PCR產(chǎn)物是否為特異性擴(kuò)增,其結(jié)果是否準(zhǔn)確可靠,必須對其進(jìn)行嚴(yán)格的分析與鑒定,才能得出正確的結(jié)論。PCR產(chǎn)物的分析,可依據(jù)研究對象和目的不同而采用不同的分析方法。凝膠電泳分析:PCR產(chǎn)物電泳,EB溴乙錠染色紫外儀下觀察,初步判斷產(chǎn)物的特異性。PCR產(chǎn)物片段的大小應(yīng)與預(yù)計的一致,特別是多重PCR,應(yīng)用多對引物,其產(chǎn)物片斷都應(yīng)符合預(yù)訐的大小,這是起碼條件。瓊脂糖凝膠電泳:通常應(yīng)用1~2%的瓊脂糖凝膠,供檢測用。聚丙烯酰胺凝膠電泳:6~10%聚丙烯酰胺凝膠電泳分離效果比瓊脂糖好,條帶比較集中,可用于科研及檢測分析。酶切分析:根據(jù)PCR產(chǎn)物中限制性內(nèi)切酶的位點,用相應(yīng)的酶切、電泳分離后,獲得符合理論的...
PCR實驗技術(shù)中的巢氏PCR(NestedPCR)介紹:巢氏PCR需要兩到三對引物,一般采用較為套引物擴(kuò)增15-30個循環(huán),再用擴(kuò)增DNA的片段內(nèi)設(shè)定的第二套引物擴(kuò)增15-30個循環(huán),這樣可使待擴(kuò)增序列得到高效擴(kuò)增,而次級結(jié)構(gòu)卻很少擴(kuò)增。套式引物PCR減少了引物非特異性退火,從而增加了特異性擴(kuò)增,提高了擴(kuò)增效率。若將套失PCR的內(nèi)外引物稍加改變,延長外引物長度(25-30bp),同時縮短內(nèi)引物長度(15-17bp),使外引物先在高退火溫度下復(fù)性,做雙溫擴(kuò)增,然后改換至三溫循環(huán),使內(nèi)引物在外引物擴(kuò)增的基礎(chǔ)上,在低退火溫度復(fù)性,直到擴(kuò)增完成,這樣就可以使兩套引物一次同時加入。做pcr檢測,每個樣本...
PCR實驗室設(shè)計的中心問題是如何避免污染。在實際工作中,常見的有以下幾種污染類型:擴(kuò)增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標(biāo)本間的污染。由于一旦發(fā)生污染,實驗就必須停止,直到找到污染源為止,而且實驗結(jié)果必須作廢,需重新進(jìn)行實驗。所以發(fā)生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣,浪費人力物力。因此要避免污染,首先應(yīng)是預(yù)防,而不是排除。PCR擴(kuò)增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域:試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染,進(jìn)入各個工作區(qū)域必須嚴(yán)格遵循單一方向進(jìn)行,即只能從試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)...
PCR實驗室設(shè)計的中心問題是如何避免污染。在實際工作中,常見的有以下幾種污染類型:擴(kuò)增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標(biāo)本間的污染。由于一旦發(fā)生污染,實驗就必須停止,直到找到污染源為止,而且實驗結(jié)果必須作廢,需重新進(jìn)行實驗。所以發(fā)生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣,浪費人力物力。因此要避免污染,首先應(yīng)是預(yù)防,而不是排除。PCR擴(kuò)增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域:試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染,進(jìn)入各個工作區(qū)域必須嚴(yán)格遵循單一方向進(jìn)行,即只能從試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)...
PCR方法主要可以分為三類:終點PCR、qPCR和dPCR。終點PCR終點PCR是較原始、較簡單的PCR方法,如今仍在被我們普遍使用。使用者只能在PCR反應(yīng)結(jié)束之后,通過凝膠電泳、毛細(xì)管電泳等方法對產(chǎn)物進(jìn)行檢測。終點PCR本身是無法定量的,因為該反應(yīng)產(chǎn)出的DNA量不一定能反映較初情況。舉例來說,不同樣品和序列的擴(kuò)增效率是有差異的。qPCR和dPCR研究者們通過兩種途徑克服了PCR定量分析的挑戰(zhàn):實時定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(dPCR)。qPCR主要是利用插入性染料或熒光探針(比如TaqMan),人們可以通過監(jiān)控PCR過程中的熒光強(qiáng)度比較多個樣品的DNA水平。數(shù)字PCR(dPCR)的基...
