錳氧化褐黃海水菌(Fulvimarinamanganoxydans)是一種具有特定代謝功能的海洋細(xì)菌,它能夠?qū)⒖扇苄缘亩r錳離子(Mn(II))氧化為不溶性的高價錳氧化物。這一過程對海洋環(huán)境中的錳循環(huán)具有重要作用。以下是關(guān)于錳氧化褐黃海水菌的一些關(guān)鍵信息:1.**分類與特性**:錳氧化褐黃海水菌屬于Fulvimarina屬,是一種模式菌株,具有生物危害程度為四類,表明其對人類、動植物或環(huán)境可能構(gòu)成風(fēng)險。2.**培養(yǎng)條件**:這種細(xì)菌的培養(yǎng)溫度為30℃,需要在需氧條件下生長,通常使用2216E培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng)。3.**分離來源**:錳氧化褐黃海水菌開始是從西南印度洋的熱液羽流中分離得到的。4.**基因組信息**:錳氧化褐黃海水菌的全基因組序列為FWXR00000000.1,這為研究其氧化機(jī)制和生物學(xué)特性提供了重要資源。5.**生理功能**:研究表明,錳氧化褐黃海水菌通過其代謝活動,能夠促進(jìn)Mn(II)的氧化,生成的錳氧化物為空心球狀。這一過程可能涉及到微生物和光的共同作用,其中細(xì)菌產(chǎn)生的超氧自由基與二價錳離子發(fā)生反應(yīng),占總氧化量的86±2.7%??剐晕U菌作為異養(yǎng)型細(xì)菌,在生長過程中需要氧氣,不需要陽光,接觸酶反應(yīng)陽性,氧化酶反應(yīng)陰性。絳紅鏈霉菌菌株
巨大芽孢桿菌(Bacillusmegaterium)是一種革蘭氏陽性細(xì)菌,具有以下特點:1.**形態(tài)特征**:巨大芽孢桿菌的菌體呈桿狀,末端圓,單個或呈短鏈排列。大小約為1.2-1.5×2.0-4.0微米。它們能形成橢圓形的芽孢,中生或次端生,芽孢大小約為1.0-1.2×1.5-2.0微米。2.**培養(yǎng)特性**:巨大芽孢桿菌在營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基上形成不多于1個的抗熱芽孢,為中生到端生,形狀為橢圓形或圓形不等。菌落生長豐富,不擴(kuò)展,有光澤或較暗,有時微皺,生長后期一般帶黃色,長時間培養(yǎng)生長物和培養(yǎng)基可變成褐色或黑色。3.**應(yīng)用價值**:巨大芽孢桿菌在工業(yè)上用于生產(chǎn)葡萄糖異構(gòu)酶,并且在回收貴重金屬方面有著重要作用。它們還能降解土壤中難溶的含磷化合物,使之成為作物能吸收的可溶物。巨大芽孢桿菌與球形芽孢桿菌混合培養(yǎng)時具有固氮增效作用,非常適合制成微生物肥料。4.**環(huán)境適應(yīng)性**:巨大芽孢桿菌屬于耐熱嗜冷菌,也是兼性厭氧菌,能在不同的環(huán)境條件下生長,包括溫暖的水中, 適生長溫度為28℃,有些菌株在5℃也可生長,比較大生長溫度為38-41℃。5.**生物防治作用**:巨大芽孢桿菌在植物病害生物防治中具有重要作用,能夠產(chǎn)生拮抗性或競爭性的代謝產(chǎn)物,抑制病原菌生長或殺死病原菌。多粘類芽胞桿菌菌株在某些情況下,這些微生物不僅能夠產(chǎn)生紅色素,還可能含有一種叫做細(xì)菌視紫紅質(zhì)的蛋白質(zhì)。
遲鈍水桿形菌(Undibacteriumpigrum)是一種革蘭氏陰性桿菌,具有以下特點:1.**分類學(xué)信息**:遲鈍水桿形菌屬于細(xì)菌域,其拉丁學(xué)名為Undibacteriumpigrum,原始編號為DSM19792,來源于德國的飲用水。2.**形態(tài)特征**:該菌為G-桿菌,周身鞭毛,有動力,無芽孢,無莢膜。在血平板上35℃培養(yǎng)18-24小時后,可以形成圓形、濕潤、凸起、光滑、灰白色的菌落,有些可形成黏液型菌落。在麥康凱上形成無色半透明、濕潤、光滑的菌落。3.**生化反應(yīng)**:遲鈍水桿形菌的氧化酶(-)、TSI為K/A、IMViC為++--,發(fā)酵葡萄糖,不發(fā)酵乳糖和甘露醇,硫化氫(+)。4.**培養(yǎng)條件**:遲鈍水桿形菌的培養(yǎng)溫度為25℃,使用的培養(yǎng)基為0908號培養(yǎng)基。5.**分離來源**:該菌株開始是從瑞典的飲用水中分離出來的。6.**生物安全等級**:遲鈍水桿形菌的生物安全等級為1級,屬于低風(fēng)險微生物。7.**菌株用途**:作為模式菌株,遲鈍水桿形菌主要用于分類學(xué)研究和教學(xué)。8.**保藏信息**:該菌株被多個機(jī)構(gòu)保藏,包括DSMZ、CCUG49009和CIP109318。9.**Genbank序列信息**:遲鈍水桿形菌的Genbank序列登錄號為AM397630。
