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廣州微量RT-PCR檢測技術(shù)原理

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-03-04

所謂real-timeQ-PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因,利用熒光信號累積實(shí)時(shí)監(jiān)測整個(gè)PCR進(jìn)程,之后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。在real-time技術(shù)的發(fā)展過程中,兩個(gè)重要的發(fā)現(xiàn)起著關(guān)鍵的作用:(1)TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的發(fā)現(xiàn),它能降解特異性熒光記探針,因此使得間接的檢測PCR產(chǎn)物成為可能。(2)此后熒光雙標(biāo)記探針的運(yùn)用使在一密閉的反應(yīng)管中能實(shí)時(shí)地監(jiān)測反應(yīng)全過程。這兩個(gè)發(fā)現(xiàn)的結(jié)合以及相應(yīng)的儀器和試劑的商品化發(fā)展導(dǎo)致real-timeQ-PCR方法在研究工作中的運(yùn)用。實(shí)時(shí)熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法。廣州微量RT-PCR檢測技術(shù)原理

廣州微量RT-PCR檢測技術(shù)原理,Real-timePCR技術(shù)服務(wù)

Real-time PCR:Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知樣品進(jìn)行定量測定,因此,實(shí)時(shí)熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。外標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量方法相比內(nèi)標(biāo)法是一種準(zhǔn)確的、值得信賴的科學(xué)方法。利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實(shí)時(shí)熒光定量PCR是迄今為止定量較準(zhǔn)確,重現(xiàn)性較好的定量方法,已得到全世界的公認(rèn),普遍用于基因表達(dá)研究、轉(zhuǎn)基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領(lǐng)域。實(shí)時(shí)熒光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有兩種策略,相對定量和定量。廣州微量RT-PCR檢測技術(shù)原理聚合酶鏈反應(yīng)為這些技術(shù)提供了大量的純DNA,有時(shí)是單鏈的。

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Real-time PCR原理:基于探針的化學(xué)法,Real-time PCR應(yīng)用一個(gè)或多個(gè)熒光標(biāo)記的寡核苷酸探針檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;依賴熒光能量共振傳遞(FRET)檢測特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,單單檢測特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,DNA及RNA定量;基因表達(dá)驗(yàn)證;等位基因鑒別;SNP分型;病原體和病毒檢測;多重PCR,探針和目標(biāo)片段的特異性結(jié)合產(chǎn)生熒光信號,因此減少了背景熒光和假陽性;探針可標(biāo)記不同波長的熒光基團(tuán),用于多重PCR反應(yīng)。對于不同的靶序列需要合成不同的探針,原料成本較高。

Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng):每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不但操作煩瑣,而且價(jià)格昂貴,制約了PCR技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現(xiàn)對于PCR的應(yīng)用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個(gè)循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡捷、同時(shí)也降低了成本,PCR技術(shù)得以大量應(yīng)用,并逐步應(yīng)用于臨床。多重連接依賴探針擴(kuò)增允許用單個(gè)引物對擴(kuò)增多個(gè)靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。引物的設(shè)計(jì)注意事項(xiàng):1,注意引物設(shè)計(jì)好后的產(chǎn)物長度。Real-time PCR的較佳產(chǎn)物長度在150-250kb左右(書上說這樣可以增加熒光的敏感度,減少實(shí)驗(yàn)誤差,但是我對這個(gè)說法持懷疑態(tài)度。產(chǎn)物長度越大,SYBR嵌入的越多,這樣才能夠保證之后的熒光值比較可信)。2,不同的管家基因擴(kuò)增效率不同。所以在做整個(gè)實(shí)驗(yàn)之前應(yīng)該做一次檢測擴(kuò)增效率的實(shí)驗(yàn)。如果擴(kuò)增效率相差太大,就不能使用delt,deltCt法來比較基因表達(dá)量的高低。PCR反應(yīng)的很大特點(diǎn)是具有較大擴(kuò)增能力與極高的靈敏性。

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聚合酶鏈反應(yīng)注意事項(xiàng):在實(shí)驗(yàn)過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴(kuò)增,必須設(shè)陰性對照;內(nèi)參的設(shè)定主要為了用于靶RNA的定量。常用的內(nèi)參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴(kuò)增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進(jìn)入平臺期,出現(xiàn)平臺效應(yīng)與所擴(kuò)增的目的基因的長度、序列、二級結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān)。故對于每一個(gè)目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺效應(yīng)的循環(huán)數(shù),均應(yīng)通過單獨(dú)實(shí)驗(yàn)來確定;防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA;在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。聚合酶鏈反應(yīng)可以選擇這些突變來理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質(zhì)功能。Real-time PCR提高實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性。徐州骨頭熒光定量PCR服務(wù)

實(shí)時(shí)熒光定量PCR通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。廣州微量RT-PCR檢測技術(shù)原理

Real-time PCR螢光染料摻入法:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR螢光染料,SYBR螢光染料特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后,發(fā)射螢光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何螢光信號,從而保證螢光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。此方法適用于:1、靈敏度高:使用SYBR可使螢光效果增強(qiáng)到1000倍以上。2、通用性好,不需要設(shè)計(jì)探針,方法簡便,省時(shí),價(jià)格低廉。3、通用型方法,在國內(nèi)外科研中普遍使用。4、高通量大規(guī)模的定量PCR檢測。5、專一性要求不高的定量PCR檢測。廣州微量RT-PCR檢測技術(shù)原理

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