PCR由變性--退火--延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成: 1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備。 2、模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對結(jié)合。3、引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基互補(bǔ)配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三...
PCR實驗技術(shù)中的直接PCR(DirectPCR)介紹:直接PCR意指直接從樣本中擴(kuò)增目的DNA,而無需核酸純化。直接PCR中,在高溫變性階段,諸如細(xì)胞、組織等材料在獨特的緩沖液中裂解,釋放出DNA。因此這種方法簡化了PCR實驗流程,減少了動手操作的時間,同時可避免純化步驟中DNA的損失。推薦具有高合成能力的DNA聚合酶用于直接PCR擴(kuò)增。細(xì)胞碎片、蛋白、脂質(zhì)和多糖也隨DNA釋放到裂解液中,它們會抑制PCR反應(yīng)。具有高合成能力的DNA聚合酶可以耐受這些抑制劑,從而使直接PCR成為可能。具有高合成能力的聚合酶通常具有更高靈敏度,因此可從未純化樣本中擴(kuò)增微量的DNA。pcr檢測實驗成功的訣竅!四川...
PCR實驗技術(shù)中的反向PCR(InversePCR)介紹:反向PCR起初設(shè)計用于確定臨近未知區(qū)域的序列。反向PCR有助于研究一個基因的啟動子序列;致*染色體重排如基因融合、異位或轉(zhuǎn)移;及病毒基因的整合。之所以稱為反向PCR,是因為引物設(shè)計用于向兩邊延伸而不像常規(guī)PCR中朝著彼此延伸。如今,反向PCR常用于定點突變,復(fù)制一個具有預(yù)期突變的目的質(zhì)粒。在研究基因組DNA未知序列的傳統(tǒng)實驗流程中,限制性內(nèi)切酶消化和連接先于反向PCR,接著對PCR擴(kuò)增子進(jìn)行測序。對于gDNA消化,需選擇一種限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切以獲得合適長度可自連的片段。同時,所選擇的內(nèi)切酶不應(yīng)該切割已知序列,所以連接發(fā)生于側(cè)翼的未知序...
PCR實驗技術(shù)中的熱啟動PCR介紹:熱啟動PCR是除了好的引物設(shè)計之外,提高PCR特異性的重要的方法之一。盡管TaqDNA聚合酶的比較好延伸溫度在72℃,聚合酶在室溫仍然有活性。因此,在進(jìn)行PCR反應(yīng)配制過程中,以及在熱循環(huán)剛開始,保溫溫度低于退火溫度時會產(chǎn)生非特異性的產(chǎn)物。這些非特異性產(chǎn)物一旦形成,就會被有效擴(kuò)增。在用于引物設(shè)計的位點因為遺傳元件的定位而受限時,如site-directed突變、表達(dá)克隆或用于DNA工程的遺傳元件的構(gòu)建和操作,熱啟動PCR尤為有效。熒光定量pcr正常值多少?黑龍江什么是pcr外包PCR有著普遍的應(yīng)用,不僅在基礎(chǔ)研究方面,還包括醫(yī)學(xué)診斷、法醫(yī)學(xué)和農(nóng)業(yè)科學(xué)等各大領(lǐng)...
PCR實驗技術(shù)中的RT-PCR一步法和兩步法的優(yōu)缺點介紹:一步法:利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進(jìn)行mRNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增。發(fā)現(xiàn)Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和其后PCR擴(kuò)增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到比較低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴(kuò)增可檢測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構(gòu)建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術(shù)相組合,使得自動反轉(zhuǎn)錄、基因擴(kuò)增與基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的...
