免疫沉淀(Co-IP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(Co-IP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數(shù)據(jù)和客戶評價,以幫助做出決策。
免疫沉淀技術IP的實驗設計。北京anti DYKDDDDK免疫沉淀實驗視頻
Co-IP(Co-Immunoprecipitation,共免疫沉淀)的實驗方法通常包括以下步驟:
1. 細胞培養(yǎng)與裂解:細胞在適宜的培養(yǎng)條件下生長到適當?shù)拿芏取?/span>
蛋白質(zhì)分離:裂解后的細胞混合物通過離心去除未破碎的細胞碎片和未裂解的細胞。收集上清液
2. 抗體的添加:將特異性抗體(針對目標蛋白質(zhì)的抗體)加入到裂解物中。
3. 免疫復合物的形成:抗體與目標蛋白結合后,形成免疫復合物。
4. 親和介質(zhì)的使用:向混合物中添加蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)。
5. 免疫復合物的捕獲:將混合物與珠子孵育一段時間后,使用磁鐵或離心的方法將珠子收集起來,同時捕獲了與之結合的免疫復合物。
6. 洗滌:洗滌珠子以去除未特異性結合的蛋白質(zhì)和其他分子。
7. 洗脫:使用適當?shù)木彌_液將免疫復合物從珠子上洗脫下來,常用的緩沖液包括SDS樣品緩沖液,用于后續(xù)的電泳分析。
8. 蛋白質(zhì)分析:洗脫的蛋白質(zhì)可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot、質(zhì)譜分析等方法進行進一步分析。
9. 實驗對照:實驗中應包括陽性對照和陰性對照,以確保實驗結果的可靠性。
10. 數(shù)據(jù)分析:對實驗結果進行分析,確認目標蛋白是否成功沉淀,并鑒定任何可能的相互作用蛋白。
上海anti Flag免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨免疫沉淀的原理是什么?
RIP實驗步驟通常包括:
1. 細胞收集與交聯(lián):培養(yǎng)細胞至適當密度。使用交聯(lián)劑(如甲醛)進行交聯(lián),以固定蛋白質(zhì)-RNA復合物。
2. 細胞裂解:收集細胞并進行裂解,釋放RNA-蛋白質(zhì)復合物。在裂解過程中添加蛋白酶抑制劑以防止蛋白質(zhì)降解。
3. 超聲處理:使用超聲波破壞細胞,獲得更小的染色質(zhì)片段,這有助于后續(xù)步驟中抗體的接觸。
4. 除去細胞碎片:通過離心去除細胞碎片和未裂解的細胞,收集含RNA-蛋白質(zhì)復合物的上清液。
5. 免疫沉淀:將針對特定RNA結合蛋白(RBP)的抗體加入到上清液中。孵育一段時間,使抗體與目標蛋白充分結合。
6. 捕獲免疫復合物:添加蛋白A或蛋白G結合的磁珠或瓊脂糖珠。孵育使抗體-蛋白質(zhì)-RNA復合物與珠子結合。
7. 洗滌:多次洗滌珠子以去除未特異性結合的蛋白質(zhì)和RNA。
8. 洗脫與逆轉交聯(lián):使用適當?shù)木彌_液洗脫免疫復合物。使用蛋白酶K處理樣品以逆轉交聯(lián),釋放RNA。
9. RNA提取與純化:從免疫沉淀樣品中提取RNA,并進行純化。
10. RNA分析:使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以確定與目標蛋白相互作用的RNA種類。
免疫沉淀Co-IP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構 (直徑 50-150 μm) 可以結合抗體 (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
免疫沉淀和免疫共沉淀的區(qū)別?
免疫沉淀(immunoprecipitation)是指利用抗體可與抗原特異性結合的特性,將抗原(常為靶蛋白)從混合體系沉淀下來,初步分離靶蛋白的一種方法。免疫共沉淀(coimmunoprecipitation)是一種在體外探測兩個蛋白分子間是否存在特異性相互作用的一種方法。其原理非常簡單,如果兩個蛋白在體外體系能夠發(fā)生特異性相互作用的話,那么當用一種蛋白的抗體進行免疫沉淀時,另一個蛋白也會被同時沉淀下來。與酵母雙雜交技術不同,免疫共沉淀技術所利用的是抗原和抗體間的免疫反應,是一種基于體外非細胞的環(huán)境中研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用的方法。
免疫沉淀RIP技術選瓊脂糖珠還是磁珠?杭州RIP免疫沉淀磁珠哪個公司好用
免疫沉淀ChIP技術選瓊脂糖珠還是磁珠?北京anti DYKDDDDK免疫沉淀實驗視頻
免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)是一種用于研究蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)復合物組成以及特定蛋白質(zhì)的表達和純化的實驗技術。
基本原理
免疫沉淀技術基于抗體與特定蛋白質(zhì)(抗原)之間的特異性相互作用。通過使用針對目標蛋白質(zhì)的特異性抗體,可以從含有多種蛋白質(zhì)的復雜樣本中捕獲并富集目標蛋白質(zhì)。
免疫沉淀技術有多種類型,包括:
1. 個別免疫沉淀法(Individual IP)
2. 免疫共沉淀法(Co-IP)
3. 染色質(zhì)免疫沉淀法(ChIP)
4. RNA免疫沉淀法(RIP)
近年來,免疫沉淀技術在固相支持物的選擇上有了很大進步。磁性微珠因其操作簡便、快速和自動化程度高而逐漸取代了傳統(tǒng)的瓊脂糖樹脂。
北京anti DYKDDDDK免疫沉淀實驗視頻