ChIP(染色質免疫沉淀)實驗是一種用于研究蛋白質與DNA相互作用的技術。以下是ChIP實驗的實驗方法概述:
1. 交聯(lián):將細胞與交聯(lián)劑(如1%甲醛)孵育,通常在室溫下進行10-15分鐘。
2. 終止交聯(lián):添加甘氨酸以終止交聯(lián)反應,孵育5分鐘。
3. 收集細胞:通過離心收集細胞,并用PBS洗滌以去除交聯(lián)劑。
4. 細胞裂解:使用裂解緩沖液裂解細胞,釋放染色質。
5. 染色質剪切:使用超聲波或酶消化將染色質剪切成適當大小的片段。
6. 免疫沉淀:將剪切后的染色質與特異性抗體孵育,然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗滌:用低鹽、高鹽和LiCl洗滌液洗滌磁珠,去除非特異性結合物。
8. 洗脫:用洗脫緩沖液洗脫DNA。
9. 逆轉交聯(lián):用蛋白酶K處理,然后在65°C下加熱過夜以逆轉交聯(lián)。
10. DNA純化:使用商業(yè)試劑盒或標準酚/氯仿方法純化DNA。
11. 分析:使用qPCR分析富集的DNA,或進行測序以確定蛋白質結合位點。
免疫沉淀技術RIP的應用有哪些?南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠應用
免疫共沉淀分析(Co-IP)實驗原理與IP十分類似,基本的技術都是采用目標抗原特異性的固相化抗體;但IP的目標是純化單一抗原,而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結合的蛋白質或配體。
在Co-IP實驗中,已知抗原稱為誘餌蛋白,與之結合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復雜的伴侶蛋白、信號分子、結構蛋白、輔助因子等,蛋白間相互作用強度范圍可能介于高度瞬時和十分穩(wěn)定之間。基本的Co-IP實驗方案與IP相同,實際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是,還有許多其他因素需要考慮,例如,結合和洗滌條件的優(yōu)化,優(yōu)化時,需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠應用免疫沉淀技術的應用。
免疫沉淀(IP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(IP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數(shù)據(jù)和客戶評價,以幫助做出決策。
Co-IP的優(yōu)勢:
1. 生理相關性:Co-IP可以在接近生理條件的條件下捕獲蛋白質相互作用。
2. 特異性:使用特異性抗體可以提高實驗的特異性。
3. 廣泛應用:Co-IP技術適用于多種樣本類型,包括細胞培養(yǎng)、組織樣本等。
Co-IP的局限性:
1. 抗體依賴性:需要高質量的特異性抗體,否則可能得到假陽性或假陰性結果。
2. 非特異性結合:可能存在非特異性結合問題,需要仔細的實驗設計和對照來控制。
3. 技術挑戰(zhàn):對于低豐度或弱相互作用的蛋白質,Co-IP可能面臨技術挑戰(zhàn)。
免疫沉淀技術是什么?
免疫沉淀(ChIP)實驗中抗體的選擇非常關鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結合,導致假陽性結果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應用驗證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(ChIP)或相關應用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應商信息:選擇信譽良好的抗體供應商,并查看供應商提供的技術數(shù)據(jù)和客戶評價,以幫助做出決策。
免疫沉淀技術ChIP的實驗設計。廣州ChIP免疫沉淀磁珠哪個公司好用
免疫沉淀RIP技術選瓊脂糖珠還是磁珠?南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠應用
Co-IP的實驗步驟:
1. 細胞裂解:首先,細胞或組織被裂解,釋放其中的蛋白質。
2. 抗體結合:然后,將特異性抗體(針對已知蛋白質之一的抗體)加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結合到目標蛋白(誘餌蛋白)上。
3. 免疫復合物形成:抗體與目標蛋白結合后,形成免疫復合物。
4. 沉淀:接著,使用蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲免疫復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合,從而拉下抗體以及與之結合的目標蛋白和任何相關的相互作用蛋白。
5. 洗滌:捕獲的免疫復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質。
6. 洗脫和分析:免疫復合物被洗脫并進行進一步的分析,如Western blot(WB)或質譜分析,以鑒定相互作用的蛋白質。
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