高通量篩選技術(shù),是目前藥物篩選領(lǐng)域研究的重要課題,近年來,對(duì)它的研究應(yīng)用雖然已取得了長(zhǎng)足的發(fā)展,但仍然存在許多難題,如體外模型的篩選結(jié)果與整體藥理作用的關(guān)系;對(duì)高通量篩選模型的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)以及新的藥物作用靶點(diǎn)的研究和發(fā)現(xiàn)等。隨著醫(yī)藥學(xué)的進(jìn)步,高通量篩選技術(shù)在創(chuàng)新藥物的研發(fā)中,一定會(huì)開拓出更廣闊的空間。我國(guó)進(jìn)行藥物高通量篩選的優(yōu)勢(shì)首先是化合物來源,且多為天然;其次是對(duì)化合物生物活性的篩選目的較明確,無目的合成的化合物較少;第三,我國(guó)傳統(tǒng)藥物為篩選研究提供了一個(gè)巨大的資源庫(kù),可從中藥中提取分離篩選新的化合物。這些優(yōu)勢(shì)為藥物的高通量篩選打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。高通量篩選是什么平臺(tái)。天津vegf高通量篩選
開發(fā)一種新藥的過程可能是漫長(zhǎng)、復(fù)雜和不確定的,但從社會(huì)、科學(xué)和經(jīng)濟(jì)的角度來看,它也可能是高回報(bào)的。高通量篩選(HTS)已經(jīng)成為藥物發(fā)現(xiàn)的主要工具。,向大家介紹目前用于靶標(biāo)確認(rèn)的幾種HTS方法,主要分為兩大類:生化水平和細(xì)胞水平。生化水平分析包括比率熒光法(FA/FP)、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)、時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)等;細(xì)胞水平的分析包括細(xì)胞活力、報(bào)告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。生化篩選利用純化的目標(biāo)蛋白,在體外測(cè)定配體的結(jié)合或酶活性的抑制。這些檢測(cè)通常在384孔板中以競(jìng)爭(zhēng)的形式進(jìn)行,其中所研究的化合物必須取代已知的配體或底物。湖南高通量篩選小分子庫(kù)高通量篩選菌種是什么。
高通量篩選的實(shí)驗(yàn)方法必須具備條件穩(wěn)定,樣本之間差異性小,容易檢測(cè),且可以大批量同時(shí)檢測(cè)等特性。除了以上介紹的三種較為常用的方法之外,第二信使檢測(cè)、細(xì)胞活力檢測(cè)等方法也是常用的細(xì)胞水平的檢測(cè)手段。化合物庫(kù)的使用在篩選前期也起著十分重要的作用。在化合物未知的情況下,數(shù)量足夠大的化合物庫(kù)可增加識(shí)別目標(biāo)的概率;不同細(xì)分用途的化合物庫(kù),則能進(jìn)一步整合具有某項(xiàng)作用的盡可能多的化合物。MCE對(duì)不同方向、不同種類、性質(zhì)不同的化合物做了詳細(xì)分類,如生物活性化合物庫(kù)、FDA上市庫(kù)、天然產(chǎn)物庫(kù)等可以供不同需求的科學(xué)家選擇。隨著技術(shù)的發(fā)展,MCE化合物庫(kù)數(shù)量會(huì)越來越多,分類也越來越精細(xì),這將節(jié)約前期篩選合適化合物所需的時(shí)間。此外,MCE還可以根據(jù)你的不同需求提供定制庫(kù)~
時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)原理為具有長(zhǎng)壽命熒光(通常為100秒的毫秒至毫秒)的鑭系配合物用作FRET供體,熒光蛋白或有機(jī)熒光團(tuán)(例如,別藻藍(lán)素或Cy5)用作受體。普通熒光的半衰期為納秒級(jí),鑭系元素的半衰期為毫秒級(jí),有6個(gè)數(shù)量級(jí)的差別。所以在檢測(cè)時(shí),TR-FRET有一個(gè)時(shí)間延遲~100微秒,從而使反應(yīng)體系內(nèi)普通背景熒光信號(hào)消耗掉,因此TR-FRET的背景信號(hào)非常低,能夠反映樣品實(shí)際情況?;诩?xì)胞水平的篩選的關(guān)鍵特征之一是可以一次篩選多個(gè)靶標(biāo)?;诩?xì)胞的篩選常用于以下情況下:1)所需的分子靶標(biāo)未知,2)靶標(biāo)無法在生化測(cè)定中充分重組,3)所需的表型只存在于細(xì)胞環(huán)境中,例如從一種細(xì)胞類型分化到另一種細(xì)胞類型?;诩?xì)胞的檢測(cè)貫穿于藥物發(fā)現(xiàn)的所有階段:靶標(biāo)選擇和驗(yàn)證、初步篩選、先導(dǎo)化合物識(shí)別、先導(dǎo)化合物優(yōu)化以及安全和毒理學(xué)篩選。介紹一些細(xì)胞水平分析的方法:細(xì)胞活力、報(bào)告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。高通量篩選包含什么。
化合物庫(kù)的質(zhì)量包括三個(gè)方面:多樣性、有效濃度、化合物庫(kù)大小?;衔飵?kù)的多樣性制約著苗頭化合物的新穎性,而化合物的有效濃度則影響著活性化合物的檢出概率。因此化合物庫(kù)的多樣性越大,化合物的有效濃度越高意味著苗頭化合物檢出率更有保證。但是兩者之前需要有一個(gè)平衡,一個(gè)化合物庫(kù)里單一化合物簇(Cluster)維持在4~12個(gè)化合物的時(shí)候,多樣性和有效濃度都能得到保障。另外,對(duì)于化合物庫(kù)大小而言,理論情況下(基于多樣性、有效濃度以及靶點(diǎn)的成藥難度基本一致的隨機(jī)篩選而言),大的化合物庫(kù)有利于發(fā)現(xiàn)更多的苗頭化合物。但是基于此次有限的匯總數(shù)據(jù)來看(有4個(gè)化合物庫(kù)達(dá)到了百萬級(jí)(0.6M~1.8M)),定向化合物庫(kù)(FocusLibrary)(圖七中紅色圈部分)由于其自身的特點(diǎn)檢出率較好,而大的化合物庫(kù)并沒有帶來更高的苗頭化合物檢出率以及更高質(zhì)量的苗頭化合物高通量篩選樣品用量。黑龍江co2高通量篩選
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在報(bào)告基因檢測(cè)(也稱為信號(hào)通路檢測(cè))中,報(bào)告蛋白的序列編碼是在相關(guān)通路的轉(zhuǎn)錄控制下引入的。通過熒光或光學(xué)讀數(shù)監(jiān)測(cè)報(bào)告基因的表達(dá),通過這些指標(biāo)來間接反應(yīng)啟動(dòng)子的或抑制程度。觀察到的信號(hào)是整個(gè)通路的產(chǎn)物,篩選的化合物可以在該通路上的任何點(diǎn)相互作用。常見的報(bào)告基因是CAT(氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶)、GAL(β-半乳糖苷酶)、LAC(β-內(nèi)酰胺酶)、LUC(熒光素酶)和GFP。我們通常使用的為L(zhǎng)UC(熒光素酶),但也可以使用其他報(bào)告基因。天津vegf高通量篩選
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