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來源: 發(fā)布時間:2023-07-24

引物的設(shè)計注意事項:1,引物設(shè)計要跨內(nèi)含子,不能在一個外顯子上(我們的實驗是以cDNA為模板來擴(kuò)增的,如果有DNA污染的話,因為DNA上含有分子量很大的內(nèi)含子,不可能完成擴(kuò)增。這對我們消除整個實驗的誤差起很大的作用)。2,引物設(shè)計的時候要盡可能設(shè)計在同一退火溫度,方便于以后同時擴(kuò)增很多不同的基因片段。但是如果相差比較大,就得分開做,浪費(fèi)模板,浪費(fèi)管家基因,所以每個實驗室設(shè)計引物的時候要盡可能一致,這樣就不用每次查退火溫度,且對整個實驗有利。Real-time PCR探針法普遍用于人類傳染病的診斷和病原定量。廣州組織熒光定量PCR網(wǎng)站

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Real-time PCR-傳統(tǒng)定量PCR:1)內(nèi)參照法:在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴(kuò)增的同時,內(nèi)標(biāo)也被擴(kuò)增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴(kuò)增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強(qiáng)度,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。2)競爭法:選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴(kuò)增(其中一個引物為熒光標(biāo)記)。廣州組織熒光定量PCR網(wǎng)站擴(kuò)增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段。

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Real-time PCR反應(yīng):多重連接依賴探針擴(kuò)增(MLPA):允許用單個引物對擴(kuò)增多個靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應(yīng):由單個PCR混合物中的多個引物組組成,以產(chǎn)生對不同DNA序列特異的不同大小的擴(kuò)增子。通過同時靶向多個基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時間來執(zhí)行。每個引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個反應(yīng)中正確工作,并符合擴(kuò)增子尺寸。也就是說,當(dāng)通過凝膠電泳可視化時,它們的堿基對長度應(yīng)該足夠不同以形成不同的條帶。

Real-time PCR式反應(yīng)準(zhǔn)備:10×擴(kuò)增緩沖液、4種dNTP混合物(終濃度)、引物(終濃度)、模板DNA、TaqDNA聚合酶、Mg2+(終濃度)、補(bǔ)加雙蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、TaqDNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實驗調(diào)整,以上表格只提供大致參考值。PCR反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設(shè)計方法,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同。實時設(shè)備的軟件能使收集到的數(shù)據(jù)進(jìn)行正?;幚韥韽浹a(bǔ)背景熒光的差異。

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Real-timePCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過高會加快反應(yīng)速度,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯誤率達(dá)2*E-4個核苷酸,一個30個循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯誤率。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15~25時退火溫度。在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。杭州細(xì)胞熒光定量PCR研究方案

聚合酶鏈反應(yīng)為這些技術(shù)提供了大量的純DNA,有時是單鏈的。廣州組織熒光定量PCR網(wǎng)站

引物的設(shè)計對于這個實驗至關(guān)重要,因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應(yīng)的對引物設(shè)計的要求就很高。普通的要求規(guī)則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進(jìn)去,結(jié)果導(dǎo)致實驗結(jié)果的誤差很大,重復(fù)性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,引物同源性不高,只要兩條產(chǎn)物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區(qū)分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結(jié)果誤差很大,不可信)。廣州組織熒光定量PCR網(wǎng)站

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