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基因的拷貝數(shù)與幾倍體是沒什么關(guān)系的?在不考慮突變的前提下,基因的拷貝數(shù)和幾倍體是直接相關(guān)的,因?yàn)榛虻妮d體是染色體,幾倍體是指染色體的倍數(shù)。打個(gè)比方,人有46條染色體,2二倍體,在人的21號(hào)染色體上有一個(gè)等位基因A,純合子。那么正常人基因A的拷貝數(shù)是2,而21三體綜合癥(21號(hào)染色體有3條,即21號(hào)染色體是三倍體)的患者基因A的拷貝數(shù)是3。另外發(fā)生基因突變也可能會(huì)導(dǎo)致基因拷貝數(shù)的變化。以人類基因組為例,我們講A基因在人類基因組中存在兩個(gè)拷貝,那意思是說在一套人類基因組中有兩個(gè)這樣的基因,就是所說的等位基因,且位于一對(duì)染色體上,即每個(gè)染色體組中各有一個(gè),因?yàn)槿旧w是基因的載體,通俗的講說基因是在染色體上的,當(dāng)染色體組的個(gè)數(shù)(也就是幾倍體)發(fā)生變化那么基因的拷貝數(shù)一般來說會(huì)隨之改變的。細(xì)胞產(chǎn)品中的外源病毒載體基因拷貝數(shù)不高于5拷貝/細(xì)胞。杭州基因療法載體拷貝數(shù)政策
γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體(RetroviralVector):早期臨床試驗(yàn)曾發(fā)現(xiàn),逆轉(zhuǎn)錄病毒對(duì)造血干細(xì)胞進(jìn)行基因改造回輸人體后誘導(dǎo)了的發(fā)生。目前對(duì)逆轉(zhuǎn)錄病毒載體的臨床使用安全性仍在探索中,建議謹(jǐn)慎使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體進(jìn)行分裂活躍的干細(xì)胞類產(chǎn)品的基因編輯。慢病毒載體(LentiviralVector):。慢病毒載體生產(chǎn)和臨床使用的主要風(fēng)險(xiǎn)點(diǎn)包括:(1)生產(chǎn)過程中可能產(chǎn)生復(fù)制型慢病毒。(2)載體與慢病毒多核苷酸序列進(jìn)行體內(nèi)重組,(3)在活性基因中或其附近插入前病毒從而可能引起或促進(jìn)。北京腺相關(guān)病毒載體拷貝數(shù)檢測(cè)怎樣增加低拷貝質(zhì)粒的提取效率?
穿梭質(zhì)粒:是指一類人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點(diǎn)和篩選,因而可以在兩種不同類群宿主中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。此概念不僅用于不同的微生物菌群之間,也可以推廣到真核生物表達(dá)載體的構(gòu)建,如用于枯草的pBE2、酵母的pPIC9K、哺乳動(dòng)物表達(dá)載體pMT2和用于植物細(xì)胞的Ti質(zhì)粒。這些穿梭質(zhì)粒不僅可以在大腸桿菌中復(fù)制擴(kuò)增,也可以在相應(yīng)的枯草、酵母、動(dòng)物或植物細(xì)胞中擴(kuò)增和表達(dá)。這樣利于對(duì)質(zhì)粒的分子生物學(xué)操作和大量制備。質(zhì)粒的不相容性:通俗來說,就是一山不能容二虎。但是作為科學(xué)來說,我們需要一個(gè)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)亩x?!袄猛粡?fù)制系統(tǒng)的兩個(gè)質(zhì)粒會(huì)在復(fù)制和隨后向自細(xì)胞的分配過程中彼此競(jìng)爭(zhēng),這樣的質(zhì)粒在細(xì)菌培養(yǎng)物中不能和平共處,這種現(xiàn)象稱之為不相容性”。
在基因工程中,質(zhì)粒的拷貝數(shù)應(yīng)該怎么理解?為什么構(gòu)建載體時(shí)要選擇高拷貝數(shù)的質(zhì)粒載體?把細(xì)胞當(dāng)做工廠,質(zhì)粒就是廠房里的流水線,拷貝數(shù)就流水線的數(shù)量在理想狀態(tài)下,選擇盡量多的流水線,這樣能得到的產(chǎn)品多,這是很自然的選擇實(shí)際上,高拷貝也有它的問題,當(dāng)流水線多到一定程度,決定產(chǎn)量就不只是流水線的多寡,工人的工作效率,也就是轉(zhuǎn)錄翻譯水平,也會(huì)影響到較終的產(chǎn)量此外,過多的流水線帶來放不下的情況,工廠沒那么大地方,原材料供應(yīng)不上,吃不消,也會(huì)影響到工廠正常運(yùn)轉(zhuǎn)所以,拷貝數(shù)只是一個(gè)方面,構(gòu)建載體要綜合考慮各方面及實(shí)際用途。有時(shí)低拷貝質(zhì)粒滲漏表達(dá),反而有奇效。載體拷貝數(shù)計(jì)算公式:copies/ml(拷貝數(shù))=(6.02 x 10(23)次拷貝數(shù)/摩爾) x (濃度) / (MW g/mol)。
