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蘇州RIP免疫沉淀實驗視頻

來源: 發(fā)布時間:2024-06-01

Co-IP的實驗步驟:
1. 細胞裂解:首先,細胞或組織被裂解,釋放其中的蛋白質(zhì)。
2. 抗體結(jié)合:然后,將特異性抗體(針對已知蛋白質(zhì)之一的抗體)加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結(jié)合到目標蛋白(誘餌蛋白)上。
3. 免疫復(fù)合物形成:抗體與目標蛋白結(jié)合后,形成免疫復(fù)合物。
4. 沉淀:接著,使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲免疫復(fù)合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結(jié)合,從而拉下抗體以及與之結(jié)合的目標蛋白和任何相關(guān)的相互作用蛋白。
5. 洗滌:捕獲的免疫復(fù)合物被洗滌以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)。
6. 洗脫和分析:免疫復(fù)合物被洗脫并進行進一步的分析,如Western blot(WB)或質(zhì)譜分析,以鑒定相互作用的蛋白質(zhì)。
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RIP實驗步驟通常包括:
1. 細胞收集與交聯(lián):培養(yǎng)細胞至適當密度。使用交聯(lián)劑(如甲醛)進行交聯(lián),以固定蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。
2. 細胞裂解:收集細胞并進行裂解,釋放RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物。在裂解過程中添加蛋白酶抑制劑以防止蛋白質(zhì)降解。
3. 超聲處理:使用超聲波破壞細胞,獲得更小的染色質(zhì)片段,這有助于后續(xù)步驟中抗體的接觸。
4. 除去細胞碎片:通過離心去除細胞碎片和未裂解的細胞,收集含RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的上清液。
5. 免疫沉淀:將針對特定RNA結(jié)合蛋白(RBP)的抗體加入到上清液中。孵育一段時間,使抗體與目標蛋白充分結(jié)合。
6. 捕獲免疫復(fù)合物:添加蛋白A或蛋白G結(jié)合的磁珠或瓊脂糖珠。孵育使抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物與珠子結(jié)合。
7. 洗滌:多次洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和RNA。
8. 洗脫與逆轉(zhuǎn)交聯(lián):使用適當?shù)木彌_液洗脫免疫復(fù)合物。使用蛋白酶K處理樣品以逆轉(zhuǎn)交聯(lián),釋放RNA。
9. RNA提取與純化:從免疫沉淀樣品中提取RNA,并進行純化。
10. RNA分析:使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以確定與目標蛋白相互作用的RNA種類。
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免疫沉淀(ChIP)實驗中抗體的選擇非常關(guān)鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應(yīng)當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致假陽性結(jié)果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結(jié)合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應(yīng)用驗證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(ChIP)或相關(guān)應(yīng)用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應(yīng)商信息:選擇信譽良好的抗體供應(yīng)商,并查看供應(yīng)商提供的技術(shù)數(shù)據(jù)和客戶評價,以幫助做出決策。

免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation,簡稱IP)是一種生物化學(xué)方法,它利用特異性抗體對抗原進行親和純化。在含有目的抗原的細胞裂解液中加入特定的抗體以及Protein A/G-Beads(預(yù)先將Protein A/G固定結(jié)合在磁珠上),根據(jù)抗原與抗體、Protein A/G與抗體的Fc的特異性,形成“抗原-抗體-Protein A/G-Beads”復(fù)合物,清洗離心后去除溶液中未結(jié)合的雜蛋白,檢測是否存在目的蛋白。
免疫沉淀技術(shù)常用于從細胞或組織裂解物中分離用于免疫印跡檢測或其他檢測技術(shù)的蛋白和其他生物分子。它的目標是分離足夠用于Western Blot或其他檢測方法檢測的蛋白質(zhì)。
免疫沉淀的操作步驟?

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免疫沉淀技術(shù)RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)是一種用于研究細胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)。RIP技術(shù)可以幫助我們了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動態(tài)過程,并發(fā)現(xiàn)miRNA等非編碼RNA的調(diào)節(jié)靶點。
RIP技術(shù)的原理是利用針對特定RNA結(jié)合蛋白的抗體,將細胞內(nèi)的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物沉淀下來。然后,可以通過分離純化,對這些復(fù)合物中的RNA進行檢測,如qPCR驗證或測序分析。
表觀遺傳學(xué)和RNA生物學(xué)領(lǐng)域?qū)Σ煌琑NA作用和功能的關(guān)注增加。RNA-蛋白質(zhì)相互作用能夠調(diào)控mRNA和非編碼RNA的功能。對RNA潛能的這一新認識帶動了新方法的發(fā)展,使研究人員能夠定位 RNA-蛋白質(zhì)相互作用。
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免疫沉淀技術(shù)ChIP的實驗方法。蘇州RIP免疫沉淀實驗視頻

免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)是一種用于研究蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)復(fù)合物組成以及特定蛋白質(zhì)的表達和純化的實驗技術(shù)。
基本原理
免疫沉淀技術(shù)基于抗體與特定蛋白質(zhì)(抗原)之間的特異性相互作用。通過使用針對目標蛋白質(zhì)的特異性抗體,可以從含有多種蛋白質(zhì)的復(fù)雜樣本中捕獲并富集目標蛋白質(zhì)。
免疫沉淀技術(shù)有多種類型,包括:
1. 個別免疫沉淀法(Individual IP)
2. 免疫共沉淀法(Co-IP)
3. 染色質(zhì)免疫沉淀法(ChIP)
4. RNA免疫沉淀法(RIP)
近年來,免疫沉淀技術(shù)在固相支持物的選擇上有了很大進步。磁性微珠因其操作簡便、快速和自動化程度高而逐漸取代了傳統(tǒng)的瓊脂糖樹脂。
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