格木慢生根瘤菌(B)是一種與格木(一種豆科植物)共生的根瘤菌。根據(jù)搜索結(jié)果,以下是格木慢生根瘤菌的一些特點和應(yīng)用:1.**遺傳多樣性**:研究表明,格木根瘤菌具有很大的遺傳多樣性,通過限制性酶切片段長度多態(tài)性(RFLP)分析16S-23SIGS序列,將166株根瘤菌分為22個型。2.**分類地位**:格木根瘤菌被分為4個種群,主要是Bradyrhizobiumelkanii和Bradyrhizobiumpachyrhizi這兩個優(yōu)勢種群,以及Bradyrhizobiumyuanmingense和一個潛在的新種群Bradyrhizobiumsp.I作為次要種群。3.**進(jìn)化分析**:進(jìn)化動力分析結(jié)果表明基因突變和縱向遺傳是格木慢生根瘤菌進(jìn)化的主要推動力。4.**共生基因**:結(jié)瘤基因nodC和固氮基因nifH序列的系統(tǒng)發(fā)育分析將格木根瘤菌分為5-6個分支,分類結(jié)果與持家基因結(jié)果較一致,表明共生基因與持家基因呈共進(jìn)化關(guān)系。5.**土壤理化因子相關(guān)性**:根瘤菌的種群分布特征與土壤理化因子相關(guān)性分析結(jié)果表明,B.elkanii的菌株偏好酸性土壤,且土壤pH與B.elkanii的分布呈正相關(guān)。在培養(yǎng)條件方面,小鼠小短桿菌的培養(yǎng)溫度為28℃,資源保藏類型為培養(yǎng)物。保存方法包括液氮低溫凍結(jié)法等。
溫泉水桿狀菌(Aquifexpyrophilus)是一種嗜熱的細(xì)菌,通常在溫泉這類高溫環(huán)境中被發(fā)現(xiàn)。以下是它們在生物修復(fù)中的一些具體應(yīng)用:1.**有機(jī)污染物的降解**:溫泉水桿狀菌能夠降解有機(jī)污染物,如在騰沖溫泉中分離出的Anoxybacillussp.YIM342,能產(chǎn)生一種新穎的α-淀粉酶,這種酶在生物燃料、洗滌劑及食品工業(yè)中具有潛在的應(yīng)用價值。2.**砷的生物轉(zhuǎn)化**:從騰沖熱海地?zé)釁^(qū)SRBZ溫泉水樣中分離出的AnoxybacillusflavithermusTCC9-4,能產(chǎn)生AsIII氧化酶,在化學(xué)自養(yǎng)條件下,能氧化90%以上的100mg/LAsIII,這表明溫泉中的微生物可能參與了硫砷酸鹽的形成,為硫砷酸鹽在陸地地?zé)岘h(huán)境中分布提供了一種可能的解釋。3.**硫循環(huán)的參與**:在騰沖地?zé)岬貐^(qū)的大滾鍋2號溫泉中分離得到的脫硫腸狀菌屬菌株Desulfotomaculumsp.TC-1,其基因組成功擴(kuò)增出編碼厭氧亞砷酸氧化酶的arxA基因,表明嗜熱微生物可能參與了硫砷酸鹽的形成。4.**微生物介導(dǎo)的砷氧化反應(yīng)**:AnoxybacillusflavithermusTCC9-4的研究拓展了目前對于微生物介導(dǎo)的砷氧化反應(yīng)的理解,這對于砷污染的環(huán)境修復(fù)具有重要意義。
雙氮慢生根瘤菌的固氮活性可能會隨著溫度的變化而變化。在適宜的溫度范圍內(nèi),固氮作用更為有效。絳紅鏈霉菌菌株
慢生新鞘氨醇菌(Novosphingobiumsp.)是鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)中的一種,具有以下特點:1.**革蘭氏陰性菌**:慢生新鞘氨醇菌是一種革蘭氏陰性菌,無孢子,以單側(cè)生極性鞭毛運(yùn)動,多呈黃色。2.**專性需氧**:這種細(xì)菌是專性需氧的,能產(chǎn)生過氧化氫酶,并且能夠?qū)⑽焯?、己糖及二糖轉(zhuǎn)變成酸。3.**環(huán)境污染物降解**:慢生新鞘氨醇菌在環(huán)境污染物的降解中具有重要作用,尤其是對多環(huán)芳烴(PAHs)等大分子的降解。4.**抗逆性**:它們可以在高度貧氧和惡劣條件下生長,表明它們具有較強(qiáng)的抗逆性。5.**次級代謝產(chǎn)物**:慢生新鞘氨醇菌能產(chǎn)生威蘭膠等次級代謝產(chǎn)物,這些產(chǎn)物在食品、醫(yī)藥、石油開采等領(lǐng)域有廣泛應(yīng)用。6.**基因組和蛋白質(zhì)組研究**:通過整合基因組和蛋白質(zhì)組方法分析,慢生新鞘氨醇菌對環(huán)境污染物如17β-雌二醇(E2)的適應(yīng)性反應(yīng)和代謝策略得到了研究。7.**生物修復(fù)中的應(yīng)用**:慢生新鞘氨醇菌在生物修復(fù)領(lǐng)域具有潛在的應(yīng)用價值,包括在降解環(huán)境污染物、抗氧化衰老、與植物互作等領(lǐng)域。8.**群體感應(yīng)調(diào)控系統(tǒng)**:研究了慢生新鞘氨醇菌US6-1在降解多環(huán)芳烴過程中的群體感應(yīng)(QuorumSensing,QS)系統(tǒng),以及其在細(xì)胞間的信息交流系統(tǒng)中的功能。絳紅鏈霉菌菌株