免疫沉淀(immunoprecipitation)是指利用抗體可與抗原特異性結(jié)合的特性,將抗原(常為靶蛋白)從混合體系沉淀下來,初步分離靶蛋白的一種方法。免疫共沉淀(coimmunoprecipitation)是一種在體外探測兩個蛋白分子間是否存在特異性相互作用的一種方法。其原理非常簡單,如果兩個蛋白在體外體系能夠發(fā)生特異性相互作用的話,那么當(dāng)用一種蛋白的抗體進行免疫沉淀時,另一個蛋白也會被同時沉淀下來。與酵母雙雜交技術(shù)不同,免疫共沉淀技術(shù)所利用的是抗原和抗體間的免疫反應(yīng),是一種基于體外非細胞的環(huán)境中研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用的方法。
免疫沉淀技術(shù)是什么?上海anti DYKDDDDK免疫沉淀實驗視頻
染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技術(shù)是目前公認的研究此相互作用的選擇,是真核生物基因表達機制研究中不可或缺的技術(shù)之一。
它的基本原理是在活細胞狀態(tài)下,固定蛋白質(zhì)-DNA(染色質(zhì))復(fù)合物,并將其切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段,然后通過免疫學(xué)方法(抗體親和)沉淀此復(fù)合體,特異性地富集目的蛋白結(jié)合的 DNA,通過對目的片段的純化與后期檢測,從而獲得蛋白質(zhì)與 DNA 相互作用的信息。
這項技術(shù)通過蛋白質(zhì)與DNA互作來分析目標基因活性以及已知蛋白質(zhì)的靶基因,被廣泛應(yīng)用于體內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子與靶基因啟動子上特異核苷酸序列結(jié)合方面的研究。該技術(shù)常與DNA芯片和分子克隆技術(shù)相結(jié)合。
溫州蛋白免疫沉淀磁珠的選擇免疫沉淀技術(shù)RIP的實驗設(shè)計。
免疫沉淀RIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu) (直徑 50-150 μm) 可以結(jié)合抗體 (繼而結(jié)合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu),這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強,而磁珠在得率,可重復(fù)性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實驗步驟通常包括以下幾個關(guān)鍵環(huán)節(jié):
1. 細胞裂解:首先需要收集細胞并裂解它們,以釋放細胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。這通常通過添加含有蛋白酶抑制劑的裂解緩沖液來完成,以防止蛋白質(zhì)降解。
2. 裂解物上清:裂解后的細胞混合物通常需要通過離心來去除未破碎的細胞碎片和未裂解的細胞,從而獲得上清。
3. 抗體的添加:將特定于目標蛋白的抗體加入到裂解物中。這些抗體將特異性地結(jié)合到目標蛋白上。
4. 免疫復(fù)合物的形成:抗體與目標蛋白結(jié)合形成免疫復(fù)合物。
5. 免疫復(fù)合物的捕獲:使用Protein A/G結(jié)合的磁珠來捕獲免疫復(fù)合物。
6. 洗滌:捕獲免疫復(fù)合物后,需要用裂解/洗滌緩沖液多次洗滌,以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他污染物。
7. 洗脫:免疫復(fù)合物可以通過加入SDS樣品緩沖液進行洗脫,這將導(dǎo)致抗體和抗原變性并從珠子上釋放下來,或者使用低pH緩沖液進行溫和洗脫,以保持蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象。
8. 分析:洗脫后的樣品可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot等方法進行分析,以驗證目標蛋白的存在和狀態(tài)。
免疫沉淀技術(shù)ChIP的原理是什么?
免疫共沉淀分析(Co-IP)與IP十分類似,基本的技術(shù)都是采用目標抗原特異性的固相化抗體;但IP的目標是純化單一抗原,而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。
在Co-IP實驗中,已知抗原稱為誘餌蛋白,與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白、信號分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等,蛋白間相互作用強度范圍可能介于高度瞬時和十分穩(wěn)定之間。
基本的Co-IP實驗方案與IP相同,實際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是,還有許多其他因素需要考慮,例如,結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化,優(yōu)化時,需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
免疫沉淀技術(shù)的綜述。溫州ChIP免疫沉淀磁珠哪個公司好用
免疫沉淀IP抗體的選擇?上海anti DYKDDDDK免疫沉淀實驗視頻
免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因:
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低,則有幾種方法可以進行優(yōu)化。在結(jié)合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結(jié)合的組分。使用普通微珠預(yù)純化樣本還可以降低非目標分子的共純化。此外,還可以使用無關(guān)蛋白 (如BSA) 封閉微珠 。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實驗中會出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況。如果共洗脫會影響下游分析,則需要使用抗體通過共價連接固定至微珠的方法進行實驗,如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式。
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