真核生物的基因組 DNA 以染色質(Chromatin)的形式存在。因此,研究蛋白質與 DNA 在染色質環(huán)境中的相互作用是闡明真核生物基因表達機制的基本途徑,而染色質免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技術是目前公認的研究此相互作用的選擇,是真核生物基因表達機制研究中不可或缺的技術之一。
它的基本原理是在活細胞狀態(tài)下,固定蛋白質-DNA(染色質)復合物,并將其切斷為一定長度范圍內的染色質小片段,然后通過免疫學方法(抗體親和)沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結合的 DNA,通過對目的片段的純化與后期檢測,從而獲得蛋白質與 DNA 相互作用的信息。
免疫沉淀技術IP的優(yōu)缺點是什么?北京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠原理
免疫沉淀技術的實驗方法通常包括以下步驟:
1. 樣本準備
2. 細胞裂解:使用裂解緩沖液(含有蛋白酶抑制劑以防止蛋白質降解)裂解細胞,釋放蛋白質。
3. 蛋白質濃度測定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法測定裂解液中蛋白質的濃度。
4. 抗體預處理:如果使用預固定的抗體,需先將抗體固定在固相支持物上,如瓊脂糖珠或磁性微珠。
5. 免疫沉淀反應:將裂解液與特異性抗體(固定或未固定)混合,并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜,以允許抗體與目標蛋白質充分結合。
6. 固相支持物的回收:對于未固定的抗體,加入與抗體特異性結合的蛋白A或蛋白G結合的固相支持物。
7. 洗滌:去除未結合的蛋白質和雜質,通常需要多次洗滌固相支持物。
8. 洗脫:使用適當的洗脫緩沖液(如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液)從固相支持物上洗脫免疫復合物。
9. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質進行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質譜分析等,以進一步分析目標蛋白質。
10. 對照實驗:包括正對照(已知能沉淀目標蛋白的抗體)和負對照(非特異性抗體或無抗體)以驗證實驗的特異性。
免疫沉淀磁珠應用免疫沉淀技術Co-IP實驗步驟。
免疫沉淀IP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構 (直徑 50-150 μm) 可以結合抗體 (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
免疫沉淀(IP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經過免疫沉淀(IP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數據和客戶評價,以幫助做出決策。
免疫沉淀選瓊脂糖珠還是磁珠?
免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)的實驗設計通常包括以下幾個關鍵步驟:
1. 目標蛋白質的選擇:
2. 抗體的選擇:選擇特異性強、親和力高的抗體來捕獲目標蛋白質
3. 樣本的準備:收集和準備細胞或組織樣本。
4. 蛋白質的裂解和釋放:選擇合適的裂解條件,如pH值、離子強度、去污劑等。
5. 蛋白質濃度的測定:確定裂解液中蛋白質的濃度,以便于后續(xù)步驟的標準化。
6. 免疫沉淀的操作:將特異性抗體與裂解液混合,并在適宜的條件下孵育,以形成抗體-抗原復合物。
7. 非特異性結合的減少:通過預純化步驟去除可能的非特異性結合蛋白。
8. 洗滌:多次洗滌以去除未結合的蛋白質和雜質。
9. 目標蛋白質的洗脫:使用適當的緩沖液洗脫抗體-抗原復合物。
10. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質進行進一步分析,如Western Blot.
11. 對照實驗:設計適當的正對照和負對照,以評估實驗的特異性和敏感性。
免疫沉淀技術RIP實驗步驟。深圳Co IP免疫沉淀磁珠應用
免疫沉淀技術Co-IP是什么?北京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠原理
Co-IP(Co-Immunoprecipitation,共免疫沉淀)的實驗方法通常包括以下步驟:
1. 細胞培養(yǎng)與裂解:細胞在適宜的培養(yǎng)條件下生長到適當的密度。
蛋白質分離:裂解后的細胞混合物通過離心去除未破碎的細胞碎片和未裂解的細胞。收集上清液
2. 抗體的添加:將特異性抗體(針對目標蛋白質的抗體)加入到裂解物中。
3. 免疫復合物的形成:抗體與目標蛋白結合后,形成免疫復合物。
4. 親和介質的使用:向混合物中添加蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)。
5. 免疫復合物的捕獲:將混合物與珠子孵育一段時間后,使用磁鐵或離心的方法將珠子收集起來,同時捕獲了與之結合的免疫復合物。
6. 洗滌:洗滌珠子以去除未特異性結合的蛋白質和其他分子。
7. 洗脫:使用適當的緩沖液將免疫復合物從珠子上洗脫下來,常用的緩沖液包括SDS樣品緩沖液,用于后續(xù)的電泳分析。
8. 蛋白質分析:洗脫的蛋白質可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot、質譜分析等方法進行進一步分析。
9. 實驗對照:實驗中應包括陽性對照和陰性對照,以確保實驗結果的可靠性。
10. 數據分析:對實驗結果進行分析,確認目標蛋白是否成功沉淀,并鑒定任何可能的相互作用蛋白。
北京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠原理