在報(bào)告基因檢測(cè)(也稱為信號(hào)通路檢測(cè))中,報(bào)告蛋白的序列編碼是在相關(guān)通路的轉(zhuǎn)錄控制下引入的。通過(guò)熒光或光學(xué)讀數(shù)監(jiān)測(cè)報(bào)告基因的表達(dá),通過(guò)這些指標(biāo)來(lái)間接反應(yīng)啟動(dòng)子的或抑制程度。觀察到的信號(hào)是整個(gè)通路的產(chǎn)物,篩選的化合物可以在該通路上的任何點(diǎn)相互作用。常見的報(bào)告基因是CAT(氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶)、GAL(β-半乳糖苷酶)、LAC(β-內(nèi)酰胺酶)、LUC(熒光素酶)和GFP。我們通常使用的為L(zhǎng)UC(熒光素酶),但也可以使用其他報(bào)告基因。藥物高通量篩選平臺(tái)。重慶高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)
化合物庫(kù)的質(zhì)量包括三個(gè)方面:多樣性、有效濃度、化合物庫(kù)大小?;衔飵?kù)的多樣性制約著苗頭化合物的新穎性,而化合物的有效濃度則影響著活性化合物的檢出概率。因此化合物庫(kù)的多樣性越大,化合物的有效濃度越高意味著苗頭化合物檢出率更有保證。但是兩者之前需要有一個(gè)平衡,一個(gè)化合物庫(kù)里單一化合物簇(Cluster)維持在4~12個(gè)化合物的時(shí)候,多樣性和有效濃度都能得到保障。另外,對(duì)于化合物庫(kù)大小而言,理論情況下(基于多樣性、有效濃度以及靶點(diǎn)的成藥難度基本一致的隨機(jī)篩選而言),大的化合物庫(kù)有利于發(fā)現(xiàn)更多的苗頭化合物。但是基于此次有限的匯總數(shù)據(jù)來(lái)看(有4個(gè)化合物庫(kù)達(dá)到了百萬(wàn)級(jí)(0.6M~1.8M)),定向化合物庫(kù)(FocusLibrary)(圖七中紅色圈部分)由于其自身的特點(diǎn)檢出率較好,而大的化合物庫(kù)并沒有帶來(lái)更高的苗頭化合物檢出率以及更高質(zhì)量的苗頭化合物福建高通量篩選報(bào)價(jià)高通量篩選技術(shù)的方法有哪些。
高通量篩選(Highthroughputscreening,HTS)技術(shù)包括機(jī)器人技術(shù)、液體處理器、數(shù)據(jù)處理、相當(dāng)多的軟件和敏感的檢測(cè)系統(tǒng)。它是一種藥物發(fā)現(xiàn)過(guò)程,可以使生化或細(xì)胞事件能夠重復(fù)和快速測(cè)試化合物數(shù)十萬(wàn)次。HTS可根據(jù)待測(cè)樣品的種類大致分為細(xì)胞水平篩選和分子水平篩選兩類。細(xì)胞水平篩選是在細(xì)胞個(gè)體水平上完成的檢測(cè),由于含有諸如信號(hào)傳導(dǎo)、物質(zhì)代謝等關(guān)于細(xì)胞生命活動(dòng)的信息,因此可以省去體外篩選中的許多步驟。下面將圍繞細(xì)胞水平篩選介紹幾種常用的檢測(cè)方法:離子通道檢測(cè)、報(bào)告基因檢測(cè)和細(xì)胞增殖檢測(cè)。
高通量篩選的特色效用高通量篩選技術(shù)是將多種技術(shù)方法有機(jī)結(jié)合而形成的一種新技術(shù)體系,它以微板形式作為實(shí)驗(yàn)工具載體,以自動(dòng)化操作系統(tǒng)執(zhí)行實(shí)驗(yàn)過(guò)程,以靈敏快速的檢測(cè)儀器采集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),以計(jì)算機(jī)對(duì)數(shù)以千計(jì)的樣品數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,從而得出科學(xué)準(zhǔn)確的實(shí)驗(yàn)結(jié)果和特色效用。英國(guó)學(xué)者AlanD研究提示,一個(gè)實(shí)驗(yàn)室采用傳統(tǒng)的方法,借助20余種藥物作用靶位,1年內(nèi)能篩選75000個(gè)樣品;1997年高通量篩選技術(shù)發(fā)展初期,采用100余種靶位,每年可篩選100萬(wàn)個(gè)樣品;1999年高通量篩選技術(shù)進(jìn)一步完善后,每天的篩選量就高達(dá)10萬(wàn)種化合物。高通量篩選菌種技術(shù)。
藥物研發(fā)與開發(fā)是一個(gè)復(fù)雜與漫長(zhǎng)的過(guò)程,特別是小分子藥物的研發(fā),其難點(diǎn)和關(guān)鍵在于如何快速高效的找到先導(dǎo)化合物(LeadCompound)。采用高通量藥物篩選(High-throughputscreening,HTS)來(lái)發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物仍然是小分子藥物研發(fā)的優(yōu)先。傳統(tǒng)藥物篩選是一個(gè)耗時(shí)長(zhǎng)且昂貴的過(guò)程,一般需要消耗大量的樣品和實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,對(duì)技術(shù)人員的操作技能有較高要求,難以在短時(shí)間內(nèi)對(duì)一定數(shù)量的樣品開展有效和經(jīng)濟(jì)的篩選。隨著各類化合物樣品庫(kù)儲(chǔ)量的不斷增加以及組合化學(xué)技術(shù)的應(yīng)用,采用傳統(tǒng)手段篩選海量樣品不僅不可能而且極大地限制了新藥研究之進(jìn)程。高通量篩選的技術(shù)優(yōu)點(diǎn)。重慶高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)
高通量篩選的前提是什么。重慶高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)
一種廣泛應(yīng)用的HTS技術(shù)是熒光各向異性(FA)/熒光偏振光(FP)。FA和FP方法實(shí)際上通過(guò)測(cè)量了染料所經(jīng)歷的旋轉(zhuǎn)相關(guān)時(shí)間或翻滾時(shí)間的變化來(lái)表征分子量。在這些技術(shù)中,用偏振光激發(fā)熒光團(tuán),并用平行或垂直于入射光偏振的偏振器測(cè)量熒光發(fā)射。隨著時(shí)間的推移,染料標(biāo)記的分子下降,發(fā)射信號(hào)去極化。與大分子結(jié)合降低了熒光團(tuán)的遷移率,從而增加了極化或各向異性,并允許定量結(jié)合。根據(jù)所涉及的質(zhì)量,選擇染料的壽命以比較大化結(jié)合后的信號(hào)變化。熒光素和羅丹明等有機(jī)染料的壽命約為3-4ns,它們?cè)谶B接到分子量在0.5-10kDa范圍內(nèi)的生物分子時(shí)為敏感。重慶高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)