方法
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靈敏度
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優(yōu)勢
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劣勢
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培養(yǎng)法
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☆☆☆
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ü 便捷
ü 便宜
ü 金標(biāo)準(zhǔn)
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ü 費(fèi)勞力
ü 耗時長
ü 需要特定的培養(yǎng)基
ü 特定支原體種類需要特定的培養(yǎng)基
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DNA染色
(DAPI or Hoescht)
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☆
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ü 迅速
ü 便捷
ü 便宜
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ü 可能難以判讀結(jié)果
ü 無法鑒別支原體種屬
ü 可能假陽性可能性
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間接染色
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☆☆☆
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ü 迅速
ü 便宜
ü 易檢測
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ü 費(fèi)時
ü 需要細(xì)胞系指示
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ELISA
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☆☆
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ü 迅速
ü 客觀,易判讀結(jié)果
ü 可以鑒別支原體種屬
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ü 受抗體限制
ü 價格高
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免疫染色
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☆☆
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ü 迅速
ü 可檢測支原體種屬
ü 價格略高
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ü 可檢測的支原體種屬有限
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放射自顯影
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☆☆
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ü 迅速
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ü 難以判讀結(jié)果
ü 無法鑒別支原體種屬
ü 費(fèi)勞力
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生物發(fā)光
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☆☆
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ü 迅速
ü 便捷
ü 便宜
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ü 難以判讀結(jié)果
ü 無法鑒別支原體種屬
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PCR
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☆☆☆
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ü 便宜
ü 迅速
ü 具有特異性
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ü 可能假陽性可能性
ü 檢測特異性依賴引物特異性
ü 需要提取DNA
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Real-Time PCR
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☆☆☆
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ü 便捷
ü 迅速
ü 具有特異性
ü 結(jié)果可靠
ü 高通量
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ü 可能假陽性可能性
ü 檢測特異性依賴引物特異性
ü 需要提取DNA
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LAMP
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☆☆
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ü 便捷
ü 無需DNA提取
ü *需10min左右的實(shí)驗(yàn)操作時間
ü 具有特異性
ü 高通量
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ü 可能假陽性可能性
ü 檢測特異性依賴引物特異性
支原體檢測方法qPCR法的應(yīng)用。北京細(xì)胞支原體檢測方法等溫?cái)U(kuò)增
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LAMP法,即環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法(Loop-mediated isothermal amplification),在支原體檢測中的應(yīng)用具有以下特點(diǎn)和應(yīng)用場景:
1. 日常監(jiān)測:由于LAMP法的快速和簡便性,它適用于生物實(shí)驗(yàn)室的日常監(jiān)測,可以及時檢測出支原體的存在,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。
2. 疾病診斷:LAMP法已被成功應(yīng)用于SARS、禽流感、HIV等疾病的檢測中,并在2009年甲型H1N1流感事件中發(fā)揮了重要作用。
3. 臨床應(yīng)用:LAMP法在臨床樣本的檢測中顯示出了快速、高靈敏度和穩(wěn)定性,可以用于檢測實(shí)驗(yàn)室樣本及臨床樣本中的支原體。
4. 多病原體檢測:LAMP法可以同時檢測多種病原體,包括肺炎支原體在內(nèi)的多種下呼吸道感*的病原體,為臨床診療提供詢證依據(jù)。
5. 與其他技術(shù)結(jié)合:LAMP法可以與CRISPR-Cas12a等其他技術(shù)結(jié)合,建立新的檢測方法,提高檢測的效率和準(zhǔn)確性。
溫州細(xì)胞支原體去除試劑細(xì)胞被支原體污染了會有什么影響?
