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我們測(cè)量了FucosEXO從一組dai表不同鍵的不同寡糖底物中釋放的巖藻糖。FucosEXO可有效釋放α1-2、α1-3和α1-4連接的巖藻糖,對(duì)α1-6連接的巖藻糖殘基沒有活Genovis的FucosEXO的底物特異性:巖藻糖以不同的鍵存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 連接的巖藻糖常見于 O-聚糖中,并作為 N-聚糖的天線巖藻糖基化,而 α1-6 連接的巖藻糖被發(fā)現(xiàn)是 N-聚糖he心的修飾。β1-3,4半乳糖的水解:Genovis的GalactEXO 是一種β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-連接末端半乳糖。ImpaRATOR 凍干劑以凍干粉末的形式提供,裝在 2000 單位小瓶中,用于消化 2 mg O-糖基化蛋白。云南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶
Genvois的SialEXO產(chǎn)品是唾液酸酶,用于N-和O-糖基化蛋白的有效去唾液酸化。SialEXO凍干由兩種唾液酸酶組成,每種唾液酸酶都具有獨(dú)特的活性,并且它們同時(shí)起作用。一種酶對(duì)α2-3、α2-6和α2-8連接的唾液酸具有很好的活性,另一種酶(SialEXO 2-3)通過α2-3-鍵快速水解唾液酸。SialEXO凍干可在2小時(shí)內(nèi)去除天然蛋白質(zhì)上的所有唾液酸。SialEXO在天然條件下水解糖蛋白,在pH值范圍為6.5至9時(shí)顯示出活性。這些酶來源于Akkermansia muciniphila,并在大腸桿菌中表達(dá)。兩種酶都含有 His 標(biāo)簽,酶的分子量為 43 kDa 和 66 kDa。 江蘇固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶生物藥物開發(fā)GalactEXO 是一種β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-連接末端半乳糖。
當(dāng)在完整狀態(tài)下進(jìn)行分析時(shí),EPO的聚糖異質(zhì)性導(dǎo)致了非常復(fù)雜的質(zhì)譜圖。通過在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小時(shí),可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如對(duì)應(yīng)于未修飾蛋白質(zhì)的單個(gè)峰所示。EPO上殘留了少量用乙?;僖核嵝揎椀腛-聚糖,因?yàn)镺mniGLYZOR對(duì)這種結(jié)構(gòu)的水解效率低下。根據(jù)制造商Genvois的建議(在37°C下進(jìn)行O/N孵育),兩種底物蛋白也用另一種市售的去糖基化產(chǎn)物處理,并顯示數(shù)據(jù)以供比較。另一方面,N-聚糖在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中翻譯地連接到未折疊的蛋白質(zhì)上。這導(dǎo)致某些 N-糖基化位點(diǎn)難以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折疊成其天然狀態(tài),就根本無法接近。因此,這種N-聚糖的水解需要底物蛋白以與酶活性相容的方式變性。
用于離心柱中糖蛋白去膠基化的固定化酶。Genovis的FucosEXO固定化離心柱含有與瓊脂糖珠共價(jià)偶聯(lián)的FucosEXO酶,用于糖蛋白的去氟糖基化,而不會(huì)用酶污染z終制劑。Microspin 色譜柱可用于 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白的去膠基化。1. 易于使用的離心柱;2. 提高酶與底物的比例,提高消化效率;3. z終樣品中不含酶。有效去除α1-2,3,4連接巖藻糖:分析用復(fù)雜聚糖結(jié)構(gòu)修飾的糖蛋白可能具有挑戰(zhàn)性,需要高效和特異性的酶學(xué)工具。Genovis的FucosEXO 是 α-巖藻糖苷酶的混合物,用于有效水解 N-和 O-糖蛋白或寡糖上的 α1-2、α1-3 和 α1-4 連接的巖藻糖殘基,無需輔助因子或添加O-連接聚糖通常存在于蛋白質(zhì)的暴露位置,因?yàn)樗鼈冊(cè)诘鞍踪|(zhì)折疊發(fā)生后附著。
用于糖蛋白去唾液酸化的凍干酶混合物。Genovis的SialEXO 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 2000 個(gè)單位的小瓶中,用于 2 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 用于方法開發(fā)的靈活格式;2. 可以結(jié)合酶以提高效率;3. 適用于自動(dòng)化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。用于水解ɑ2-3-連接唾液酸的凍干酶。 Genovis的SialEXO 2-3凍干劑以凍干粉末的形式提供,裝在500個(gè)單位的小瓶中,用于0.5mg糖蛋白的去唾液酸化。 與唾液酸酶混合物 SialEXO 相比,SialEXO 2-3 是一種 α2-3 特異性唾液酸酶,允許對(duì) α2-3 連接的唾液酸進(jìn)行靶向分析。O-和N-糖基化蛋白的高效α2-3去唾液酸化可以在1小時(shí)內(nèi)實(shí)現(xiàn)。ImpaRATOR? 可用于多種 O-聚糖結(jié)構(gòu)表征。浙江PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究
采用合適的酶策略來去除這些GalNAc并簡(jiǎn)化生物制藥的表征。云南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶
使用Genovis的GalNAcEXO 對(duì) O-糖基化生物制藥進(jìn)行 Tn 抗原表征:未成熟的截短O-聚糖導(dǎo)致了復(fù)雜生物制藥的異質(zhì)性,使其分析更具挑戰(zhàn)性。 O-聚糖的he心由n-α-GalNAc殘基組成,通過糖苷鍵與絲氨酸或蘇氨酸連接,稱為Tn抗原。 現(xiàn)在,使用GalNAcEXO可以采用合適的酶策略來去除這些GalNAc并簡(jiǎn)化生物制藥的表征。在質(zhì)譜圖中可以觀察到重復(fù)峰的模式。其次,在與GalNAcEXO酶孵育后,剩余的GalNAc殘基被完全去除,留下一個(gè)峰。因此,該工作流程確認(rèn)了 O-糖基化生物制藥上存在 Tn 抗原,并允許定量he心 GalNAc 水平。這種工作流程的另一個(gè)好處是減少了剩余的異質(zhì)性,這有助于確認(rèn)蛋白質(zhì)的完整質(zhì)量,并揭示截短的片段。云南瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