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南京微流控芯片數(shù)字PCR

來源: 發(fā)布時間:2022-08-02

與常規(guī)的PCR的方法相比,dPCR有很好的優(yōu)勢。


***定量

常規(guī)PCR和實時熒光PCR定量檢測都需要已知拷貝數(shù)的標準DNA制定標準曲線,由于樣品測定在各種條件上不會完全一致,會造成PCR擴增效率的差異,從而影響定量結(jié)果的準確性。而ddPCR不受標準曲線和擴增動力學(xué)影響,可以進行***定量。


樣品需求量低

在檢測珍貴樣品和樣品核酸存在降解時具有明顯的優(yōu)勢。


高靈敏度

ddPCR本質(zhì)上是將一個傳統(tǒng)的PCR反應(yīng)分成了數(shù)萬個**的PCR反應(yīng),在這些反應(yīng)中可以精確地檢測到很小的目的片段的差異、單拷貝甚至是低濃度混雜樣品,且能避免非同源異質(zhì)雙鏈的形成。


高耐受性

由于目的序列被分配到多個微滴中,***降低了體系間的影響以及背景序列和***物對反應(yīng)的干擾,擴增基質(zhì)效應(yīng)大大減小。 具備一鍵式自動化操作。南京微流控芯片數(shù)字PCR

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**個體化診療

通過檢測T790M位點突變情況,可以更好地評估一代TKI***的療效及耐藥情況并指導(dǎo)第三代TKI靶向藥Osimertinib的使用。然而,由于qPCR平臺ARMS檢測技術(shù)的靈敏度有限,沒有辦法在含大量EGFR基因野生型背景核酸中高效準確的檢測到T790M突變。這個時候dPCR技術(shù)展現(xiàn)出了****的檢測精度,此外,dPCR***定量的優(yōu)勢也能充分發(fā)揮出來了,可以監(jiān)控突變含量變化,做到及早發(fā)現(xiàn)耐藥。

2.)基因表達分析

伊馬替尼(Imatinib)可以有效幫助很多慢性髓細胞白血?。–ML)患者延長生存期,但是臨床上發(fā)現(xiàn),伊馬替尼的療效與BCR-ABL1融合基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物表達量有很大的關(guān)系。研究人員采用dPCR對CML患者的BCR-ABL1融合基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物進行測定,結(jié)果檢測下限可以達到0.001%,顯示出dPCR在痕量核酸檢測方面比qPCR具有無可比擬的優(yōu)勢 常州數(shù)字PCR單細胞研究:測序、PCR。

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相對于二代測序、基因芯片和定量PCR而言,數(shù)字PCR具備以下優(yōu)勢:

● 靈敏度可達到單個核酸分子:檢測限低至0.001%,主要系為數(shù)字PCR可以實現(xiàn)靶標DNA/RNA的生物濃縮;

● 無需標準曲線活參照基因進行對比來測定核算量,可對靶分子起始量進行***定量,直接獨處DNA分子的個數(shù);

● 適合環(huán)境復(fù)雜樣品的檢測:終點PCR檢測,不依賴Ct值,不依賴擴增效率,能克服PCR***劑的影響,避免樣品間的交叉***問題,適合各類復(fù)雜環(huán)境中的樣本進行***定量,如動血樣、糞便、尿液、痰液、水樣、土壤、植物等;

要了解為什么傳統(tǒng)PCR存在限制,務(wù)必要了解PCR反應(yīng)過程中發(fā)生了什么?;綪CR運行可以分為三個階段:指數(shù)期每個循環(huán)積聚的產(chǎn)物準確加倍(假定**反應(yīng)效率)。該反應(yīng)具有高度特異性和精確度。出現(xiàn)指數(shù)式擴增,因為所有試劑均新鮮可用,反應(yīng)的動力學(xué)推動反應(yīng)有利于擴增子加倍。線性期(高變異性)隨著反應(yīng)繼續(xù),一些試劑因擴增而被消耗。反應(yīng)開始減緩,并且每個循環(huán)的PCR產(chǎn)物不再加倍。平臺期(終點:使用傳統(tǒng)方法進行凝膠檢測)反應(yīng)停止,不再產(chǎn)生更多產(chǎn)物,并且如果放置時間夠長,PCR產(chǎn)物將開始降解。因為每個樣品具有不同的反應(yīng)動力學(xué),所以每支試管或每個反應(yīng)將在不同的時間點進入平臺期。在平臺期可以看到這些差異。在平臺期內(nèi),傳統(tǒng)PCR進行測量,又稱為終點檢測。檢測數(shù)量一次可達96個樣品。

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       數(shù)字PCR采用的策略概括起來非常簡單,就是“分而治之”(divide and conquer)[1],這種做法非常類似于計算機科學(xué)中的“分治算法”,將一個標準PCR反應(yīng)分配到大量微小的反應(yīng)器中,在每個反應(yīng)器中包含或不包含一個或多個拷貝的目標分子( DNA模板) ,實現(xiàn)“單分子模板PCR擴增”,擴增結(jié)束后,通過陽性反應(yīng)器的數(shù)目“數(shù)出”目標序列的拷貝數(shù)。在實際的數(shù)字PCR實驗中,事實上是通過呈現(xiàn)兩種信號類型的反應(yīng)器比例和數(shù)目進行統(tǒng)計學(xué)分析,計算出原始樣本中的模板拷貝數(shù)。適用復(fù)雜樣品的檢測。無錫流式數(shù)字PCR哪家好

MiniDrop?研發(fā)團隊由微流控、光學(xué)、機電學(xué)、化學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)等多學(xué)科交叉領(lǐng)域的**組成。南京微流控芯片數(shù)字PCR

定量PCR和數(shù)字PCR的特點:


       5. 目前定量PCR已經(jīng)能實現(xiàn)高通量樣品條件下的自動化操作。   

       6. 數(shù)字PCR在單分子層面上的***定量,可以徹底擺脫對標準曲線的依賴而直接給出靶序列的拷貝數(shù),提高了實驗結(jié)果在批內(nèi)和批間的穩(wěn)定性,甚至能用來對標準品進行定標。   

       7. 基于***定量的方式,數(shù)字PCR結(jié)果的高重復(fù)性和高精度可實現(xiàn)微小差異的基因表達分析,如等位基因的不平衡表達、單細胞基因表達分析、microRNA表達分析等等。所謂“微小差異”的標準一般而言是指表達水平的差異在2倍以內(nèi)。   

       8. 同等條件下,數(shù)字PCR在靈敏度方面擁有優(yōu)勢,使得該技術(shù)已成為**的液態(tài)活檢、病原微生物檢測、轉(zhuǎn)基因成分測定、宿主殘留DNA分析等的熱門技術(shù)。


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