細(xì)胞培養(yǎng)中,需要去除支原體的污染:支原體污染是細(xì)胞培養(yǎng)中 普遍的問題之一,細(xì)胞庫中或正在使用的細(xì)胞中,支原體的污染率約為15%-35%。并對培養(yǎng)細(xì)胞的生理和代謝造成諸多影響:
01/ 爭奪營養(yǎng) – 阻礙細(xì)胞生長和增殖
02/ 改變蛋白質(zhì)、RNA 或 DNA 合成的水平
03/ 改變基因表達(dá)、細(xì)胞信號傳導(dǎo)和形態(tài)
04/ 損害膜和細(xì)胞器
05/ 導(dǎo)致突變和染色體變化
06/ 時間、金錢和有價值的細(xì)胞丟失,耽誤研究時間
07/ 實(shí)驗(yàn)結(jié)果的不可靠性,實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性 降低
08/ 生物安全問題
對于同一個樣品,如果一步法恒溫試劑盒檢測結(jié)果為陽性,而PCR檢測為陰性,可能的原因包括:
1. 檢測的支原體種類不同:一步法恒溫試劑盒可能檢測的支原體種類更多,例如可以涵蓋27種支原體,而PCR檢測可能只針對常見的12種支原體進(jìn)行檢測。因此,如果樣品中污染的支原體種類不在PCR檢測的范圍內(nèi),就可能出現(xiàn)一步法檢測為陽性而PCR檢測為陰性的情況。
2. 靈敏度的差異:PCR方法的靈敏度可能高于一步法恒溫檢測法。PCR可以檢測到低至單個拷貝的支原體,而一步法恒溫檢測可能需要更高的支原體拷貝數(shù),例如10^3^個拷貝。如果樣品中支原體的數(shù)量低于一步法檢測的靈敏度閾值,PCR檢測可能無法檢測到,導(dǎo)致陰性結(jié)果。
3. 樣品中可能含有抑制PCR反應(yīng)的物質(zhì):如果樣品中存在PCR反應(yīng)的抑制物,可能會影響PCR的擴(kuò)增效率,導(dǎo)致即使存在支原體,PCR檢測也可能呈現(xiàn)陰性結(jié)果。
4. 試劑盒的特異性和交叉反應(yīng):一步法恒溫試劑盒可能具有更高的特異性,減少了與其他微生物的交叉反應(yīng),從而在PCR檢測為陰性時仍能準(zhǔn)確檢測到支原體的存在。
支原體檢測的應(yīng)用場景?
巢式PCR法和一步法恒溫支原體檢測試劑盒各有優(yōu)缺點(diǎn),具體哪個更好要根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求和條件來決定。
1. 巢式PCR法通過兩輪PCR擴(kuò)增來提高檢測的特異性和靈敏度。它的優(yōu)點(diǎn)是:
2. 特異性強(qiáng),可以減少假陽性結(jié)果。
3. 靈敏度高,可以檢測到很低數(shù)量的支原體。
4. 通過設(shè)計(jì)多對引物,可以覆蓋多種支原體種類。
不過巢式PCR法也存在一些缺點(diǎn):
1. 操作復(fù)雜,需要兩輪PCR反應(yīng)。
2. 容易受到PCR抑制物的影響,產(chǎn)生假陰性結(jié)果。
3. 反應(yīng)后需要開蓋電泳檢測,增加了污染的風(fēng)險。
而一步法恒溫支原體檢測試劑盒采用等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),具有以下優(yōu)點(diǎn):
1. 操作簡便,只需一次反應(yīng)即可完成檢測。
2. 靈敏度和特異性也很高,可檢出10個拷貝以上的支原體污染。
3. 反應(yīng)后無需開蓋,減少了污染的風(fēng)險。
但一步法試劑盒的缺點(diǎn)是:
1. 靈敏度雖高,但可能略低于巢式PCR法。
2. 價格可能比巢式PCR試劑盒要高。
細(xì)胞培養(yǎng)為什么建議使用支原體檢測?廣州細(xì)胞培養(yǎng)支原體預(yù)防
支原體去除的實(shí)驗(yàn)步驟?北京細(xì)胞支原體檢測方法等溫?cái)U(kuò)增
支原體的預(yù)防可通過以下方式:
1. 控制污染源:通過定期檢測和去除細(xì)胞培養(yǎng)中的支原體污染,確保細(xì)胞培養(yǎng)體系內(nèi)無支原體存在,從而獲得準(zhǔn)確有效的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。
2. 改善無菌操作技術(shù):通過提高實(shí)驗(yàn)人員的操作技術(shù)和意識,避免在細(xì)胞培養(yǎng)過程中引入支原體污染。
3. 使用無菌設(shè)備和耗材:使用無菌的細(xì)胞培養(yǎng)設(shè)備和耗材,如無菌培養(yǎng)基、血清等,減少支原體污染的風(fēng)險。
4. 定期消毒和清潔:對實(shí)驗(yàn)室環(huán)境進(jìn)行定期的消毒和清潔,包括工作臺、培養(yǎng)箱等,以減少支原體的潛在污染。
5. 使用預(yù)防性試劑:使用專門針對支原體的預(yù)防性試劑,如加入細(xì)胞培養(yǎng)基中的預(yù)防劑、超凈臺噴霧、水浴鍋預(yù)防和細(xì)胞培養(yǎng)箱水盤預(yù)防等,以預(yù)防支原體污染。
6. 提高實(shí)驗(yàn)室人員對支原體污染的認(rèn)識:通過科普教育和培訓(xùn),提高實(shí)驗(yàn)室人員對支原體污染的認(rèn)識和預(yù)防意識。
7. 建立嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室管理規(guī)程:制定并執(zhí)行嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室管理規(guī)程,包括樣本處理、廢物處理、設(shè)備維護(hù)等,以降低支原體污染的風(fēng)險。
北京細(xì)胞支原體檢測方法等溫?cái)U(kuò)增