磁珠法核酸提取過程中的常見誤區(qū)--和某種試劑盒比對(duì)效果不好就是磁珠不好很多客戶在篩選磁珠過程中都是在已經(jīng)成熟試劑體系下,簡(jiǎn)單地等量替換磁珠,用于比較磁珠效果。這樣就會(huì)很容易得出某種磁珠效果不好的結(jié)論,但實(shí)際上,由于不同磁珠適合的體系和用量是不同的,往往需要調(diào)整過后才能獲得更好的提取效果。磁珠的種類是多種多樣的,粒徑大小不同,分散性不同,磁響應(yīng)時(shí)間不同,包被基礎(chǔ)基質(zhì)不同,外層修飾官能團(tuán)不同,包被密度不同,官能團(tuán)臂長不同,會(huì)導(dǎo)致磁珠特性千差萬別。所以不同磁珠所適應(yīng)的實(shí)驗(yàn)和體系也是不同的。就像同樣是核酸提取的試劑,配方也并不完全相同,同樣應(yīng)用于核酸提取的磁珠,性質(zhì)也并非完全一致。有的磁珠在常量核酸提取中表現(xiàn)出了更高的吸附效率,有的磁珠更適用于微量核酸提取。有的磁珠適合偏酸性系列的試劑體系,有的磁珠適合偏堿性系列的試劑體系。大腸桿菌殘留核酸提取。鄭州病毒核酸提取方法學(xué)
如何評(píng)估磁珠法核酸提取產(chǎn)品的提取效果,可以從以下角度進(jìn)行相關(guān)產(chǎn)品的性能評(píng)估:Purity(純度),具體而言就是磁珠提取后的核酸中含有多少非核酸類的雜質(zhì)殘留,如蛋白、鹽、多糖等。該指標(biāo)通常用吸光度比值(A260/A280和A260/A230)來衡量。Quality(質(zhì)量),磁珠提取后的核酸尤其是較長的基因組核酸應(yīng)保持其完整性,不應(yīng)出現(xiàn)斷裂或降解等現(xiàn)象。該指標(biāo)可通過簡(jiǎn)單的凝膠電泳或者復(fù)雜一些的特定PCR及微流控芯片(如AgilentBioanalyzer)進(jìn)行評(píng)估。Recovery(收率),磁珠提取過程應(yīng)當(dāng)盡量將所有的核酸都能從樣本中提取出來。高收率對(duì)于核酸檢測(cè)尤其是疾病早期檢測(cè)的靈敏度至關(guān)重要,在疾病早期,樣本中的病原體核酸含量通常較低,如果不能高效率地提取到所有核酸,那么很容易出現(xiàn)假陰性,導(dǎo)致漏檢。廣州復(fù)制型逆轉(zhuǎn)錄病毒核酸提取注意事項(xiàng)宿主細(xì)胞殘留核酸提取過程中有哪些注意事項(xiàng)?
磁珠是利用一定的組織包被中心四氧化三鐵而形成的可以被磁鐵吸附,同時(shí)有能通過表面包被物吸附(結(jié)合)核酸的小珠子。小珠子的用途很大!它可以實(shí)現(xiàn)核酸提取的自動(dòng)化和高通量化,避免人工操作引起的差異及錯(cuò)誤,結(jié)果穩(wěn)定,重復(fù)性好。磁珠一般分為三層結(jié)構(gòu):蕞內(nèi)層:為支持結(jié)構(gòu),如聚苯乙烯做的內(nèi)核;中間層:磁層,作用是與磁力架上的磁鐵相互吸附,從而分離核酸與反應(yīng)溶液,材料通常為Fe3O4;蕞外層:修飾層,一般為帶負(fù)電的基團(tuán);
傳統(tǒng)核酸提取方法和磁珠法核酸提取的優(yōu)缺點(diǎn)比較:傳統(tǒng)核酸提取法磁珠法技術(shù)簡(jiǎn)單高質(zhì)量、高通量手工提取自動(dòng)化流程操作繁瑣、費(fèi)時(shí)費(fèi)力免去了復(fù)雜的人工提取不適合大量樣品核酸提取減少酚類、氯仿等有機(jī)試劑對(duì)操作人員傷害不適合臨床分子診斷極大滿足如今對(duì)核酸提取效率的需求
隨著基因檢測(cè)、個(gè)性化給藥、產(chǎn)前診斷等的普及,在生物行業(yè)各領(lǐng)域都追求高通量、自動(dòng)化的如今,傳統(tǒng)核酸提取方法的局限愈來愈明顯,而磁珠法核酸提取的優(yōu)勢(shì)則愈來愈明顯:R能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)化、大批量操作;R不使用傳統(tǒng)方法中的苯、氯仿等有毒試劑,安全無毒完全符合現(xiàn)代環(huán)保理念;R與核酸的特異性結(jié)合使得提取的核酸純度高、濃度大。R操作簡(jiǎn)單、用時(shí)短;R穩(wěn)定可靠:避免人工操作引起的差異及錯(cuò)誤,結(jié)果穩(wěn)定,重復(fù)性好; 宿主細(xì)胞殘留核酸提取相關(guān)操作步驟。
核酸提取效果不好,多加點(diǎn)磁珠?有很多實(shí)驗(yàn)者喜歡在提取效果不佳的時(shí)候,增加磁珠的用量,認(rèn)為磁珠多加一點(diǎn),就能吸上更多的核酸,不得不說這種想法是不可取的。過多的磁珠將因?yàn)闊o法均勻分散于液體中,而喪失其分散的特性,也使得洗滌過程中無法充分增加核酸磁珠和液體接觸的效率。而且過多的磁珠也會(huì)吸附更多的雜質(zhì),對(duì)除雜效果影響很大。甚至有些時(shí)候,過多的磁珠會(huì)吸附蛋白酶、溶菌酶等在液體體系中起主要作用的功能成分,導(dǎo)致整個(gè)試劑盒效率低下。有很多時(shí)候,在提取效果不佳的時(shí)候,減少磁珠使用量,反而是提升提取效果的途徑。很多實(shí)驗(yàn)人員在篩選試劑過程中都是在已經(jīng)成熟磁珠體系下,簡(jiǎn)單地等量替換試劑,用于比較試劑效果。這樣就會(huì)很容易得出某種試劑效果不好的結(jié)論,但實(shí)際上,由于不同試劑適合的體系和用量是不同的,往往需要調(diào)整過后才能獲得更好的提取效果??偠灾?,在使用磁珠進(jìn)行核酸提取時(shí),合適的試劑配合適量的磁珠,才能達(dá)到好的核酸提取效果。南京正揚(yáng)支原體核酸提取試劑盒對(duì)樣品的需求量是多少?鄭州支原體DNA提取公司
南京正揚(yáng)宿主細(xì)胞殘留核酸提取試劑盒的裝量是多少?鄭州病毒核酸提取方法學(xué)
磁珠法核酸提取常見問題之核酸得率低:核酸得率低的可能原因:①磁珠吸附能力較弱,只能結(jié)合溶液中少量的核酸;②磁珠洗脫方法不正確導(dǎo)致核酸洗脫效率較弱;③所使用的提取試劑(pH、鹽、醇)與該磁珠不匹配;④樣品對(duì)所用提取試劑有抑制;核酸得率低的解決辦法:①改變表面基團(tuán)種類及密度;②減少洗脫前的干燥時(shí)間;③洗脫時(shí)將樣品至于56℃孵育,加熱促進(jìn)核酸洗脫;④優(yōu)化試劑配方,使配方與所選磁珠相匹配;④更換與提取試劑匹配的磁珠;鄭州病毒核酸提取方法學(xué)