抗原抗體復(fù)合物中的抗體結(jié)合,一個與質(zhì)粒DNA結(jié)合,其基本原理與ELISA和免疫酶染色相似,不同之處在于其中的標(biāo)記物不是酶而是質(zhì)粒DNA,在操作反應(yīng)中形成抗原抗體-連接分子-DNA復(fù)合物,通過PCR擴增DNA來判斷是否存在特異性抗原。免疫PCR優(yōu)點為:①特異性較強,因為它建立在抗原抗體特異性反應(yīng)的基礎(chǔ)上。②敏感度高,PCR具有驚人的擴增能力,免疫PCR比ELISA敏感度高105倍以上,可用于單個抗原的檢測。③操作簡便,PCR擴增質(zhì)粒DNA比擴增靶基因容易得多,一般實驗室均能進行。
PCR的臨床應(yīng)用主要用于針對疾病遺傳病等。PCR在醫(yī)學(xué)檢驗學(xué)中**有價值的應(yīng)用領(lǐng)域就是對疾病的診斷。理論上,只要樣本有一個病原體存在,PCR就可以檢測到。一般實驗室也能檢出10~100基因拷貝,而目前病原體抗原檢測方法一般需要105-7個病原體才可檢測到。PCR對病原體的檢測解決了免疫學(xué)檢測的“窗口期”問題,可判斷疾病是否處于隱性或亞臨床狀態(tài)。定量PCR研究資料已表明,病原體數(shù)量與疾病病情的輕重程度、傳染性及針對效果均有相關(guān)性。許多研究表明,人類免疫缺陷病毒(HIV)后,潛伏期長短和臨床癥狀輕重與血液中的病毒量相關(guān);也有研究表明,HIV病毒載量低于一定值時,沒有傳染性。在乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒定量研究中發(fā)現(xiàn),病毒的數(shù)量與某些藥物的療效相關(guān)。例如,干擾素針對對肝炎病毒高拷貝者不敏感,低拷貝者敏感;而有些藥物則具有***降低病毒高拷貝的作用。推薦一些專業(yè)做pcr比較好的生物公司。
PCR實驗技術(shù)中的反向PCR(InversePCR)介紹:反向PCR起初設(shè)計用于確定臨近未知區(qū)域的序列。反向PCR有助于研究一個基因的啟動子序列;致*染色體重排如基因融合、異位或轉(zhuǎn)移;及病毒基因的整合。之所以稱為反向PCR,是因為引物設(shè)計用于向兩邊延伸而不像常規(guī)PCR中朝著彼此延伸。如今,反向PCR常用于定點突變,復(fù)制一個具有預(yù)期突變的目的質(zhì)粒。在研究基因組DNA未知序列的傳統(tǒng)實驗流程中,限制性內(nèi)切酶消化和連接先于反向PCR,接著對PCR擴增子進行測序。對于gDNA消化,需選擇一種限制性內(nèi)切酶進行酶切以獲得合適長度可自連的片段。同時,所選擇的內(nèi)切酶不應(yīng)該切割已知序列,所以連接發(fā)生于側(cè)翼的未知序列之間。使用低濃度的酶切DNA的片段以助于片段自連而非多個片段連接。片段自連完成后,通過反向PCR擴增DNA的位置區(qū)域。獲得的擴增子兩端包含一部分已知序列。之后通過測序以鑒定臨近已知序列的未知區(qū)域。pcr檢測做不好都有哪些原因?海南pcr多少錢
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PCR出現(xiàn)假陽性的原因分析。引物設(shè)計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設(shè)計引物。靶序列或擴增產(chǎn)物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一是整個基因組或大片段的交叉污染,導(dǎo)致假陽性。這種假陽性可用以下方法解決:①操作時應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣器內(nèi)或濺出離心管外。②除了酶及其他不耐高溫的物質(zhì)外,所有試劑或器材均應(yīng)高壓消毒。所用離心管均應(yīng)一次性使用。③必要時,在加標(biāo)本前,反應(yīng)管和試劑用紫外線照射,以破壞存在的核酸。二是空氣中的小片段核酸污染,這些小片段比靶序列短,但有一定的同源性??苫ハ嗥唇?,與引物互補后,可擴增出PCR產(chǎn)物,而導(dǎo)致假陽性的產(chǎn)生,可用巢式PCR方法來減輕或消除。新疆pcr外包
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