蛋白組芯片在生物大分子相互作用研究領(lǐng)域的重要性不言而喻。作為一種前沿技術(shù),它以其獨(dú)特的優(yōu)勢,為研究人員提供了深入探索蛋白質(zhì)、DNA和RNA之間相互作用網(wǎng)絡(luò)的新工具。這些生物大分子之間的相互作用是生命活動(dòng)中不可或缺的組成部分,它們共同構(gòu)建了一個(gè)復(fù)雜而精密的網(wǎng)絡(luò),...
HuProt?技術(shù)特點(diǎn) 高通量:HuProt?人類蛋白質(zhì)組芯片包含超過21000種人類蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)亞型,覆蓋了人類蛋白質(zhì)圖譜定義的81%標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)蛋白質(zhì),是目前全球比較高通量的芯片。高靈敏度與特異性:該技術(shù)能夠在短時(shí)間內(nèi)同時(shí)檢測成百上千種蛋白質(zhì),提高...
在做ChIP-qPCR實(shí)驗(yàn)時(shí),可能會(huì)遇到一些常見的問題和挑戰(zhàn),也就是所謂的“坑”。以下是一些可能踩過的坑:非特異性結(jié)合:使用某些抗體時(shí),可能會(huì)遇到非特異性結(jié)合的問題,導(dǎo)致高背景信號(hào)和假陽性結(jié)果。為了解決這個(gè)問題,可以嘗試使用不同的抗體或優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件。DNA片段...
HuProt?人類蛋白質(zhì)組芯片,是迄今為止通量比較高的人類蛋白質(zhì)組芯片。它包含超過21000種人類蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)亞型,覆蓋了人類蛋白質(zhì)圖譜定義的81%標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)蛋白質(zhì),這些蛋白廣FAN覆蓋受體、轉(zhuǎn)錄因子、激酶、胞外基質(zhì)蛋白、細(xì)胞骨架蛋白等30余種蛋白類型,可...
HuProt?人類蛋白質(zhì)組微陣列技術(shù)以其高通量特性在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中脫穎而出,成為了科學(xué)家們不可或缺的研究工具。傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)研究方法受限于技術(shù)瓶頸,往往只能對少數(shù)蛋白質(zhì)進(jìn)行逐一分析,這無疑限制了研究的深度和廣度。然而,HuProt?技術(shù)的出現(xiàn)徹底改變了這一局面...
IP-Mass(免疫沉淀-質(zhì)譜)實(shí)驗(yàn)流程主要包括以下步驟:樣品制備:收集細(xì)胞或組織樣品,并進(jìn)行適當(dāng)?shù)牧呀馓幚恚葬尫偶?xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。免疫沉淀:將特異性抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合,形成抗原-抗體復(fù)合物。隨后,將復(fù)合物與固相載體(如磁珠)結(jié)合,通過洗滌步驟去除非特異性結(jié)合...
Co-IP技術(shù)作為研究蛋白質(zhì)相互作用的重要手段,其結(jié)果在多數(shù)情況下是可靠的。然而,該技術(shù)也存在一些潛在的限制和影響因素,需要研究人員予以注意。在實(shí)際應(yīng)用中,由于細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)種類繁多且相互作用復(fù)雜,可能會(huì)出現(xiàn)非特異性結(jié)合或背景噪聲,這要求研究者選擇特異性強(qiáng)的抗體...
在CoIP(免疫共沉淀)實(shí)驗(yàn)中,技術(shù)重復(fù)和生物重復(fù)設(shè)計(jì)建議如下:進(jìn)行多次技術(shù)重復(fù)(在同一實(shí)驗(yàn)條件下使用不同的樣品或樣品批次)和生物重復(fù)(使用來自不同生物或不同實(shí)驗(yàn)條件的樣品),以評估結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性。在設(shè)置對照組時(shí),還需要注意以下幾點(diǎn):對照組的設(shè)置應(yīng)遵循科...
對于Co-IP實(shí)驗(yàn)初學(xué)者,常遇到的“坑”主要有:首先,抗體選擇至關(guān)重要。選擇特異性不強(qiáng)或親和力低的抗體,可能導(dǎo)致非特異性結(jié)合,干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果。因此,選擇經(jīng)過驗(yàn)證的高質(zhì)量抗體是關(guān)鍵。其次,實(shí)驗(yàn)操作規(guī)范不容忽視。細(xì)胞裂解不充分、洗滌不當(dāng)?shù)榷紩?huì)影響蛋白復(fù)合物的純化,進(jìn)...
