qPCR法,即定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Quantitative Polymerase Chain Reaction)法,是一種高度靈敏和特異的分子生物學(xué)技術(shù),用于檢測和定量DNA序列。在支原體檢測中,qPCR法的原理主要包括以下幾個步驟:
1. DNA提取:首先從待測樣本中提取DNA,這可能包括細(xì)胞培養(yǎng)上清液或組織樣本中的支原體DNA。
2. 設(shè)計特異性引物:針對支原體的保守DNA序列,如16S rRNA基因,設(shè)計特異性的DNA引物。
3. 熒光標(biāo)記探針:使用熒光標(biāo)記的探針,該探針與目標(biāo)DNA序列互補(bǔ),能夠在PCR擴(kuò)增過程中與擴(kuò)增的DNA結(jié)合。
4. Ct值確定:Ct值(閾值循環(huán)數(shù))是指在PCR反應(yīng)中,熒光信號強(qiáng)度超過預(yù)定閾值的循環(huán)次數(shù)。Ct值越低,表示樣本中支原體DNA的量越多。
5. 定量分析:通過標(biāo)準(zhǔn)曲線法或相對定量法,將Ct值轉(zhuǎn)換為支原體DNA的定量結(jié)果。
qPCR法的優(yōu)勢在于其高靈敏度和特異性,能夠檢測到非常低水平的支原體污染,并且可以在短時間內(nèi)提供結(jié)果,這對于需要快速檢測的生物制品生產(chǎn)和細(xì)胞培養(yǎng)質(zhì)量控制非常重要
細(xì)胞被支原體污染了會有什么影響?廣州細(xì)胞培養(yǎng)支原體檢測試劑貨期
支原體去除和支原體預(yù)防是兩種不同的策略,它們在細(xì)胞培養(yǎng)和生物制品生產(chǎn)中都非常重要。
支原體去除是指在細(xì)胞已經(jīng)被支原體污染后采取的措施。這通常涉及到使用特定的抗*素或化學(xué)試劑來消滅或抑制支原體的生長。例如,根據(jù)的描述,支原體去除試劑是一種混合抗*素制劑,它含有三種對支原體具有抑菌作用的組分,可以取得良好的支原體清*效果。使用這種方法時,細(xì)胞需要在含有去除試劑的培養(yǎng)基中培養(yǎng)一段時間,然后更換培養(yǎng)基并檢測支原體是否已被清*。
支原體預(yù)防則是指在細(xì)胞培養(yǎng)過程中采取的預(yù)防措施,以避免支原體污染的發(fā)生。這包括保持實驗室環(huán)境的清潔、使用無菌技術(shù)、對所有培養(yǎng)基和器材進(jìn)行適當(dāng)?shù)南咎幚淼?。根?jù)的背景介紹,預(yù)防措施還包括對細(xì)胞培養(yǎng)層流柜保持整潔,避免在無蓋器皿上方舞動手掌和手臂,以及立即清理溢出物等。這些措施有助于減少支原體污染的風(fēng)險。
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支原體污染和黑膠蟲污染是兩種不同類型的細(xì)胞培養(yǎng)污染,它們具有各自的特點(diǎn)和區(qū)別:
支原體污染:在相差顯微鏡下,支原體呈暗色微小顆粒位于細(xì)胞表面和細(xì)胞之間。
黑膠蟲污染:在高倍鏡下,被黑膠蟲污染的細(xì)胞膜會變得模糊不清,邊界不清晰,有粗糙感。
污染的影響:
支原體污染:可能導(dǎo)致細(xì)胞增殖緩慢,甚至從培養(yǎng)器皿脫落,影響細(xì)胞的DNA、RNA及蛋白表達(dá)。
黑膠蟲污染:與細(xì)胞競爭性生長,開始時對細(xì)胞沒有什么影響,但當(dāng)數(shù)量多時,細(xì)胞生長會受到影響直至死亡。
污染的來源:
支原體污染:可能來源于工作環(huán)境的污染、操作者本身、培養(yǎng)基的污染、交叉污染、實驗器材帶來的污染以及用來制備細(xì)胞的原始組織或部位的污染。
黑膠蟲污染:可能來源于細(xì)胞本身的污染或從動物取材時的污染,也可能通過培養(yǎng)箱空氣進(jìn)行污染。
細(xì)胞培養(yǎng)中,支原體檢測的重要性體現(xiàn)在以下幾個方面:
1. 高污染發(fā)生率:支原體對培養(yǎng)細(xì)胞的污染發(fā)生率非常高,據(jù)估計平均發(fā)生率在60%左右。
3. 隱匿性強(qiáng):支原體污染具有很高的隱匿性,早期不容易被發(fā)現(xiàn),除非使用特異性和靈敏度都非常高的專業(yè)檢測試劑盒。