PCR實驗技術(shù)中的MSP甲基化特異PCR介紹:一般調(diào)控區(qū)保持甲基化狀態(tài),基因不表達(dá)直接干擾轉(zhuǎn)錄因子和啟動子識別位點的結(jié)合與轉(zhuǎn)錄抑制因子結(jié)合引起基因沉默改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)MSP甲基化特異PCR是用對苯二酚和亞硫酸氫鈉處理氫氧化鈉變性的基因組DNA,使得未甲基化的C轉(zhuǎn)化為T.按照C轉(zhuǎn)換T后的基因序列設(shè)計出來的引物擴(kuò)出目的基因。由于甲基化CpG島中的C不能被轉(zhuǎn)化為T,用以上的引物將不會擴(kuò)出目的基因。通過上述手段就能達(dá)到識別基因組DNA甲基化與否的目的。實時熒光定量PCR是什么原理?內(nèi)蒙古細(xì)胞pcr實驗PCR實驗技術(shù)中的兼并引物PCR(DegeneratePrimer)介紹:兼并引物是指代替編碼單個氨基...
PCR的特異性影響因素有很多,在此我們作一歸納,供大家參考:①退火步驟的嚴(yán)格性:提高退火溫度可以減少不匹配的雜交,從而提高特異性。②減短退火時間及延伸時間可以減少錯誤引發(fā)及錯誤延伸。③引物二聚體是較常見的副產(chǎn)品,降低引物及酶的濃度也可以減少錯誤引發(fā),尤其是引物的二聚化。④改變mgcl2(有時kcl)濃度可以改進(jìn)特異性,這可能是提高反應(yīng)嚴(yán)格性或者對taq酶的直接作用。一般認(rèn)為PCR產(chǎn)物應(yīng)在48h以內(nèi)完成電泳檢測,有些比較好于當(dāng)日電泳檢測,大于48h后帶型就會出現(xiàn)不規(guī)則,甚至消失。簡述熒光定量pcr的基本原理。湖北常見pcr檢測PCR實驗技術(shù)中的直接PCR(DirectPCR)介紹:直接PCR意指...
原位PCR就是在組織細(xì)胞里進(jìn)行PCR反應(yīng),它結(jié)合了具有細(xì)胞定位能力的原位雜交和高度特異敏感的PCR技術(shù)的優(yōu)點,是細(xì)胞學(xué)科研與臨床診斷領(lǐng)域里的一項有較大潛力的新技術(shù)。原位PCR是Hasse等于1990年建立的,實驗用的標(biāo)本是新鮮組織、石蠟包埋組織、脫落細(xì)胞、血細(xì)胞等。其基本方法為:1、固定組織或細(xì)胞:將組織細(xì)胞固定于預(yù)先用四氟乙烯包被的玻片上,并用多聚甲醛處理,再滅活除去細(xì)胞內(nèi)源性過氧化物酶。2、蛋白酶K消化處理:用60ug/ml的蛋白酶K將固定好的組織細(xì)胞片55℃消化處理2h后,96℃2min以滅活蛋白酶K。3、PCR擴(kuò)增:在組織細(xì)胞片上,加PCR反應(yīng)液,覆蓋并加液體石蠟后,直接放在擴(kuò)增儀的金...
PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備;②模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對結(jié)合;③引物的延伸:DNA模板-引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,...
PCR實驗技術(shù)中的錨定PCR(AnchoredPCR)介紹:錨定PCR主要用于分析具有可變末端的DNA序列,Loh等用A-PCR對人外周血淋巴細(xì)胞T細(xì)胞受體α-鏈的mRNA的多變性進(jìn)行了分析。先合成cDNA,并用末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶在其3’-可變區(qū)末端加上一個PolyG尾巴。Loh等恒定區(qū)與可變區(qū)連接部位設(shè)一個引物,另一個引物是一個具5’-polyG尾巴的引物。帶有PolyG尾巴的引物是一個固定點,它可以并與PolyG尾巴結(jié)合,無論其余部分序列如何,只識別片段末端,利用此法可從前述mRNA中檢出至少20種不同序列,每一種都是獨特的,表明A-PCR不對任何特殊序列有傾向性結(jié)果,可用于T細(xì)胞及其它...
