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外泌體表征方法

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-04-17

常規(guī)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)(RT-PCR)普遍用于microRNA的檢測(cè)實(shí)踐中,但外泌體樣品中的microRNA豐度極低,普通RT-PCR技術(shù)的靈敏度已經(jīng)不能夠滿足。第三代微滴式數(shù)字PCR——ddPCR技術(shù),成為外泌體microRNA檢測(cè)的選擇技術(shù)。微滴式數(shù)字PCR(DropletdigitalPCR),又成為“油包水PCR”,在傳統(tǒng)的PCR擴(kuò)增前對(duì)樣品進(jìn)行微滴化處理,即將含有核酸分子的反應(yīng)體系分成成千上萬個(gè)納升級(jí)的微滴,其中每個(gè)微滴或不含待檢核酸靶分子,或者含有一個(gè)至數(shù)個(gè)待檢核酸靶分子。經(jīng)PCR擴(kuò)增后,逐個(gè)對(duì)每個(gè)微滴進(jìn)行檢測(cè),有熒光信號(hào)的微滴判讀為1,沒有熒光信號(hào)的微滴判讀為0,根據(jù)泊松分布原理及陽性微滴的個(gè)數(shù)與比例即可得出靶分子的起始拷貝數(shù)或濃度。外泌體的膜蛋白有可能與細(xì)胞膜蛋白作用,活躍細(xì)胞內(nèi)通路。外泌體表征方法

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外泌體的臨床應(yīng)用:間充質(zhì)干細(xì)胞是目前較普遍使用的細(xì)胞類型,它具有自我更新,多向分化、分泌細(xì)胞因子和細(xì)胞外囊泡體、免疫調(diào)節(jié)、來源普遍等特點(diǎn),在流感病毒的臨床診療中取得了良好的成果。間充質(zhì)干細(xì)胞來源外泌體與間充質(zhì)干細(xì)胞有著相似的功能,包括修復(fù)與再生組織、阻止炎癥反應(yīng)及調(diào)節(jié)機(jī)體免疫,但外泌體相對(duì)于間充質(zhì)干細(xì)胞又有許多優(yōu)勢(shì)。首先,間充質(zhì)干細(xì)胞來源外泌體更穩(wěn)定,更好保存,易于管理和控制,可以人為改變其內(nèi)容物的種類和數(shù)量。其次,它們沒有活細(xì)胞,不會(huì)像間充質(zhì)干細(xì)胞那樣可能會(huì)過多增殖而放大療效或者病變導(dǎo)致疾病加重;另外,它有可能避免某些針對(duì)間充質(zhì)干細(xì)胞的調(diào)控問題,間充質(zhì)干細(xì)胞來源外泌體有代替間充質(zhì)干細(xì)胞的趨勢(shì)。外泌體的形成外泌體的提取的方式:過濾離心。

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外泌體的相關(guān)成分:1、外泌體的膜同細(xì)胞一樣,是磷脂雙分子層。2、外泌體膜含有MHC-1/2蛋白,能綁定特異性的肽鏈。3、外泌體膜中有跨膜蛋白PGRL、LAMP1、LAMP2。4、外泌體膜中有膜轉(zhuǎn)運(yùn)融合蛋白annexins、RAN、GTPases。5、外泌體膜上有脂質(zhì)筏Chol、ceramide、SM、PC,限制膜流動(dòng),參與包括跨膜信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、物質(zhì)內(nèi)吞、脂質(zhì)及蛋白定向分選的多種功能。6、外泌體中含有核酸,包括miRNA、DNA、lncRNA、mRNA;同時(shí)還有一些蛋白、脂類也能被包裹到外泌體中。7、與外泌體產(chǎn)生相關(guān)的重要分子:Ral、ARF6、PLD2、RAB家族。8、一些物質(zhì)進(jìn)行外泌體中是特異性的:如hnRNPA2B1能結(jié)合lncRNA或miRNA特異性的序列(GGAG/CCCU),進(jìn)行主動(dòng)包埋。外泌體的膜同細(xì)胞一樣,是磷脂雙分子層。