為促進(jìn)及早發(fā)現(xiàn)此類風(fēng)險(xiǎn)并提供有效地風(fēng)險(xiǎn)控制措施,本指導(dǎo)原則在借鑒ICHE2E藥物警戒計(jì)劃、《藥物警戒質(zhì)量管理規(guī)范》和國(guó)內(nèi)外風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃相關(guān)指導(dǎo)原則的基礎(chǔ)上,列舉了CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品可能存在的安全性風(fēng)險(xiǎn),以及常規(guī)和本類產(chǎn)品特異的額外藥物警戒活動(dòng)和風(fēng)險(xiǎn)較小化措施。CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的風(fēng)險(xiǎn)識(shí)別應(yīng)盡早開始,并在整個(gè)研發(fā)過程中持續(xù)進(jìn)行,以在可能的情況下預(yù)防、較小化風(fēng)險(xiǎn)。隨著對(duì)風(fēng)險(xiǎn)認(rèn)知的變化,應(yīng)及時(shí)更新風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃。本指導(dǎo)原則包括CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品申報(bào)上市臨床風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃的結(jié)構(gòu)和內(nèi)容,重點(diǎn)就撰寫CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃時(shí)的特殊考慮進(jìn)行描述,CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品申報(bào)上市臨床風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃還應(yīng)參考ICHE2E、《藥物警戒質(zhì)量管理規(guī)范》以及我國(guó)藥品監(jiān)管機(jī)構(gòu)發(fā)布的有關(guān)技術(shù)指導(dǎo)原則。隨著技術(shù)的發(fā)展和相關(guān)研究數(shù)據(jù)的積累,本指導(dǎo)原則也將適時(shí)進(jìn)行更新。如何計(jì)算質(zhì)粒的拷貝數(shù)?寧波CAR-T載體拷貝數(shù)CRO
載體拷貝數(shù)看什么數(shù)據(jù)?杭州基因療法載體拷貝數(shù)政策
載體拷貝數(shù)一般檢測(cè)方法有:若是測(cè)序結(jié)果,可選用censor軟件檢測(cè)相關(guān)拷貝數(shù)。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測(cè)的DNA樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號(hào),通過檢測(cè)信號(hào)的有無、強(qiáng)弱可以對(duì)樣品定性、定量,從而計(jì)算出轉(zhuǎn)入的拷貝數(shù)。Southern法準(zhǔn)確性高、特異性強(qiáng),但存在費(fèi)時(shí)費(fèi)力的缺點(diǎn)。另外,由于Southern法檢測(cè)不經(jīng)過靶片段的擴(kuò)增(PCR),一般每個(gè)電泳通道需要10-30μg的DNA,在實(shí)際操作中就需要較大量的植物材料來提取DNA,而轉(zhuǎn)基因植物的愈傷組織在無菌條件下經(jīng)過篩選、重新分化后一般都比較細(xì)弱,不宜大量取樣。如果外源基因在插入時(shí)發(fā)生基因重組,造成限制性酶切位點(diǎn)丟失,Southern法也無法檢測(cè)到。這些因素都制約了Southern法在T0代轉(zhuǎn)基因植物中檢測(cè)外源基因拷貝數(shù)的應(yīng)用。杭州基因療法載體拷貝數(shù)政策