在CoIP(免疫共沉淀)實(shí)驗(yàn)中,對(duì)照組的設(shè)置對(duì)于驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性至關(guān)重要。對(duì)照組的主要目的是排除非特異性結(jié)合和背景干擾,從而更準(zhǔn)確地評(píng)估目標(biāo)蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用。陰性對(duì)照組設(shè)計(jì)建議:1. 無(wú)抗體對(duì)照組:在免疫沉淀步驟中不加入特異性抗體,以檢測(cè)是否存在非特異性結(jié)合。如果在此條件下仍然檢測(cè)到目標(biāo)蛋白,則可能是非特異性結(jié)合,需要在分析時(shí)予以排除。2. 無(wú)關(guān)抗體對(duì)照組:使用與誘餌蛋白和靶蛋白均無(wú)關(guān)的抗體進(jìn)行免疫沉淀,以驗(yàn)證特異性抗體的作用。如果在此條件下未檢測(cè)到目標(biāo)蛋白,則可以增強(qiáng)對(duì)特異性抗體所檢測(cè)到的相互作用的信心。Co-IP外源檢測(cè)需注意蛋白互作真實(shí)性、表達(dá)系統(tǒng)與標(biāo)簽選擇、規(guī)范操作及結(jié)果驗(yàn)證,確保準(zhǔn)確性!河北相互作用蛋白檢測(cè)CoIP Western Blot檢測(cè)
CoIP-Mass和CoIP-WB檢測(cè)要點(diǎn):
抗體關(guān)鍵質(zhì)控:抗體特異性和親和效價(jià)要求高,盡量采用標(biāo)簽抗體或經(jīng)過(guò)CoIP效果驗(yàn)證的抗體??贵w質(zhì)量參差不齊(WB能檢測(cè)到預(yù)期條帶不到1/2,能檢測(cè)到良好結(jié)果的不到1/4)和存在非特異性結(jié)合(幾乎所有的抗體都存在非特異結(jié)合,部分非特異結(jié)合條帶遠(yuǎn)大于目的條帶),CoIP-MS需做WB和CoIP-WB質(zhì)控。初次和檢測(cè)CoIP都需要做WB質(zhì)控。正式CoIP可同時(shí)增加考染/銀染質(zhì)控??贵w可參考數(shù)據(jù)庫(kù)(ValidatedAntibodyDB,)。 河南免疫共沉淀CoIP聯(lián)合質(zhì)譜檢測(cè)IP-WB技術(shù)缺點(diǎn):抗體特異性要求高,低豐度蛋白檢測(cè)難,操作復(fù)雜,結(jié)果解讀難,但可通過(guò)優(yōu)化減少影響!
Co-IP技術(shù)雖然廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)相互作用的研究,但也存在一些局限性。首先,Co-IP技術(shù)的結(jié)果可能受到抗體特異性的影響。如果抗體與目標(biāo)蛋白的結(jié)合不夠特異,可能導(dǎo)致非特異性蛋白的共沉淀,增加背景噪聲。其次,Co-IP技術(shù)可能無(wú)法檢測(cè)到低豐度的蛋白質(zhì)相互作用,因?yàn)榈拓S度蛋白在細(xì)胞裂解液中的濃度較低,難以形成穩(wěn)定的復(fù)合物。此外,Co-IP技術(shù)還受到樣品制備和實(shí)驗(yàn)條件的影響。樣品中的雜質(zhì)、降解產(chǎn)物或酶活性等因素都可能干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果。另外,Co-IP技術(shù)只能檢測(cè)到在細(xì)胞裂解時(shí)存在的蛋白質(zhì)相互作用,對(duì)于瞬時(shí)或動(dòng)態(tài)的相互作用可能無(wú)法準(zhǔn)確捕捉。因此,在使用Co-IP技術(shù)時(shí),需要注意這些局限性,并結(jié)合其他實(shí)驗(yàn)方法和驗(yàn)證手段,以獲得更準(zhǔn)確的蛋白質(zhì)相互作用結(jié)果。
CoIP-Mass和CoIP-WB檢測(cè)要點(diǎn):
試驗(yàn)設(shè)計(jì):盡量進(jìn)行試驗(yàn)組別設(shè)計(jì)和進(jìn)行生物學(xué)重復(fù)檢測(cè),提高后續(xù)驗(yàn)證的陽(yáng)性率。常規(guī)過(guò)表達(dá)單組(AbIPvsIgGIP);動(dòng)態(tài)互作組學(xué)(實(shí)驗(yàn)組vs對(duì)照組vsIg組)。根據(jù)目的設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)纳飳W(xué)重復(fù)。如果后續(xù)以CoIP-Mass數(shù)據(jù)進(jìn)行互作組標(biāo)準(zhǔn)分析,則需要3-4組生物學(xué)重復(fù);如果后續(xù)以尋找關(guān)鍵互作蛋白,進(jìn)行機(jī)制深入研究,則建議1-2次生物學(xué)重復(fù)。經(jīng)驗(yàn)顯示單次重復(fù)假陽(yáng)性率90%。