Exosome,中文名外泌體,是一種能被大多數(shù)細(xì)胞分泌的微小膜泡,具有脂質(zhì)雙層膜結(jié)構(gòu),直徑大約40-100nm。盡管外泌體較初在1983年就被發(fā)現(xiàn),但人們一直認(rèn)為它只是一種細(xì)胞的廢棄物。然而較近幾年,人們發(fā)現(xiàn)這種微小膜泡中含有細(xì)胞特異的蛋白、脂質(zhì)和核酸,能作為信號(hào)分子傳遞給其他細(xì)胞從而改變其他細(xì)胞的功能。這些發(fā)現(xiàn)點(diǎn)燃了人們對(duì)細(xì)胞分泌膜泡的興趣。2015年,隨著精確醫(yī)學(xué)概念的提出,越來越多的人開始關(guān)注如何能做到疾病的精確診斷和診療。外泌體作為一個(gè)新型的研究熱點(diǎn),由于它在體內(nèi)存在的普遍性和獲取的便捷性,已經(jīng)成為了疾病診斷診療的潛在有效方式,在精確醫(yī)學(xué)發(fā)展上有著光明的前景。外泌體是其中一類小囊泡,直徑為30~150nm,密度1.10~1.18g/ml。

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NTA技術(shù)已被作為外泌體表征手段之一,相較于其他表征方式NTA技術(shù)的樣本處理更簡(jiǎn)單、更能保證外泌體原始狀態(tài)、檢測(cè)速度更快。大致方法是:將分離的外泌體樣本注入納米顆粒追蹤分析儀,用激光光束穿過樣本,激光在腔室內(nèi)與顆粒相互作用時(shí)會(huì)發(fā)生散射,通過裝有攝像頭的顯微鏡收集散射光,捕捉外泌體的布朗運(yùn)動(dòng),實(shí)現(xiàn)顆粒可視化。然后使用Stokes-Einstein方程來測(cè)量粒子的平均速度,繼而估算粒子的大小。NTA能夠測(cè)量粒徑10-1000nm之間的顆粒,包含了外泌體50-150nm的徑粒范圍,但是NTA鑒定需要大于0.5毫升的樣品體積以及優(yōu)化的數(shù)據(jù)收集和分析參數(shù),另外,NTA比較難區(qū)分與外泌體具有相似布朗運(yùn)動(dòng)的蛋白質(zhì)聚集體,因此無法排除其他物質(zhì)干擾。外泌體產(chǎn)生相關(guān)的重要分子:Ral、ARF6、PLD2、RAB家族。血清外泌體circRNA測(cè)序

外泌體可通過其攜帶的蛋白質(zhì)、核酸、脂類等來調(diào)節(jié)受體細(xì)胞的生物學(xué)活性。外泌體表征方法

外泌體的提取分離方法:1、PEG-base沉淀法:聚乙二醇可與疏水性蛋白和脂質(zhì)分子結(jié)合共沉淀,早先應(yīng)用于從血清等樣本中收集病毒,現(xiàn)在也被用來沉淀外泌體,其原理可能與競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合游離水分子有關(guān)。利用PEG沉淀外泌體存在不少問題:比如純度和回收率低,雜蛋白較多(假陽性),顆粒大小不均一,產(chǎn)生難以去除的聚合物,機(jī)械力或者吐溫-20等化學(xué)添加物將會(huì)破壞外泌體等,因此發(fā)表文章時(shí)易受質(zhì)疑。2、試劑盒提取:近幾年來,市場(chǎng)上已出現(xiàn)各種商業(yè)化的外泌體提取試劑盒,有的是通過特殊設(shè)計(jì)的過濾器過濾掉雜質(zhì)成分,有的則采用空間排阻色譜法(SEC)進(jìn)行分離純化,也有的則利用化合物沉淀將法外泌體沉淀出來。外泌體表征方法

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