PCR實驗技術(shù)中的反向PCR介紹:反向PCR的目的在于擴(kuò)增一段已知序列旁側(cè)的DNA,也就是說這一反應(yīng)體系不是在一對引物之間而是在引物外側(cè)合成DNA.反向PCR可用于研究與已知DNA區(qū)段相連接的未知染色體序列,因此又稱為染色體步移。這時選擇的引物雖然與中心DNA兩末端序列互補(bǔ),但引物3’端是相互反向的。反向PCR的操作流程:擴(kuò)增前先用限制性內(nèi)切酶酶切樣品DNA,然后用DNA連接酶連接成一個環(huán)狀分子,通過反向PCR擴(kuò)增引物的上游片段和下游片段。選擇多種限制性內(nèi)切酶,基本準(zhǔn)則是選擇不能在非酶切位點切斷靶DNA的酶。裂解中心區(qū)的內(nèi)切酶使反向PCR只能擴(kuò)增引物所定模板(依賴于引物)的上游或下游區(qū),而不裂...
PCR實驗技術(shù)中的巢氏PCR(NestedPCR)介紹:巢氏PCR需要兩到三對引物,一般采用較為套引物擴(kuò)增15-30個循環(huán),再用擴(kuò)增DNA的片段內(nèi)設(shè)定的第二套引物擴(kuò)增15-30個循環(huán),這樣可使待擴(kuò)增序列得到高效擴(kuò)增,而次級結(jié)構(gòu)卻很少擴(kuò)增。套式引物PCR減少了引物非特異性退火,從而增加了特異性擴(kuò)增,提高了擴(kuò)增效率。若將套失PCR的內(nèi)外引物稍加改變,延長外引物長度(25-30bp),同時縮短內(nèi)引物長度(15-17bp),使外引物先在高退火溫度下復(fù)性,做雙溫擴(kuò)增,然后改換至三溫循環(huán),使內(nèi)引物在外引物擴(kuò)增的基礎(chǔ)上,在低退火溫度復(fù)性,直到擴(kuò)增完成,這樣就可以使兩套引物一次同時加入。英瀚斯生物pcr,不只...
PCR實驗技術(shù)中的Touch-downPCR介紹:Touch-downPCR又稱降落PCR.即選定一個溫度范圍,如50—35℃,每降1-2℃進(jìn)行1-2個循環(huán),然后在50度下進(jìn)行15個循環(huán)。Touch-down的原理隨著退火溫度的降低,特異性逐步降低,但特異性條帶在溫度較高時已經(jīng)擴(kuò)增出來,其濃度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過非特異性條帶,隨著退火溫度的降低,特異性條帶優(yōu)先被擴(kuò)增。選擇初始復(fù)性溫度的原則起始復(fù)性溫度應(yīng)該比引物的Tm值高出5-10度,然后每個循環(huán)遞減1-2度Touch-downPCR的應(yīng)用范圍lowcopyoftargetedDNA;highdegreedegeneracy(orlessspecific)...
PCR樣本可分2種,DNA樣本和RNA樣本。一,DNA樣本:已經(jīng)提取好的DNA樣本,負(fù)80度保存,干冰運輸;血液樣本,需全血,加入抗凝劑,抗凝管4度保存;組織樣本,需凍存管或干凈滅菌的離心管裝,負(fù)80度保存,干冰運輸;細(xì)胞樣本,用胰酶消化后的細(xì)胞沉淀,負(fù)20度或負(fù)80度保存。二,RNA樣本:提取好的RNA樣本,負(fù)80度保存,干冰運輸;血液樣本,全血,加入抗凝劑,4度冰箱保存;組織樣本,凍存管或干凈滅菌離心管,負(fù)80度保存,干冰運輸;細(xì)胞樣本,用胰酶消化后的細(xì)胞沉淀,負(fù)20度或負(fù)80度保存。長時間保存,可加Trizol,其中血液用TrizolLS組織和細(xì)胞沉淀用Trizol。pcr檢測實驗有哪些...
PCR引物設(shè)計的原則PCR反應(yīng)中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設(shè)計引物時以一條DNA單鏈為基準(zhǔn)(常以信息鏈為基準(zhǔn)),5′端引物與位于待擴(kuò)增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴(kuò)增片段3′端的一小段DNA序列互補(bǔ)。(1)引物設(shè)計的基本原則引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC比較好隨機(jī)分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。兩個引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,尤其是避免3′端的互補(bǔ)重疊。引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,...
