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寧波分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)研究方案

來源: 發(fā)布時間:2021-12-04

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):三步:變性:模板DNA加熱變性;復(fù)性,引物與它的靶序列發(fā)生退火,引物DNA量多,使引物和模板在局部形成雜交鏈;延伸,4種dNTP 與 Mg2+ 存在的條件下,DNA合成酶催化以引物為起始點(diǎn),按5'-3'方向進(jìn)行延伸。上面三步為一個循環(huán),可使拷貝數(shù)到達(dá)2*E-6-2*E-7。PCR產(chǎn)物一段雙鏈DNA,是由它的末端引物的5’端決定的。首輪擴(kuò)增,其產(chǎn)物是大小不均一的DNA分子。長度應(yīng)大于兩引物之間的長度。在第二個循環(huán)中,由于5'固定,其產(chǎn)物長度就由等于兩引物之間的長度。所以幾十個循環(huán)后就會產(chǎn)生大量的兩引物之間序列。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)可以將缺失、插入或點(diǎn)突變引入DNA序列。寧波分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)研究方案

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聚合酶鏈反應(yīng)有許多優(yōu)點(diǎn)。它很容易理解和使用,并迅速產(chǎn)生結(jié)果。這項(xiàng)技術(shù)非常敏感,有可能產(chǎn)生數(shù)百萬到數(shù)十億份特定產(chǎn)品的拷貝,用于測序、克隆和分析。qRT-PCR具有與PCR相同的優(yōu)點(diǎn),同時還具有定量合成產(chǎn)物的優(yōu)點(diǎn)。因此,它可以用于分析病癥、微生物或其他疾病狀態(tài)中基因表達(dá)水平的變化。聚合酶鏈反應(yīng)是一種非常強(qiáng)大和實(shí)用的研究工具。許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應(yīng)得到解決。這項(xiàng)技術(shù)可以幫助我們識別與已知病毒相關(guān)的未知病毒序列,從而讓我們更好地了解疾病本身。如果該過程可以進(jìn)一步簡化,并且可以開發(fā)靈敏的非輻射檢測系統(tǒng),PCR將在未來幾年在臨床實(shí)驗(yàn)室中占據(jù)明顯地位。常州細(xì)胞定量PCR哪家好像所有酶一樣,DNA聚合酶也容易出錯,這反過來會導(dǎo)致產(chǎn)生的PCR片段發(fā)生突變。

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現(xiàn)在有些PCR因?yàn)閿U(kuò)增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進(jìn)行,以減少一次升降溫過程,提高了反應(yīng)速度。檢測:PCR反應(yīng)擴(kuò)增出了高的拷貝數(shù),下一步檢測就成了關(guān)鍵。熒光素(溴化乙錠,EB)染色凝膠電泳是很常用的檢測手段。電泳法檢測特異性是不太高的,因此引物兩聚體等非特異性的雜交體很容易引起誤判。但因?yàn)槠浜喗菀仔?,成為了主流檢測方法。近年來以熒光探針為的檢測方法,有逐漸取代電泳法的趨勢。

PCR的反應(yīng)條件:Tm=4(G+c)+(A+T),一般在45~55度,溫度低容易退火但特異性低;溫度高,不容易退火但特異性高。退火時間30秒。延伸溫度一般在70~75度這時TaqDNA聚合酶活性很高(150個/S),當(dāng)引物在16個堿基以下時可采用緩慢升高溫度到70~75度的方法,使在低溫下就開始合成。一般<1KB時間1分鐘即可。當(dāng)〈1KB時在較后的循環(huán)中延長擴(kuò)增時間。循環(huán)次數(shù)25~30次。無產(chǎn)物時:取10ul擴(kuò)增混合液作模板在進(jìn)行PCR擴(kuò)增;增加TaqDNA聚合酶濃度;增加循環(huán)次數(shù);降低退火溫度;加靶DNA量。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不要超過70%。

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聚合酶鏈反應(yīng)允許快速生產(chǎn)短DN段,即使已知的引物序列不超過兩個。聚合酶鏈反應(yīng)的這種能力增強(qiáng)了許多方法,例如生成雜交 探針用于 Southern 或northern blot 雜交。聚合酶鏈反應(yīng)為這些技術(shù)提供了大量的純DNA,有時是單鏈的,甚至可以從非常少量的起始材料中進(jìn)行分析。脫氧核糖核酸測序的任務(wù)也可以通過聚合酶鏈反應(yīng)來輔助完成。已知的DN段可以很容易地從患有遺傳疾病突變的患者體內(nèi)產(chǎn)生。對擴(kuò)增技術(shù)的修飾可以從完全未知的基因組中提取片段,或者可以產(chǎn)生感興趣區(qū)域的單鏈。聚合酶鏈反應(yīng)有許多應(yīng)用于傳統(tǒng)的 DNA克隆。它可以從更大的基因組中提取片段以插入載體,這可能只有少量可用。使用一組“載體引物”,它還可以分析或提取已經(jīng)插入載體的片段。聚合酶鏈反應(yīng)方案的一些改變可以產(chǎn)生突變(通用的或定點(diǎn)的)插入片段。逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)):用于從RNA中擴(kuò)增DNA。深圳實(shí)時熒光PCR

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種用于放大擴(kuò)增特定的DN段的分子生物學(xué)技術(shù)。寧波分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)研究方案

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。其中Taq擴(kuò)增效率高但易發(fā)生錯配。Pfu擴(kuò)增效率弱但有糾錯功能。所以實(shí)際使用時根據(jù)需要必須做不同的選擇。模板即擴(kuò)增用的DNA,可以是任何來源,但有兩個原則,純度必須較高,第二濃度不能太高以免抑制。緩沖液的成分很為復(fù)雜,除水外一般包括四個有效成分:緩沖體系,一般使用HEPES或MOPS緩沖體系;一價陽離子,一般采用鉀離子,但在特殊情況下也可使用銨根離子;二價陽離子,即鎂離子,根據(jù)反應(yīng)體系確定,除特殊情況外不需調(diào)整;輔助成分,常見的有DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。寧波分子生物學(xué)PCR檢測技術(shù)研究方案