蛋白表達(dá)和細(xì)胞量:細(xì)胞用量要求大(2-10e7細(xì)胞量),建議不少于5e7(金標(biāo)準(zhǔn):320g離心細(xì)胞量50μl,保障項(xiàng)目用量)。低表達(dá)蛋白,建議使用過(guò)表達(dá)組進(jìn)行檢測(cè)。蛋白表達(dá)可根據(jù)WB結(jié)果或初步根據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)判定(ProteomicsDB;HumanProteinAtlas)。 IP-Mass(免疫沉淀-質(zhì)譜)技術(shù)應(yīng)用場(chǎng)景。
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是一種在生物藥物領(lǐng)域廣泛應(yīng)用的技術(shù),主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用。該技術(shù)通過(guò)利用特異性抗體將目標(biāo)蛋白與其相互作用的蛋白一同沉淀下來(lái),從而揭示蛋白質(zhì)間的相互作用關(guān)系。在藥物研發(fā)中,Co-IP技術(shù)被用于靶標(biāo)識(shí)別和驗(yàn)證,幫助研究人員鑒定藥物與特定蛋白質(zhì)相互作用的分子機(jī)制,驗(yàn)證潛在藥物靶點(diǎn),并評(píng)估候選藥物分子的有效性和選擇性。此外,該技術(shù)也在疾病發(fā)生機(jī)制和生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)中發(fā)揮著重要作用,能夠鑒定與疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),識(shí)別新的藥物靶點(diǎn),并發(fā)現(xiàn)潛在的生物標(biāo)志物用于早期診斷和疾病監(jiān)測(cè)。免疫共沉淀存在檢測(cè)局限、相互作用不確定、靈敏度不足等缺陷。天津CoIP-Mass檢測(cè)
Co-IP揭示蛋白互作,驗(yàn)證復(fù)合物形成,探究信號(hào)通路,助力蛋白研究!河北相互作用蛋白檢測(cè)CoIP Western Blot檢測(cè)
Co-IP實(shí)驗(yàn)的外源檢測(cè)注意事項(xiàng)主要包括以下幾點(diǎn):首先,要確保外源表達(dá)的蛋白與內(nèi)源蛋白存在真實(shí)的相互作用,這需要對(duì)實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮退芯康牡鞍子猩钊氲牧私狻F浯?,選擇合適的表達(dá)系統(tǒng)和標(biāo)簽。不同的表達(dá)系統(tǒng)和標(biāo)簽可能會(huì)影響蛋白的表達(dá)量、穩(wěn)定性以及免疫共沉淀的效果。因此,在選擇時(shí)應(yīng)考慮蛋白的特性以及實(shí)驗(yàn)的需求。此外,實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的操作要規(guī)范。細(xì)胞裂解、抗體孵育、洗滌等步驟都需要嚴(yán)格按照操作指南進(jìn)行,以避免非特異性結(jié)合和背景噪聲的產(chǎn)生。另外,注意結(jié)果的驗(yàn)證和解釋。雖然外源檢測(cè)具有較高的靈敏度和可控性,但結(jié)果仍需要與其他實(shí)驗(yàn)方法如Western Blot、質(zhì)譜分析等相結(jié)合,進(jìn)行相互驗(yàn)證。同時(shí),對(duì)結(jié)果的解釋也需要謹(jǐn)慎,避免過(guò)度解讀或誤讀。綜上所述,進(jìn)行Co-IP實(shí)驗(yàn)的外源檢測(cè)時(shí),需要注意蛋白的相互作用真實(shí)性、表達(dá)系統(tǒng)和標(biāo)簽的選擇、實(shí)驗(yàn)操作的規(guī)范性以及結(jié)果的驗(yàn)證和解釋等方面。河北相互作用蛋白檢測(cè)CoIP Western Blot檢測(cè)