3. 影響實驗結(jié)果:支原體污染會改變細(xì)胞的生理性質(zhì),影響實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性。細(xì)胞培養(yǎng)物一旦被支原體污染,會改變細(xì)胞DNA、RNA及蛋白表達(dá),導(dǎo)致實驗數(shù)據(jù)不準(zhǔn)確、不穩(wěn)定。
4. 難以通過肉眼或常規(guī)方法發(fā)現(xiàn):支原體污染無法通過肉眼檢查細(xì)胞來發(fā)現(xiàn),也不能通過向培養(yǎng)基中加入抗*素控制。
5. 對細(xì)胞培養(yǎng)數(shù)據(jù)可靠性的影響:支原體污染會降低細(xì)胞系的有效性,使得細(xì)胞培養(yǎng)數(shù)據(jù)失去可靠性,無法為生命科學(xué)研究提供有意義的數(shù)據(jù)。
6. 預(yù)防和控制污染的必要性:定期進(jìn)行支原體檢測是細(xì)胞培養(yǎng)實驗室進(jìn)行自我質(zhì)量監(jiān)控的必要組成部分,有助于及時發(fā)現(xiàn)并控制污染,保證實驗的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。
7. 避免細(xì)胞株受損:支原體污染可能導(dǎo)致細(xì)胞株受損,影響細(xì)胞株的質(zhì)量和研究價值。及時檢測和清*支原體污染有助于保護(hù)珍貴的細(xì)胞資源
支原體檢測的樣本用什么合適?
檢測新鮮培養(yǎng)基是否有支原體污染,可以采用以下五種方案:
1. 培養(yǎng)法:這是一種傳統(tǒng)且可靠的方法,通過將培養(yǎng)基接種到適宜支原體生長的微生物培養(yǎng)基或瓊脂平板上,觀察是否有支原體生長。這種方法較為耗時,但成本較低。
2. 熒光染色法:使用特定的熒光染料(如Hoechst 33258)對細(xì)胞進(jìn)行染色,然后在熒光顯微鏡下觀察。如果存在支原體污染,可以看到細(xì)胞表面或細(xì)胞間隙中支原體DNA的熒光染色。
3. PCR法:通過設(shè)計針對支原體特定序列的引物,利用PCR技術(shù)特異性擴(kuò)增目標(biāo)DNA。PCR產(chǎn)物通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測,如果出現(xiàn)條帶則表明存在支原體污染。
4. 電鏡觀察法:使用電子顯微鏡直接觀察培養(yǎng)細(xì)胞中的支原體污染情況。這種方法可以提供直觀的支原體形態(tài)信息,但設(shè)備要求較高。
5. 一步法恒溫支原體檢測:使用特定的試劑盒,如Yeasen一步法恒溫支原體檢測試劑,采用等溫擴(kuò)增技術(shù),通過顏色變化(由藍(lán)紫色變?yōu)樘焖{(lán)色)進(jìn)行快速檢測。
支原體檢測方法qPCR法?支原體檢測方法LAMP法
什么樣的客戶需要定期檢測支原體污染?廣州細(xì)胞培養(yǎng)支原體檢測試劑貨期
一步法支原體檢測試劑盒的防污染版本通常采用等溫擴(kuò)增技術(shù),如LAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification)原理,通過支原體特異性引物在恒溫條件下對樣本進(jìn)行檢測,終通過顏色變化確定樣品中是否含有支原體污染。這種方法的優(yōu)勢在于:
1. 快速檢測:可以在較短的時間內(nèi)完成檢測,通常在60分鐘以內(nèi)。
2. 高靈敏度和特異性:等溫擴(kuò)增技術(shù)可以檢測到非常低濃度的支原體DNA。
3. 操作簡便:不需要復(fù)雜的設(shè)備,如PCR儀或電泳設(shè)備,只需水浴鍋即可完成擴(kuò)增反應(yīng)。
4. 減少污染風(fēng)險:由于無需開蓋電泳,可以減少因氣溶膠造成的交叉污染。
此外,試劑盒還包含UNG(Uracil-N-Glycosylase)酶,用于防止PCR過程中的污染,UNG酶可以消化反應(yīng)液中可能存在的尿嘧啶,從而減少因污染導(dǎo)致的假陽性結(jié)果。
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