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北京IdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

來源: 發(fā)布時間:2024-07-09

Genovis的FabDELLO在鉸鏈上方的單個位點(diǎn)消化人IgG1,并在兩小時內(nèi)生成均質(zhì)的Fab和Fc片段(Genovis的IdeS在鉸鏈區(qū)下方的單個位點(diǎn)進(jìn)行消化)。生成的片段可用于結(jié)晶和高階結(jié)構(gòu)(HOS)的NMR研究、結(jié)合研究等。突變的鉸鏈區(qū)域是zhiliao性候選抗體的常見修飾,以降低效應(yīng)器功能。這些突變可能會影響具有高底物特異性的酶的抗體消化效率。例如,高度特異性的FabRICATOR(IdeS)消化效率對含有常見LALA突變的抗體產(chǎn)生負(fù)面影響。FabDELLO作用于人IgG1鉸鏈上方的單個暴露賴氨酸殘基,能夠?qū)哂型蛔冦q鏈區(qū)域的抗體進(jìn)行流行的中級LC-MS分析。例如,用FabDELLO消化市售的IgG1risankizumab,在下鉸鏈區(qū)域具有LALA突變,并通過反相LC-MS進(jìn)行分析。消化產(chǎn)生均勻的Fab和Fc片段。用20mMDTT還原片段,用于中級LC-MS分析,發(fā)現(xiàn)產(chǎn)生了均相的Fc/2、輕鏈(LC)和Fd片段。用FabDELLO消化后觀察到的定義峰顯示出均勻的片段生成和酶的穩(wěn)健性能??上q鏈下方單個氨基酸位點(diǎn)的抗體,產(chǎn)生均質(zhì)的 F(ab')2 和 Fc 片段。北京IdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

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當(dāng)你應(yīng)用像肽圖這樣的方法時,你可以從Genovis中級方法中獲得的信息量就沒有那么多了。一個主要的區(qū)別是你不能像在肽水平上那樣將修改定位到單個氨基酸。然而,中級分析比肽圖譜具有快速和簡單的巨大優(yōu)勢,因?yàn)樾枰治龅纳V峰要少得多,數(shù)據(jù)處理任務(wù)要簡單得多。此外,在中級實(shí)驗(yàn)中,手工實(shí)驗(yàn)步驟要少得多,F(xiàn)abALACTICA(IdeS)酶切消化方法不需要針對不同的人體IgG1進(jìn)行優(yōu)化。一旦在氨基酸水平上進(jìn)行了PTM表征,我們非常認(rèn)為中級表征肽圖的一種補(bǔ)充方法,可以在更常規(guī)的基礎(chǔ)上應(yīng)用。中級分析更適用于高通量或監(jiān)測類型的方法,并可用于支持肽圖分析。江西GlycINATORIdeS蛋白酶抗體酶切含有富含甘氨酸的連接子的各種mAb片段進(jìn)行詳細(xì)表征的中級方法。

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Genovis的FabRICATOR Fab2 (IdeS)試劑盒可消化兔 IgG,但要在親和步驟中捕獲 Fc 片段,您需要另一種填料,而不是試劑盒中通常包含的 CaptureSelect? Fc。如果您對處理兔IgG感興趣,請聯(lián)系Genovis團(tuán)隊(duì),我們將在FabRICATOR Fab2試劑盒中提供與兔Fc相容的樹脂色譜柱。使用FabRICATOR的抗體消化的簡單性、速度和可重復(fù)性也意味著這種酶可以被用于質(zhì)量控制應(yīng)用。 QC方法需要執(zhí)行簡單,易于訓(xùn)練,高度可重復(fù),數(shù)據(jù)易于分析,這正是您使用FabRICATOR所得到的。 因?yàn)樗m用于一系列不同的IgG,這也意味著使用FabRICATOR進(jìn)行QC工作的客戶將能夠在未來的產(chǎn)品中使用它。 這顯示了這種酶在抗體消化中是多么的有效。

