免疫沉淀(immunoprecipitation)是指利用抗體可與抗原特異性結(jié)合的特性,將抗原(常為靶蛋白)從混合體系沉淀下來,初步分離靶蛋白的一種方法。免疫共沉淀(coimmunoprecipitation)是一種在體外探測兩個蛋白分子間是否存在特異性相互作用的一種方法。其原理非常簡單,如果兩個蛋白在體外體系能夠發(fā)生特異性相互作用的話,那么當用一種蛋白的抗體進行免疫沉淀時,另一個蛋白也會被同時沉淀下來。與酵母雙雜交技術(shù)不同,免疫共沉淀技術(shù)所利用的是抗原和抗體間的免疫反應(yīng),是一種基于體外非細胞的環(huán)境中研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用的方法。
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免疫沉淀實驗步驟:
1. 樣品制備
a. 懸浮細胞樣品處理:離心收集細胞(4℃, 1000g, 5 min),用手指把細胞用力彈散。按照6孔板每孔細胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應(yīng)在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)?;靹蚝笾糜诒咸幚?0 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
b. 貼壁細胞樣品處理:移去培養(yǎng)基,用PBS清洗細胞兩遍;用細胞刮棒刮脫細胞,收集至1.5mL EP管內(nèi),按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應(yīng)在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)。吹打數(shù)下,使裂解液和細胞充分接觸?;靹蚝笾糜诒咸幚?0 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
4. 后續(xù):磁珠預(yù)處理——抗體吸附——抗原結(jié)合反應(yīng)——抗體洗脫
南京RIP免疫沉淀磁珠應(yīng)用免疫沉淀和免疫共沉淀的區(qū)別?
免疫共沉淀分析(Co-IP)實驗原理與IP十分類似,基本的技術(shù)都是采用目標抗原特異性的固相化抗體;但IP的目標是純化單一抗原,而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。
在Co-IP實驗中,已知抗原稱為誘餌蛋白,與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白、信號分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等,蛋白間相互作用強度范圍可能介于高度瞬時和十分穩(wěn)定之間?;镜腃o-IP實驗方案與IP相同,實際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是,還有許多其他因素需要考慮,例如,結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化,優(yōu)化時,需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)是一種用于研究蛋白質(zhì)相互作用和純化特定蛋白質(zhì)的實驗方法。
優(yōu)點:
1. 特異性強:利用特異性抗體捕獲目標蛋白,可以有效地從復(fù)雜的生物樣本中分離出感興趣的蛋白質(zhì)。
2. 靈敏度高:可以檢測到低豐度的蛋白質(zhì),包括瞬態(tài)或弱相互作用的蛋白質(zhì)復(fù)合物。
3. 應(yīng)用范圍廣:適用于多種生物樣本,如細胞裂解物、組織提取物和生物流體。
4. 生物學(xué)洞察深入:能夠揭示蛋白質(zhì)之間的相互作用網(wǎng)絡(luò),有助于理解細胞內(nèi)的信號傳遞和調(diào)控機制。
5. 可與其他技術(shù)聯(lián)用:如與質(zhì)譜(IP-MS)聯(lián)用,可以準確鑒定蛋白質(zhì)及其相互作用伙伴。
缺點:
1. 對抗體依賴性高:需要高親和力和高特異性的抗體,抗體的質(zhì)量直接影響實驗結(jié)果。
2. 可能存在非特異性結(jié)合:樣本中的其他蛋白質(zhì)可能與抗體或固相支持物發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致背景噪音。
3. 可能影響蛋白質(zhì)的天然狀態(tài):裂解和沉淀過程可能會改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象和功能。
4. 實驗重復(fù)性:需要多次實驗來確保結(jié)果的可重復(fù)性和可靠性。
5. 樣品處理:需要避免樣品降解和非特異性結(jié)合,這可能需要使用蛋白酶抑制劑和適當?shù)木彌_液條件。
免疫沉淀技術(shù)RIP的應(yīng)用有哪些?
免疫沉淀RIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu) (直徑 50-150 μm) 可以結(jié)合抗體 (繼而結(jié)合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu),這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強,而磁珠在得率,可重復(fù)性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
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免疫沉淀的操作步驟?蘇州ChIP免疫沉淀磁珠價格
免疫沉淀(Co-IP)實驗中抗體的選擇非常關(guān)鍵,因為抗體的特異性和親和力直接影響到實驗的成功與否。
1. 特異性:抗體應(yīng)當對目標蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致假陽性結(jié)果。
2. 親和力:抗體對目標蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實驗。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強的結(jié)合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應(yīng)用驗證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(Co-IP)或相關(guān)應(yīng)用(如Western blot, IHC)驗證的抗體,這增加了實驗成功的可能性。
5. 供應(yīng)商信息:選擇信譽良好的抗體供應(yīng)商,并查看供應(yīng)商提供的技術(shù)數(shù)據(jù)和客戶評價,以幫助做出決策。
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