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)的局限性主要包括:可能檢測不到低親和力和瞬間的相互作用:低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)之間的相互作用可能檢測不到,這可能導(dǎo)致某些重要的相互作用被遺漏。不能確保直接相互作用:免疫共沉淀不能保證...
Co-IP(免疫共沉淀)和ChIP(染色質(zhì)免疫沉淀)是兩種常用于研究蛋白質(zhì)與DNA或蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的實(shí)驗(yàn)方法。實(shí)驗(yàn)原理方面的區(qū)別:Co-IP利用抗體與抗原之間的特異性結(jié)合,將目標(biāo)蛋白及其與之相互作用的蛋白一起拉下來,進(jìn)而研究它們之間的相互作用。而ChI...
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法,是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細(xì)胞內(nèi)生理性相互作用的有效方法。其原理是:當(dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時(shí),完整細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間...
對于Co-IP實(shí)驗(yàn)初學(xué)者,常遇到的“坑”主要有:首先,抗體選擇至關(guān)重要。選擇特異性不強(qiáng)或親和力低的抗體,可能導(dǎo)致非特異性結(jié)合,干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果。因此,選擇經(jīng)過驗(yàn)證的高質(zhì)量抗體是關(guān)鍵。其次,實(shí)驗(yàn)操作規(guī)范不容忽視。細(xì)胞裂解不充分、洗滌不當(dāng)?shù)榷紩?huì)影響蛋白復(fù)合物的純化,進(jìn)...
CoIP-Mass和CoIP-WB優(yōu)劣勢:優(yōu)勢:高通量獲得目的蛋白的專屬蛋白互作庫。劣勢:CoIP的蛋白庫魚龍混雜,包含目的蛋白的直接/間接互作蛋白,非特異結(jié)合,殘留蛋白。常規(guī)理想IP-Mass項(xiàng)目可鑒定到1000-2000個(gè)蛋白,其中絕大部分是非特異性結(jié)合及...
IP-WB(免疫沉淀-Western Blot)是一種常用的實(shí)驗(yàn)方法,用于驗(yàn)證蛋白質(zhì)之間的相互作用。在IP-WB實(shí)驗(yàn)中,首先使用特異性抗體將目標(biāo)蛋白從細(xì)胞或組織裂解液中免疫沉淀下來。這一步驟確保了只有與目標(biāo)蛋白特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)被富集。隨后,將免疫沉淀得到的蛋...
免疫沉淀(IP)的原理及應(yīng)用: 免過疫沉淀技術(shù)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎(chǔ),用于研究蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)與遺傳物質(zhì)之間相互作用的經(jīng)典方法,可有效確定兩種蛋白質(zhì)在完整細(xì)胞內(nèi)生理性相互作用,也是用于抗原檢測和純化的方法之一。CO-IP、CHIP...
IP-WB(免疫沉淀-Western Blot)實(shí)驗(yàn)要點(diǎn)主要包括以下幾個(gè)步驟:樣品制備:確保樣品新鮮且未經(jīng)過多次凍融,以避免蛋白降解。裂解細(xì)胞或組織,獲得含有目標(biāo)蛋白及其相互作用伙伴的裂解液。免疫沉淀:選擇特異性強(qiáng)的抗體,與目標(biāo)蛋白結(jié)合形成復(fù)合物。將復(fù)合物與固...
免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn),細(xì)胞的收集及裂解方法如下: 收集2E7個(gè)細(xì)胞樣品,加入PBS洗滌細(xì)胞,離心后棄上清收集細(xì)胞沉淀。 準(zhǔn)備500μl預(yù)冷的CellLysisBuffer,分別加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF,混勻...
如果RIP-qPCR實(shí)驗(yàn)失敗了,首先不要過于沮喪,因?yàn)閷?shí)驗(yàn)失敗在科學(xué)研究中是常有的事情。重要的是要冷靜分析失敗的原因,并采取相應(yīng)的措施來解決問題。首先,回顧實(shí)驗(yàn)過程,檢查是否有操作失誤或疏忽。例如,檢查引物設(shè)計(jì)是否合理、試劑是否過期、加樣是否準(zhǔn)確等。這些細(xì)節(jié)問...
IP-Mass(免疫沉淀-質(zhì)譜)技術(shù)是一種結(jié)合了免疫沉淀和質(zhì)譜分析的方法,用于研究蛋白質(zhì)相互作用和差異蛋白質(zhì)分析。該技術(shù)首先利用特異性抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合,形成抗原-抗體復(fù)合物。然后,這些復(fù)合物被吸附到固相載體上,經(jīng)過洗滌步驟去除非特異性結(jié)合的雜質(zhì)。接下來,蛋白...