與IdeS不同,為了獲得更均勻的度拉糖肽融合蛋白的消化產(chǎn)物,用Genovis的GlySERIAS固定化蛋白質(zhì)消化該蛋白質(zhì),該蛋白由與瓊脂糖珠共價偶聯(lián)的GlySERIAS酶組成。通過將酶偶聯(lián)到樹脂上,可以增加酶與蛋白質(zhì)的比率,從而可以進(jìn)一步加速反應(yīng),以獲得更完整的連接子消化。此外,該酶不會存在于樣品制備中,可能會干擾樣品分析。為了進(jìn)行比較,度拉糖肽在37°C下用GlySERIAS固定化過夜,或用GlySERIAS凍干1小時并在37°C下過夜消化。 為了降低樣品復(fù)雜性,使用內(nèi)切糖苷酶GlycINATOR凍干去除Fc聚糖,并減少鏈間二硫鍵。通過反相LC-MS對樣品的分析表明,GlySERIAS Immobilized幾乎完全消化了Fc結(jié)構(gòu)域中的連接子,留下了接近均質(zhì)的Fc/2產(chǎn)物,其中含有來自連接子的一個絲氨酸殘基。用 GlySERIAS 凍干 1 小時或過夜消化,兩者都會產(chǎn)生幾種 Fc 產(chǎn)物,并附著不同數(shù)量的絲氨酸和甘氨酸殘基。GLP-1肽在所有三個樣品中以兩種變體存在。使用GlySERIAS固定化消化的均質(zhì)Fc/2能夠詳細(xì)研究特定于Fc區(qū)域的質(zhì)量屬性。此外,在樣品中未觀察到干擾分析的酶峰。作為補(bǔ)充,F(xiàn)c/2 產(chǎn)物在用 GlySERIAS 凍干消化后殘留部分連接子,有助于研究位于 GS 連接子的修飾。度拉糖肽的連接子中的大量甘氨酸殘基為GlySERIAS提供了許多不同的潛在消化位點(diǎn)。

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與IdeS不同,Genovis的IgASAP是IgA消化酶家族。IgASAPSub1是一種IgA1特異性酶,可在鉸鏈上方的一個特定位點(diǎn)消化人IgA1,而IgASAPSub1+2特異性消化鉸鏈上方的IgA1和IgA2m1。兩種酶都產(chǎn)生完整且均質(zhì)的Fab和Fc片段。IgASAP酶能夠生成完整的單價Fab片段以及IgA的中級分析,從而促進(jìn)IgA的表征,例如,在疫苗、zhiliao和診斷的開發(fā)過程中。獨(dú)特的酶促工具,可實(shí)現(xiàn)IgA的中級表征和質(zhì)量控制;生成均相的Fab和Fc片段,并保留免疫反應(yīng)性;高度特異性–人IgA鉸鏈上方的一個消化位點(diǎn)。Genovis的 IgG 特異性蛋白酶也以固定化酶提供。云南GingisKHANIdeS蛋白酶抗體酶切

融合蛋白的中級分析既可以降低整體樣品的復(fù)雜性,又可以對翻譯后修飾進(jìn)行結(jié)構(gòu)域特異性鑒定和監(jiān)測。北京IdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

與IdeS不同,Romiplostim 由四個相同的血小板生成素 (TPO) 受體結(jié)合肽和一個 Fc 片段組成,通過柔性聚甘氨酸序列連接在一起。與度拉糖肽類似,用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 在 37°C 下過夜,或用 GlySERIAS 凍干 1 小時并在 37°C 下過夜消化該蛋白質(zhì)。 鏈間二硫鍵被還原,以便于通過反相LC-MS進(jìn)行以下分析。與度拉糖肽的觀察結(jié)果類似,用固定化酶消化產(chǎn)生均質(zhì)的 Fc/2,剩下一個連接子殘基,此處為甘氨酸殘基。這有助于識別專門位于Fc區(qū)域的修改。用凍干酶消化 1 小時得到 Fc/2,剩余 4 個甘氨酸殘基和少量的 Fc/2 仍與一個 TPO 肽連接。另一方面,這使得研究 Fc/2 和第yi個肽之間的連接區(qū)域成為可能,而不會受到第二個肽的干擾。用 GlySERIAS 凍干液過夜消化產(chǎn)生 2 個 Fc/2 變體,分別剩下 4 個和 1 個甘氨酸殘基。根據(jù)消化時間的不同,使用凍干產(chǎn)物釋放的肽以五或七種變體存在,接頭中殘留的甘氨酸殘基數(shù)量不同,而使用固定化產(chǎn)物釋放的肽以四種變體存在。北京IdeS蛋白酶蛋白組學(xué)