Real-time PCR原理:Real-time PCR主要指在PCR反應體系中加入熒光物質,然后通過熒光化學物質監(jiān)測每次PCR反應循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法,之后通過內參法或外參法對待測樣品中的特定DNA序列(目的基因)進行定量分析的方法。實驗過程中,這些熒光物質可以在激發(fā)光的作用下釋放出一定波長的發(fā)射光,定量用PCR儀通過對這些發(fā)射光進行實時監(jiān)測,較終可以描繪出整個PCR的反應過程,這就是Real-time PCR的原理。Real-time PCR鏈式反應:DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,根據(jù)堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子拷貝。在實驗中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈,當溫度降低后又可以復性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復性,加入設計引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復制。但是,DNA聚合酶在高溫時會失活。聚合酶鏈反應可以選擇這些突變來理解蛋白質是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質功能。珠海分子生物學PCR檢測技術設計公司
Real-time PCR:對擴增技術的修飾可以從完全未知的基因組中提取片段,或者可以產(chǎn)生感興趣區(qū)域的單鏈。聚合酶鏈反應有許多應用于傳統(tǒng)的DNA克隆。它可以從更大的基因組中提取片段以插入載體,這可能只有少量可用。使用一組“載體引物”,它還可以分析或提取已經(jīng)插入載體的片段。聚合酶鏈反應方案的一些改變可以產(chǎn)生突變(通用的或定點的)插入片段。聚合酶鏈反應可以選擇這些突變來理解蛋白質是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質功能。珠海分子生物學PCR檢測技術設計公司Real-time PCR探針法普遍用于人類傳染病的診斷和病原定量。
Real-time PCR實驗常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環(huán)結合使蛋白質變性,從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍:目前被認為是較有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結構使核酸從蛋白中解離出來,又對RNA酶有強烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復合物:由氧化釩離子和核苷形成的復合物,它和RNA酶結合形成過渡態(tài)類物質,幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑,可以和多種RNA酶結合,使其失活。5.其它:SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定抑制作用。
聚合酶鏈式反應:因為PCR擴增了目的DNA區(qū)域,所以PCR可以用于分析極少量的樣品。這對于法醫(yī)檢定法,當時只有微量的DNA可作為證據(jù)。聚合酶鏈反應也可用于分析古代DNA那已經(jīng)有數(shù)萬年的歷史了。這些基于聚合酶鏈反應的技術已經(jīng)成功地應用于動物身上,例如四萬年前猛犸,以及人類DNA,定量聚合酶鏈反應或者實時聚合酶鏈反應不要與逆轉錄-聚合酶鏈反應方法混淆)允許估計樣品中存在的給定序列的量——這種技術通常用于定量確定基因表達的水平。定量PCR是一種已建立的DNA定量工具,用于測量每輪PCR擴增后DNA產(chǎn)物的積累。聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。實時熒光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一種在DNA擴增反應中。
實時定量PCR的系統(tǒng)構成及工作原理:熒光定量檢測系統(tǒng)由實時熒光定量PCR儀,實時熒光定量試劑,通用電腦,自動分析軟件等構成。設備由熒光定量系統(tǒng)和計算機組成,用來監(jiān)測循環(huán)過程的熒光。與實時設備相連的計算機收集熒光數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)通過開發(fā)的實時分析軟件以圖表的形式顯示。原始數(shù)據(jù)被繪制成熒光強度相對于循環(huán)數(shù)的圖表。原始數(shù)據(jù)收集后可以開始分析。實時設備的軟件能使收集到的數(shù)據(jù)進行正?;幚韥韽浹a背景熒光的差異。正?;罂梢栽O定域值水平,這就是分析熒光數(shù)據(jù)的水平。Real-time PCR反是一項利用DNA雙鏈復制的原理。南京骨頭熒光PCR哪家好
擴增后用內切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段。珠海分子生物學PCR檢測技術設計公司
Real-time PCR:基線(baseline):通常是3-15個循環(huán)的熒光信號,同一次反應中針對不同的基因需單獨設置基線。閾值(threshold):自動設置是3-15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍。手動設置:置于指數(shù)擴增期,剛好可以清楚地看到熒光信號明顯增強。同一次反應中針對不同的基因可單獨設置閾值,但對于同一個基因擴增一定要用同一個閾值。Ct值:與起始濃度的對數(shù)成線性關系,分析定量時候一般取Ct:15-35.太大或者太小都會導致定量的不準確。相對定量:通過與內參基因Ct值之間的相差來計算基因之間的表達差異,一般是2-△△Ct?;蛘呤强紤]擴增效率的Pfaffl法。珠海分子生物學PCR檢測技術設計公司
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