免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)的優(yōu)點(diǎn)主要包括:高度特異性:免疫共沉淀利用高親和力的抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合,能夠高度特異性地識(shí)別目標(biāo)蛋白質(zhì),從而減少假陽(yáng)性和假陰性的誤差,提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性??煽匦詮?qiáng):免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)的反應(yīng)條件相對(duì)穩(wěn)定,實(shí)驗(yàn)長(zhǎng)度、溫度、蛋白濃度、抗體濃度等可被有效控制,這樣可以有效地減少誤差和變異性。可用于研究蛋白相互作用:免疫共沉淀不僅可以檢測(cè)單個(gè)蛋白質(zhì),還可以研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,從而揭示蛋白質(zhì)的組裝和功能。這對(duì)于理解細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、代謝途徑等復(fù)雜生物過(guò)程具有重要意義。天然狀態(tài):通過(guò)免疫共沉淀得到的蛋白質(zhì)相互作用是在自然狀態(tài)下進(jìn)行的,避免了人為影響,可以分離得到天然狀態(tài)下相互作用的蛋白復(fù)合物。這對(duì)于理解蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的真實(shí)功能和相互作用模式具有重要意義。可逆性:免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)是可逆的,在沉淀后的蛋白質(zhì)可以被再次溶解和分離進(jìn)行下一步操作或其他科學(xué)研究。操作簡(jiǎn)便:免疫共沉淀的實(shí)驗(yàn)流程相對(duì)簡(jiǎn)便,不需要事先制備大規(guī)模蛋白表達(dá)文庫(kù),使得這種方法在實(shí)驗(yàn)室中易于實(shí)施。Co-IP和ChIP實(shí)驗(yàn)對(duì)象有什么區(qū)別。上海免疫沉淀CoIP-Mass檢測(cè)
CoIP-Mass和CoIP-WB檢測(cè)要點(diǎn):
互作蛋白篩選和驗(yàn)證:數(shù)據(jù)分析以非標(biāo)定量信號(hào)強(qiáng)度(LFQintensity和FC>10)作為強(qiáng)陽(yáng)篩選,以文獻(xiàn)查閱,功能匹配,批量CoIP-WB驗(yàn)證,提高驗(yàn)證成功率。理想CoIP-MS結(jié)果的蛋白定量都到超過(guò)1000種蛋白。其中絕大部分蛋白為非特異結(jié)合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信號(hào)強(qiáng)度和差異倍數(shù)作為參考(相對(duì)強(qiáng)信號(hào)和差異),分析實(shí)驗(yàn)組中明顯定量較高且差異較大的蛋白,作為重要候選蛋白。同時(shí)對(duì)重要候選蛋白進(jìn)行STRING互作分析,文獻(xiàn)分析,目的蛋白功能匹配分析,選擇Top的4-5個(gè)蛋白進(jìn)行CoIP-WB驗(yàn)證,提高CoIP-WB成功率。 山西CoIP-MassCo-IP實(shí)驗(yàn)要點(diǎn):樣品新鮮、抗體特異、偶聯(lián)充分、洗滌徹底,確保結(jié)果準(zhǔn)確可靠!
在CoIP(免疫共沉淀)實(shí)驗(yàn)中,對(duì)照組的設(shè)計(jì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果尤為重要,陽(yáng)性對(duì)照組設(shè)計(jì)建議如下:1. 已知相互作用蛋白對(duì)照組:如果可能的話,使用已知與誘餌蛋白相互作用的蛋白作為陽(yáng)性對(duì)照。這可以驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)條件的可行性,以及抗體和實(shí)驗(yàn)方法的可靠性。2. 設(shè)置過(guò)量誘餌蛋白對(duì)照組:通過(guò)加入過(guò)量的誘餌蛋白,可以驗(yàn)證靶蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用是否具有飽和性。如果加入過(guò)量誘餌蛋白后,靶蛋白的結(jié)合減少或消失,則表明相互作用具有飽和性。
在CoIP(免疫共沉淀)實(shí)驗(yàn)中,技術(shù)重復(fù)和生物重復(fù)設(shè)計(jì)建議如下:進(jìn)行多次技術(shù)重復(fù)(在同一實(shí)驗(yàn)條件下使用不同的樣品或樣品批次)和生物重復(fù)(使用來(lái)自不同生物或不同實(shí)驗(yàn)條件的樣品),以評(píng)估結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性。在設(shè)置對(duì)照組時(shí),還需要注意以下幾點(diǎn):對(duì)照組的設(shè)置應(yīng)遵循科學(xué)原理,并充分考慮實(shí)驗(yàn)的具體需求和目標(biāo)。確保對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組在實(shí)驗(yàn)條件和操作步驟上保持一致,以便進(jìn)行準(zhǔn)確的比較。在分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果時(shí),應(yīng)綜合考慮對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組的數(shù)據(jù),以得出更準(zhǔn)確的結(jié)論??傊贑oIP實(shí)驗(yàn)中,通過(guò)精心設(shè)計(jì)和執(zhí)行對(duì)照組實(shí)驗(yàn),可以提高實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可靠性,從而更準(zhǔn)確地評(píng)估目標(biāo)蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用。CoIP實(shí)驗(yàn)需多次重復(fù),科學(xué)設(shè)對(duì)照組,確保結(jié)果準(zhǔn)確可靠!
