“免疫沉淀”一般是指采用固定在固相支持物上的結合蛋白,進行小規(guī)模的蛋白質親和純化的實驗。更確切地說,IP是采用固定在微珠支持物(一般是瓊脂糖樹脂)上的特定抗體,從復雜的混合物中,純化單一抗原的實驗。固定化蛋白質復合物的組裝既可以分步進行,也可以一步完成。
常見的加樣順序:抗體和樣本(如細胞裂解物)一起孵育,然后加入親和微珠,用于捕獲抗體-抗原復合物。也可以將抗體和微珠(通過抗體結合蛋白,如蛋白A、G或A/G等,直接或間接結合抗體)先進行孵育,然后再加入含有抗原的樣本。當抗原、抗體和固相支持物產(chǎn)生結合以后,充分洗滌微珠,再采用適當?shù)南疵摼彌_液從支持物上洗脫抗原。
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免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)是一種用于研究蛋白質相互作用、蛋白質復合物組成以及特定蛋白質的表達和純化的實驗技術。
基本原理
免疫沉淀技術基于抗體與特定蛋白質(抗原)之間的特異性相互作用。通過使用針對目標蛋白質的特異性抗體,可以從含有多種蛋白質的復雜樣本中捕獲并富集目標蛋白質。
免疫沉淀技術有多種類型,包括:
1. 個別免疫沉淀法(Individual IP)
2. 免疫共沉淀法(Co-IP)
3. 染色質免疫沉淀法(ChIP)
4. RNA免疫沉淀法(RIP)
近年來,免疫沉淀技術在固相支持物的選擇上有了很大進步。磁性微珠因其操作簡便、快速和自動化程度高而逐漸取代了傳統(tǒng)的瓊脂糖樹脂。
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免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)是一種利用抗體與特定蛋白質結合的特性,從復雜樣本中分離和純化目標蛋白質的實驗方法。這項技術在生物醫(yī)學研究中有著廣泛的應用場景,以下是一些主要的應用領域:
1. 蛋白質相互作用分析:通過免疫沉淀技術,研究人員可以研究蛋白質之間的相互作用,揭示蛋白質復合物的組成以及它們在細胞內(nèi)的功能和調(diào)控機制。
2. 抗體藥物開發(fā):免疫沉淀技術可以用于研究抗體藥物與其靶標蛋白的結合特性,評估抗體藥物的親和力和特異性,指導抗體藥物的設計和優(yōu)化。
3. 蛋白質表達水平分析:通過比較不同條件下的免疫沉淀結果,可以評估目標蛋白的相對量,進而研究蛋白質的表達調(diào)控。
4. 染色質免疫沉淀(ChIP):這是一種特殊的免疫沉淀技術,用于研究蛋白質與DNA的相互作用,如轉錄因子或組蛋白修飾與基因組特定區(qū)域的結合情況。
5. RNA免疫沉淀(RIP):類似于ChIP,RIP用于研究RNA結合蛋白與RNA分子之間的相互作用。
免疫沉淀技術RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)的實驗方法基于以下幾個關鍵步驟:
1. 細胞裂解:首先,細胞或組織樣本被裂解,以釋放細胞內(nèi)的蛋白質和RNA復合物。
2.抗體特異性結合:裂解后的樣本中加入針對特定RNA結合蛋白的抗體。這些抗體能夠特異性地識別并結合到目標蛋白。
3. 免疫復合物形成:抗體與目標蛋白結合后,形成抗體-蛋白質-RNA復合物。
4. 親和介質捕獲:使用蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲這些抗體-蛋白質-RNA復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合,從而拉下與之結合的復合物。
5. 洗滌:捕獲的復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質和RNA。
6. RNA分離和分析:從珠子上洗脫或消化復合物,分離出RNA,并進行進一步的分析,如qPCR、Northern blot或高通量測序(RNA-Seq)。
免疫沉淀ChIP抗體的選擇?
ChIP(染色質免疫沉淀)實驗是一種用于研究蛋白質與DNA相互作用的技術。以下是ChIP實驗的實驗方法概述:
1. 交聯(lián):將細胞與交聯(lián)劑(如1%甲醛)孵育,通常在室溫下進行10-15分鐘。
2. 終止交聯(lián):添加甘氨酸以終止交聯(lián)反應,孵育5分鐘。
3. 收集細胞:通過離心收集細胞,并用PBS洗滌以去除交聯(lián)劑。
4. 細胞裂解:使用裂解緩沖液裂解細胞,釋放染色質。
5. 染色質剪切:使用超聲波或酶消化將染色質剪切成適當大小的片段。
6. 免疫沉淀:將剪切后的染色質與特異性抗體孵育,然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗滌:用低鹽、高鹽和LiCl洗滌液洗滌磁珠,去除非特異性結合物。
8. 洗脫:用洗脫緩沖液洗脫DNA。
9. 逆轉交聯(lián):用蛋白酶K處理,然后在65°C下加熱過夜以逆轉交聯(lián)。
10. DNA純化:使用商業(yè)試劑盒或標準酚/氯仿方法純化DNA。
11. 分析:使用qPCR分析富集的DNA,或進行測序以確定蛋白質結合位點。
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Co-IP的優(yōu)勢:
1. 生理相關性:Co-IP可以在接近生理條件的條件下捕獲蛋白質相互作用。
2. 特異性:使用特異性抗體可以提高實驗的特異性。
3. 廣泛應用:Co-IP技術適用于多種樣本類型,包括細胞培養(yǎng)、組織樣本等。
Co-IP的局限性:
1. 抗體依賴性:需要高質量的特異性抗體,否則可能得到假陽性或假陰性結果。
2. 非特異性結合:可能存在非特異性結合問題,需要仔細的實驗設計和對照來控制。
3. 技術挑戰(zhàn):對于低豐度或弱相互作用的蛋白質,Co-IP可能面臨技術挑戰(zhàn)。
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