RIP實(shí)驗(yàn)(RNA免疫沉淀實(shí)驗(yàn))是一種用于研究RNA與蛋白質(zhì)相互作用的重要技術(shù)。根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮蛻?yīng)用場景,RIP實(shí)驗(yàn)可以分為多個(gè)分類。首先,根據(jù)研究對象的不同,RIP實(shí)驗(yàn)可以分為細(xì)胞核RIP和細(xì)胞質(zhì)RIP。細(xì)胞核RIP主要用于研究細(xì)胞核內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)的相...
在CoIP(免疫共沉淀)實(shí)驗(yàn)中,技術(shù)重復(fù)和生物重復(fù)設(shè)計(jì)建議如下:進(jìn)行多次技術(shù)重復(fù)(在同一實(shí)驗(yàn)條件下使用不同的樣品或樣品批次)和生物重復(fù)(使用來自不同生物或不同實(shí)驗(yàn)條件的樣品),以評估結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性。在設(shè)置對照組時(shí),還需要注意以下幾點(diǎn):對照組的設(shè)置應(yīng)遵循科...
RIP-seq和RIP-qPCR實(shí)驗(yàn)都是基于RNA免疫沉淀(RIP)技術(shù)的方法,用于研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)的相互作用。它們的相同點(diǎn)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:首先,兩者都利用特定蛋白的抗體來沉淀相應(yīng)的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物,從而實(shí)現(xiàn)對與特定蛋白質(zhì)結(jié)合的RNA的捕獲...
如果RIP-qPCR實(shí)驗(yàn)失敗了,首先不要過于沮喪,因?yàn)閷?shí)驗(yàn)失敗在科學(xué)研究中是常有的事情。重要的是要冷靜分析失敗的原因,并采取相應(yīng)的措施來解決問題。首先,回顧實(shí)驗(yàn)過程,檢查是否有操作失誤或疏忽。例如,檢查引物設(shè)計(jì)是否合理、試劑是否過期、加樣是否準(zhǔn)確等。這些細(xì)節(jié)問...
RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀實(shí)驗(yàn)(RNA-binding protein immunoprecipitation,RIP)是一種用于研究RNA與蛋白質(zhì)相互作用的實(shí)驗(yàn)方法。實(shí)驗(yàn)步驟:細(xì)胞裂解和RNA酶處理:收集細(xì)胞,并用含有RNA酶抑制劑的裂解液進(jìn)行裂解。細(xì)胞裂解后,...
在RIP-qPCR過程中,避免假陽性結(jié)果的出現(xiàn)是至關(guān)重要的。以下是一些建議來減少假陽性的風(fēng)險(xiǎn):優(yōu)化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì):確保實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)合理,設(shè)置適當(dāng)?shù)膶φ諏?shí)驗(yàn),如陰性對照和陽性對照。陰性對照可以幫助檢測實(shí)驗(yàn)過程中可能存在的污染,而陽性對照則用于驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)方法的有效性。使用高質(zhì)...
進(jìn)行RIP實(shí)驗(yàn)時(shí),抗體的選擇是實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵之一。以下是選擇抗體時(shí)需要考慮的幾個(gè)要點(diǎn)。1. 特異性:首要考慮的是抗體的特異性。必須選擇能夠特異性識(shí)別并結(jié)合目標(biāo)蛋白的抗體,以避免非特異性結(jié)合和背景噪音。可以通過查閱文獻(xiàn)、抗體供應(yīng)商提供的數(shù)據(jù)或進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證抗體...
在分子機(jī)制研究過程中,RIP-qPCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)扮演著重要角色。該技術(shù)主要應(yīng)用于研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)的相互作用,有助于揭示基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制。通過RIP-qPCR,研究者可以特異性地識(shí)別并結(jié)合目標(biāo)RNA結(jié)合蛋白(RBP),進(jìn)而分析與其結(jié)合的RNA分子。...
在分子機(jī)制研究過程中,RIP-qPCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)扮演著重要角色。該技術(shù)主要應(yīng)用于研究細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)的相互作用,有助于揭示基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制。通過RIP-qPCR,研究者可以特異性地識(shí)別并結(jié)合目標(biāo)RNA結(jié)合蛋白(RBP),進(jìn)而分析與其結(jié)合的RNA分子。...
RIP實(shí)驗(yàn)RNA結(jié)合蛋白-RNA復(fù)合物的免疫沉淀(RIP)免疫沉淀方法: 將所有的試管在4°C下旋轉(zhuǎn)孵育3小時(shí)至過夜。 將免疫沉淀管短暫離心,放置在磁性分離器上,棄用上清液。 從磁鐵上取下試管。每管中加入0.5mLRIP洗滌緩沖液,短暫渦...