PCR實驗技術(shù)中的3’RACE-PCR介紹:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作為一個引物結(jié)合位點,以連有SMART寡核營酸序列通用接頭引物的Oligo(dT)30MN作為鎖定引物反轉(zhuǎn)錄合成標(biāo)準(zhǔn)1號鏈cDNA.然后用一個基因特異引物GSP1(genespecificprimer,GSP)作為上游引物,用一個含有部分接頭序列的通用引物UPM(universalprimer,UPM)作為下游引物,以cDNA1號鏈為模板,進(jìn)行PCR循環(huán),把目的基因3‘末端的。DNA的片段擴(kuò)增出來。 英瀚斯生物,專業(yè)分子檢測平臺做PCR檢測。 靠譜的pcr檢測外包公司推薦!江西樣本pcr實驗原位PC...
PCR實驗技術(shù)的發(fā)展歷程,Khorana(1971)等**早提出核酸體外擴(kuò)增的設(shè)想:“經(jīng)DNA變性,與合適的引物雜交,用DNA聚合酶延伸引物,并不斷重復(fù)該過程便可合成tRNA基因?!?983年4月的一個星期五晚上,他開車去鄉(xiāng)下別墅的路上,猛然閃現(xiàn)出“多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)”的想法。1983年12月,Mullis用同位素標(biāo)記法看到了10個循環(huán)后的49bp長度的***個PCR片段;1985年,KaryMullis在Cetus公司工作期間,發(fā)明了PCR。Mullis要合成DNA引物來進(jìn)行測序工作,卻常為沒有足夠多的模板DNA而煩惱。1985年10月25日申請了PCR的**,1987年7月28日批準(zhǔn)(**號4...
PCR實驗技術(shù)中的不對稱PCR(AsymmetricPCR)介紹:不對稱PCR的基本原理是采用不等量的引物產(chǎn)生大量的單鏈DNA(ss-DNA)。這兩種引物分別稱為限制性引物與非限制性引物;其比較好比例一般為1:50~1:100,關(guān)鍵是限制引物的量。限制性引物太多太少,均不利于ss-DNA.不對稱PCR反應(yīng)過程:一般來說,在不對稱PCR反應(yīng)中,在開始的20-25個循環(huán)中,兩個比率不對稱的擴(kuò)增引物產(chǎn)生出雙鏈DNA,當(dāng)限量的那個引物耗光后,隨后的5-10個循環(huán)就產(chǎn)生出ssDNA.產(chǎn)生的ds-DNA與ss-DNA由于分子量不同,可以通過電泳分離。pcr檢測實驗有哪些分類?江蘇高質(zhì)量pcrPCR實驗技術(shù)...
PCR實驗技術(shù)中cDNA第二鏈的合成方法有以下幾種:1、自身引導(dǎo)法合成的單鏈cDNA3'端能夠形成一短的發(fā)夾結(jié)構(gòu),這就為第二鏈的合成提供了現(xiàn)成的引物,當(dāng)***鏈合成反應(yīng)產(chǎn)物的DNA:RNA雜交鏈變性后利用大腸桿菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA第二鏈,***用對單鏈特異性的S1核酸酶消化該環(huán),即可進(jìn)一步克隆。但自身引導(dǎo)合成法較難控制反應(yīng),而且用S1核酸酶切割發(fā)夾結(jié)構(gòu)時無一例外地將導(dǎo)致對應(yīng)于mRNA5'端序列出現(xiàn)缺失和重排,因而該方法目前很少使用。2、置換合成法該方法利用鏈在反轉(zhuǎn)錄酶作用下產(chǎn)生的cDNA:mRNA雜交鏈不用堿變性,而是在dNTP存在下,利用RNA酶H在雜交鏈的...
PCR實驗室設(shè)計的中心問題是如何避免污染。在實際工作中,常見的有以下幾種污染類型:擴(kuò)增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標(biāo)本間的污染。由于一旦發(fā)生污染,實驗就必須停止,直到找到污染源為止,而且實驗結(jié)果必須作廢,需重新進(jìn)行實驗。所以發(fā)生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣,浪費人力物力。因此要避免污染,首先應(yīng)是預(yù)防,而不是排除。PCR擴(kuò)增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域:試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染,進(jìn)入各個工作區(qū)域必須嚴(yán)格遵循單一方向進(jìn)行,即只能從試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)...