CoIP-Mass和CoIP-WB檢測(cè)要點(diǎn):
試驗(yàn)設(shè)計(jì):盡量進(jìn)行試驗(yàn)組別設(shè)計(jì)和進(jìn)行生物學(xué)重復(fù)檢測(cè),提高后續(xù)驗(yàn)證的陽(yáng)性率。常規(guī)過(guò)表達(dá)單組(AbIPvsIgGIP);動(dòng)態(tài)互作組學(xué)(實(shí)驗(yàn)組vs對(duì)照組vsIg組)。根據(jù)目的設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)纳飳W(xué)重復(fù)。如果后續(xù)以CoIP-Mass數(shù)據(jù)進(jìn)行互作組標(biāo)準(zhǔn)分析,則需要3-4組生物學(xué)重復(fù);如果后續(xù)以尋找關(guān)鍵互作蛋白,進(jìn)行機(jī)制深入研究,則建議1-2次生物學(xué)重復(fù)。經(jīng)驗(yàn)顯示單次重復(fù)假陽(yáng)性率90%。
蛋白表達(dá)和細(xì)胞量:細(xì)胞用量要求大(2-10e7細(xì)胞量),建議不少于5e7(金標(biāo)準(zhǔn):320g離心細(xì)胞量50μl,保障項(xiàng)目用量)。低表達(dá)蛋白,建議使用過(guò)表達(dá)組進(jìn)行檢測(cè)。蛋白表達(dá)可根據(jù)WB結(jié)果或初步根據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)判定(ProteomicsDB;HumanProteinAtlas)。 Co-IP和ChIP基本原理方面的區(qū)別有什么。四川互作機(jī)制CoIP
Co-IP技術(shù)揭示蛋白互作,助力藥物研發(fā)與疾病機(jī)制探索!上海免疫沉淀CoIP-Mass檢測(cè)
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是一種經(jīng)典的生物學(xué)技術(shù),主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用。它以其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)在蛋白質(zhì)組學(xué)、生物化學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)等領(lǐng)域中得到了大范圍應(yīng)用。Co-IP的主要優(yōu)點(diǎn)包括。直接性:Co-IP能夠直接檢測(cè)蛋白質(zhì)之間的相互作用,從而提供關(guān)于蛋白質(zhì)功能和調(diào)控機(jī)制的直接證據(jù)。特異性:通過(guò)使用特異性抗體,Co-IP能夠精確地捕獲目標(biāo)蛋白及其相互作用伙伴,減少非特異性干擾。靈敏度:Co-IP能夠檢測(cè)到低豐度的蛋白質(zhì)相互作用,這對(duì)于研究微弱或瞬時(shí)的蛋白互作具有重要意義。適用性廣:該技術(shù)適用于多種樣本類型,包括細(xì)胞裂解液、組織提取物和純化后的蛋白質(zhì)復(fù)合物。兼容性強(qiáng):Co-IP技術(shù)可以與其他技術(shù)相結(jié)合,如質(zhì)譜分析,從而提供更詳盡的互作網(wǎng)絡(luò)信息。綜上所述,Co-IP技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)在于其直接性、特異性、靈敏度、大范圍的適用性和與其他技術(shù)的兼容性,這些優(yōu)點(diǎn)使其成為研究蛋白質(zhì)相互作用的有力工具。上海免疫沉淀CoIP-Mass檢測(cè)