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海洋生物外泌體lncRNA芯片

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-11-10

雖然外泌體在疾病的診斷上有天然優(yōu)勢(shì),但在臨床應(yīng)用上仍有一些限制:外泌體的提取方法金標(biāo)準(zhǔn)仍然是差速離心法,但這種方法費(fèi)時(shí)費(fèi)力且提取效率較低,難以進(jìn)行臨床推廣和應(yīng)用;而商業(yè)化的試劑盒質(zhì)量參差不齊,往往導(dǎo)致提取物雜質(zhì)過(guò)多,且其售價(jià)較高。外泌體的定量是采用顆粒濃度定量,蛋白濃度定量,亦或是核酸濃度定量,目前仍存有爭(zhēng)議。由于傳統(tǒng)的內(nèi)參并不適用于外泌體,在實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)靶分子含量時(shí)內(nèi)參的選擇尚沒(méi)有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)。外泌體分子標(biāo)志物的研究還處于初級(jí)階段。目前外泌體研究的整個(gè)流程中成本都很高。從外泌體中篩選的生物標(biāo)志物,可用于疾病的診斷、預(yù)后及治理。海洋生物外泌體lncRNA芯片

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尺寸排除色譜法是使用聚合物凝膠或類似的固定相柱進(jìn)行外泌體分離的技術(shù),樣品以重力滴落的方式收集。流體力學(xué)半徑較小的樣品組分進(jìn)入凝膠孔隙后,需耗費(fèi)相對(duì)較長(zhǎng)的時(shí)間通過(guò)凝膠柱,導(dǎo)致延遲洗脫,實(shí)現(xiàn)不同粒徑大小顆粒分離。尺寸排除色譜法可以與差速離心法結(jié)合而不會(huì)明顯損失外泌體,保證產(chǎn)量的同時(shí)可有效去除雜質(zhì)蛋白,更適合目標(biāo)蛋白質(zhì)組學(xué)和miRNA的分析。靜水過(guò)濾透析法主要利用靜水壓力迫使樣品中不同特定大小分子先后通過(guò)透析管,其中溶劑和小溶質(zhì)很容易通過(guò)透析管,而較大的顆粒,如外泌體和其他囊泡,仍留在透析管中而被收集。江蘇干細(xì)胞外泌體不同肝臟疾病中,細(xì)胞分泌的外泌體所攜帶的核酸和蛋白組分之間存在差異。

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Vlassov等人發(fā)表的一篇外泌體的提取方法及組成的專利文獻(xiàn)中介紹,通過(guò)終濃度為8%的PEG6000與生物體液共孵育14h后,10000xg離心1h,可將直徑在30-150nm之間,且包含豐富RNA的外泌體沉淀下來(lái)。因此采用終濃度為8%的PEG6000沉淀血清中的外泌體,為了進(jìn)一步純化胎盤相關(guān)外泌體,將獲得的包含外泌體的沉淀用PBS重新懸浮后,加入非線性蔗糖密度梯度層,10000xg超速離心5h,將分層液采用PEG6000進(jìn)行2次沉淀。經(jīng)過(guò)多次實(shí)驗(yàn)反復(fù)驗(yàn)證,確定同時(shí)表達(dá)外泌體標(biāo)志蛋白分子及胎盤特異性蛋白分子的胎盤來(lái)源外泌體所在密度層。

外泌體mirRNA和蛋白質(zhì)被認(rèn)為是NSCLC的預(yù)后因子。Dejima等在研究NSCLC患者預(yù)后的生物標(biāo)志物時(shí)發(fā)現(xiàn),外泌體miR-4257和miR-21的含量顯著上升。此外,還有研究表明,低水平miR-146a-5p的NSCLC患者較高水平miR-146a-5p的NSCLC患者有更高的復(fù)發(fā)率。Sandfeld-Paulsen等在研究276例NSCLC患者血漿的外泌體時(shí)發(fā)現(xiàn),NY-ESO-1是單獨(dú)對(duì)低生存率有顯著影響的標(biāo)志物。Silva等利用TaqMan低密度芯片的方法系統(tǒng)分析了28位NSCLC患者體內(nèi)的365種miRNA,其中l(wèi)et-7f、miR-30e-3p和miR-20b表達(dá)均下調(diào),進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),let-7f和miR-30e-3p水平可以區(qū)分早期和晚期NSCLC患者,高水平let-7f和miR-30e-3p與不良預(yù)后密切相關(guān)。外泌體天然的可以攜帶遺傳到靶細(xì)胞中,從而在生物學(xué)和致病過(guò)程中誘導(dǎo)遺傳修飾。

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結(jié)果表明,PS親和法可以檢測(cè)到許多目前為止都無(wú)法檢測(cè)的外泌體蛋白質(zhì)和RNA。應(yīng)用Tim4的外泌體強(qiáng)結(jié)合能力,可用ELISA或FACS高靈敏度定性檢測(cè)、定量分析外泌體。以前無(wú)法用超速離心法提取的微囊泡,也通過(guò)運(yùn)用PS親和法實(shí)現(xiàn)高純度提取。本指導(dǎo)書中對(duì)該技術(shù)進(jìn)行詳細(xì)說(shuō)明,這項(xiàng)技術(shù)的有用性今后將受到世界各方評(píng)價(jià),有望在外泌體和微囊泡生理功能的分析研究上起重大貢獻(xiàn)。外泌體的檢測(cè)和提取還遇到一個(gè)困難即:對(duì)各種外泌體的分類。研究人員尚未統(tǒng)一定義以何種方法提取的細(xì)胞外囊泡可以稱之為外泌體,給實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的分析和重復(fù)性確認(rèn)帶來(lái)困難。近年,隨著國(guó)際細(xì)胞外囊泡協(xié)會(huì)的成立、世界性研究者研討會(huì)的舉辦,提案MISEV指南作為國(guó)際標(biāo)準(zhǔn),計(jì)劃或已經(jīng)開始進(jìn)行EV研究的科學(xué)家請(qǐng)務(wù)必閱讀這些方針。以前無(wú)法用超速離心法提取的微囊泡,也通過(guò)運(yùn)用PS親和法實(shí)現(xiàn)高純度提取。nk細(xì)胞外泌體

外泌體是內(nèi)源性和質(zhì)膜起源的不同類型的膜囊泡。海洋生物外泌體lncRNA芯片

隨著科學(xué)研究的不斷深入,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)外泌體是由通過(guò)細(xì)胞內(nèi)吞泡膜向內(nèi)凹陷形成多泡內(nèi)涵體,多泡內(nèi)涵體再與細(xì)胞膜融合后,釋放到細(xì)胞外基質(zhì)中的一種直徑約30~120nm的膜性囊泡。外泌體介導(dǎo)瘤細(xì)胞的化療抵抗。在瘤的治理過(guò)程中經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)藥物耐受的情況,這會(huì)導(dǎo)致化療失敗,在這和過(guò)程中外泌體以多種途徑參與了化療抵抗這一過(guò)程。通常,發(fā)生EMT過(guò)程的瘤細(xì)胞可獲得抵抗凋亡能力,而抵抗凋亡通常使瘤表現(xiàn)為化療抵抗。瘤細(xì)胞來(lái)源的外泌體能通過(guò)傳遞相關(guān)的組織因子(如VEGF、TGF2β)介導(dǎo)細(xì)胞發(fā)生EMT,從而增加瘤細(xì)胞的化療抵抗能力。海洋生物外泌體lncRNA芯片

標(biāo)簽: 外泌體提取試劑盒