PCR原理:PCR是在試管中進(jìn)行的DNA復(fù)制反應(yīng),基本原理是依據(jù)細(xì)胞內(nèi)DNA半保留復(fù)制的機(jī)理,以及體外DNA分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,以促使雙鏈DNA變成單鏈,單鏈DNA與人工合成的引物退火,然后耐熱DNA聚合酶以dNTP為原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈DNA。PCR全過程每一步的轉(zhuǎn)換是通過溫度的改變來控制的。需要重復(fù)進(jìn)行DNA模板解鏈、引物與模板DNA結(jié)合、DNA聚合酶催化新生DNA的合成,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸3個步驟構(gòu)成PCR反應(yīng)的一個循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進(jìn)行,就可使目的DNA得以迅速擴(kuò)增。DNA模板變性:模板雙鏈DNA?單鏈DN...
PCR實驗技術(shù)中的MSP甲基化特異PCR介紹:一般調(diào)控區(qū)保持甲基化狀態(tài),基因不表達(dá)直接干擾轉(zhuǎn)錄因子和啟動子識別位點的結(jié)合與轉(zhuǎn)錄抑制因子結(jié)合引起基因沉默改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)MSP甲基化特異PCR是用對苯二酚和亞硫酸氫鈉處理氫氧化鈉變性的基因組DNA,使得未甲基化的C轉(zhuǎn)化為T.按照C轉(zhuǎn)換T后的基因序列設(shè)計出來的引物擴(kuò)出目的基因。由于甲基化CpG島中的C不能被轉(zhuǎn)化為T,用以上的引物將不會擴(kuò)出目的基因。通過上述手段就能達(dá)到識別基因組DNA甲基化與否的目的。英瀚斯生物pcr檢測,提供原始數(shù)據(jù)和完整報告。浙江推薦pcr外包PCR的特異性影響因素有很多,在此我們作一歸納,供大家參考:①退火步驟的嚴(yán)格性:提高退火...
長片段PCR通常指擴(kuò)增大于5kb的DNA的片段。長片段PCR傳統(tǒng)上使用TaqDNA聚合酶(為了快速延伸)和高保真酶(為了準(zhǔn)確度)的混合物。隨著高合成能力、高保真DNA聚合酶的發(fā)明,長片段PCR現(xiàn)在可在短時間內(nèi)高準(zhǔn)確性的完成。通過與一個強(qiáng)DNA結(jié)合蛋白的結(jié)合,聚合酶可獲得高擴(kuò)增能力,可在短時間內(nèi)擴(kuò)增長片段(如>20kbgDNA的片段)。初次之外,極高保真度(如>100xTaq)可確保長片段擴(kuò)增的低錯誤率。當(dāng)擴(kuò)增>10kb的片段時,PCR實驗方案可能需要在以下5個關(guān)鍵位置進(jìn)行適當(dāng)優(yōu)化:確保使用高質(zhì)量、高純度的DNA樣本。如果DNA聚合酶的熱穩(wěn)定較低,使用更多量的DNA聚合酶以彌補(bǔ)多次循環(huán)中的聚合酶...
PCR實驗過程一般分為三步:DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA退火:(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性比較好)的作用下,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。每一循環(huán)經(jīng)過變性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。如圖所示:現(xiàn)在有些PCR因為擴(kuò)增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是比較好也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進(jìn)行,以減少一次升降溫過程,提高了反應(yīng)速度如何挑選...
PCR實驗技術(shù)中cDNA第二鏈的合成方法有以下幾種:1、自身引導(dǎo)法合成的單鏈cDNA3'端能夠形成一短的發(fā)夾結(jié)構(gòu),這就為第二鏈的合成提供了現(xiàn)成的引物,當(dāng)***鏈合成反應(yīng)產(chǎn)物的DNA:RNA雜交鏈變性后利用大腸桿菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA第二鏈,***用對單鏈特異性的S1核酸酶消化該環(huán),即可進(jìn)一步克隆。但自身引導(dǎo)合成法較難控制反應(yīng),而且用S1核酸酶切割發(fā)夾結(jié)構(gòu)時無一例外地將導(dǎo)致對應(yīng)于mRNA5'端序列出現(xiàn)缺失和重排,因而該方法目前很少使用。2、置換合成法該方法利用鏈在反轉(zhuǎn)錄酶作用下產(chǎn)生的cDNA:mRNA雜交鏈不用堿變性,而是在dNTP存在下,利用RNA酶H在雜交鏈的...